Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G025200.1
Synonym EIF3G1, ATEIF3G1, Sb10g002360
Functional annotation RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
UniProt C5Z3E6
Pfam PF00076
Panther DB PTHR10352 PTHR10352:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding GO:0005852eukaryotic translation initiation factor 3 complex GO:0005737cytoplasm GO:0003743translation initiation factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G11400 : eukaryotic translation initiation factor 3G1
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g41370.1 : RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ91030
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G144900 G-patch domain containing protein, putative, expressed K13103: tuftelin-interacting protein 11
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20 Sobic.002G345100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic010G025200--Sobic006G144900 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic010G025200--Sobic003G333150 Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic010G025200--Sobic005G114000 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic010G025200--Sobic005G061300 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic010G025200--Sobic003G387400 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic010G025200--Sobic003G002800 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic010G025200--Sobic002G260500 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic010G025200--Sobic009G160900 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic010G025200--Sobic005G005100 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic006G144900--Sobic002G345100 Sobic006G144900--Sobic003G002800 Sobic006G144900--Sobic010G025200 Sobic006G144900--Sobic003G333150 Sobic006G144900--Sobic002G260500 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic006G144900--Sobic009G142600 Sobic006G144900--Sobic009G160900 Sobic006G144900--Sobic005G061300 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic006G144900--Sobic003G210701 Sobic003G333150--Sobic005G061300 Sobic003G333150--Sobic006G144900 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic003G333150--Sobic008G045300 Sobic003G333150--Sobic002G345100 Sobic003G333150--Sobic005G114000 Sobic003G333150--Sobic003G002800 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic003G333150--Sobic004G293600 Sobic003G333150--Sobic010G025200 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic003G333150--Sobic009G203600 Sobic005G114000--Sobic005G061300 Sobic005G114000--Sobic006G144900 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic005G114000--Sobic001G001000 Sobic005G114000--Sobic003G210701 Sobic005G114000--Sobic003G002800 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic005G114000--Sobic001G033701 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic005G114000--Sobic001G160300 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic005G114000--Sobic008G045900 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic005G114000--Sobic010G081500 Sobic005G061300--Sobic003G333150 Sobic005G061300--Sobic005G114000 Sobic005G061300--Sobic006G144900 Sobic005G061300--Sobic008G045900 Sobic005G061300--Sobic002G345100 Sobic005G061300--Sobic001G001000 Sobic005G061300--Sobic003G002800 Sobic005G061300--Sobic003G210701 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic005G061300--Sobic002G067050 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic003G387400--Sobic009G174833 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic003G387400--Sobic004G173900 Sobic003G387400--Sobic006G144900 Sobic007G201300 Sobic007G201300 Sobic003G387400--Sobic007G201300 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic003G387400--Sobic003G118750 Sobic003G387400--Sobic002G260500 Sobic003G387400--Sobic003G210701 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic003G387400--Sobic004G200501 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic003G387400--Sobic008G139200 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic003G002800--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic003G002800--Sobic008G053700 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic003G002800--Sobic004G173800 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic003G002800--Sobic007G087500 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic003G002800--Sobic001G152240 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic003G002800--Sobic003G046000 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic003G002800--Sobic002G103400 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic003G002800--Sobic005G025500 Sobic003G002800--Sobic001G033701 Sobic002G260500--Sobic004G173800 Sobic002G260500--Sobic008G053700 Sobic002G260500--Sobic006G004700 Sobic002G260500--Sobic003G046000 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic002G260500--Sobic008G069901 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic002G260500--Sobic006G076700 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic002G260500--Sobic004G184900 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic002G260500--Sobic006G258200 Sobic002G260500--Sobic001G160300 Sobic009G160900--Sobic002G260500 Sobic009G160900--Sobic004G173800 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic009G160900--Sobic004G013400 Sobic009G160900--Sobic006G004700 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic009G160900--Sobic002G063500 Sobic009G160900--Sobic008G053700 Sobic009G160900--Sobic007G087500 Sobic009G160900--Sobic008G069901 Sobic009G160900--Sobic003G046000 Sobic005G005100--Sobic006G004700 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic005G005100--Sobic002G070400 Sobic005G005100--Sobic008G053700 Sobic005G005100--Sobic007G087500 Sobic005G005100--Sobic004G173800 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic005G005100--Sobic005G144101 Sobic005G005100--Sobic002G063500 Sobic005G005100--Sobic002G103400 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic005G005100--Sobic005G013700
Octagon: transcription factors


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