Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G144900.1
Synonym Sb06g022360
Functional annotation G-patch domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PLZ8
Pfam PF01585 PF07842
Panther DB PTHR23329 PTHR23329:SF11
NCBI CDD KOG2184; Tuftelin-interacting protein TIP39, contains G-patch domain
KEGG Orthology K13103; tuftelin-interacting protein 11
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated GO:0005634nucleus GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G42330 : GC-rich sequence DNA-binding factor-like protein with Tuftelin interacting domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g42140.1 : G-patch domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056493 , Zm00025a056492
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G345100 expressed protein -
2 Sobic.003G002800 expressed protein -
3 Sobic.010G025200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G333150 - -
5 Sobic.002G260500 - -
6 Sobic.009G142600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cysteine-rich receptor-like protein kinase 6 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.009G160900 expressed protein -
8 Sobic.005G061300 - -
9 Sobic.003G210701 - -
10 Sobic.004G013400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed K01802: peptidylprolyl isomerase
11 Sobic.008G045900 - -
12 Sobic.001G033701 - -
13 Sobic.004G293600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G114000 potassium channel protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G173800 - -
16 Sobic.001G001000 expressed protein -
17 Sobic.007G087500 hypothetical protein -
18 Sobic.008G053700 - -
19 Sobic.008G008601 - -
20 Sobic.010G091750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic006G144900--Sobic002G345100 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic006G144900--Sobic003G002800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic006G144900--Sobic010G025200 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic006G144900--Sobic003G333150 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic006G144900--Sobic002G260500 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic006G144900--Sobic009G142600 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic006G144900--Sobic009G160900 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic006G144900--Sobic005G061300 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic006G144900--Sobic003G210701 Sobic002G046400 Sobic002G046400 Sobic002G345100--Sobic002G046400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic002G345100--Sobic008G045900 Sobic002G345100--Sobic009G142600 Sobic002G345100--Sobic003G210701 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic002G345100--Sobic005G025500 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic002G345100--Sobic002G084100 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic002G345100--Sobic005G014600 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic002G345100--Sobic001G358101 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic002G345100--Sobic004G162800 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic003G002800--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic003G002800--Sobic008G053700 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic003G002800--Sobic004G173800 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic003G002800--Sobic007G087500 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic003G002800--Sobic001G152240 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic003G002800--Sobic003G046000 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic003G002800--Sobic002G103400 Sobic003G002800--Sobic005G025500 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic003G002800--Sobic001G033701 Sobic010G025200--Sobic006G144900 Sobic010G025200--Sobic003G333150 Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic010G025200--Sobic005G114000 Sobic010G025200--Sobic005G061300 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic010G025200--Sobic003G387400 Sobic010G025200--Sobic003G002800 Sobic010G025200--Sobic002G260500 Sobic010G025200--Sobic009G160900 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic010G025200--Sobic005G005100 Sobic003G333150--Sobic005G061300 Sobic003G333150--Sobic006G144900 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic003G333150--Sobic008G045300 Sobic003G333150--Sobic002G345100 Sobic003G333150--Sobic005G114000 Sobic003G333150--Sobic003G002800 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic003G333150--Sobic004G293600 Sobic003G333150--Sobic010G025200 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic003G333150--Sobic009G203600 Sobic002G260500--Sobic004G173800 Sobic002G260500--Sobic008G053700 Sobic002G260500--Sobic006G004700 Sobic002G260500--Sobic003G046000 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic002G260500--Sobic008G069901 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic002G260500--Sobic006G076700 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic002G260500--Sobic004G184900 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic002G260500--Sobic006G258200 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic002G260500--Sobic001G160300 Sobic009G142600--Sobic008G045900 Sobic009G142600--Sobic008G053700 Sobic009G142600--Sobic006G258200 Sobic009G142600--Sobic001G160300 Sobic009G142600--Sobic008G069901 Sobic009G142600--Sobic003G046000 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic009G142600--Sobic009G113300 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic009G142600--Sobic010G081500 Sobic009G142600--Sobic004G184900 Sobic009G160900--Sobic002G260500 Sobic009G160900--Sobic004G173800 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic009G160900--Sobic004G013400 Sobic009G160900--Sobic006G004700 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic009G160900--Sobic002G063500 Sobic009G160900--Sobic008G053700 Sobic009G160900--Sobic007G087500 Sobic009G160900--Sobic008G069901 Sobic009G160900--Sobic003G046000 Sobic005G061300--Sobic003G333150 Sobic005G061300--Sobic005G114000 Sobic005G061300--Sobic006G144900 Sobic005G061300--Sobic008G045900 Sobic005G061300--Sobic002G345100 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic005G061300--Sobic001G001000 Sobic005G061300--Sobic003G002800 Sobic005G061300--Sobic003G210701 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic005G061300--Sobic002G067050 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic003G210701--Sobic001G234700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.