Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G114000.3,Sobic.005G114000.4,Sobic.005G114000.2
Synonym ATKCO1, ATTPK1, Sb05g015110, TPK1, KCO1
Functional annotation potassium channel protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RI69
Pfam PF07885
Panther DB PTHR11003 PTHR11003:SF137
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G55630 : Outward rectifying potassium channel protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g01810.1 : potassium channel protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029758
Brachypodium KQK13465
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G061300 - -
2 Sobic.006G144900 G-patch domain containing protein, putative, expressed K13103: tuftelin-interacting protein 11
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18 Sobic.008G069901 - -
19 Sobic.004G162800 - -
20 Sobic.010G140800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic005G114000--Sobic005G061300 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic005G114000--Sobic006G144900 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic005G114000--Sobic001G001000 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic005G114000--Sobic003G210701 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic005G114000--Sobic003G002800 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic005G114000--Sobic001G033701 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic005G114000--Sobic001G160300 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic005G114000--Sobic008G045900 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic005G114000--Sobic010G081500 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic005G061300--Sobic003G333150 Sobic005G061300--Sobic005G114000 Sobic005G061300--Sobic006G144900 Sobic005G061300--Sobic008G045900 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic005G061300--Sobic002G345100 Sobic005G061300--Sobic001G001000 Sobic005G061300--Sobic003G002800 Sobic005G061300--Sobic003G210701 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic005G061300--Sobic002G067050 Sobic006G144900--Sobic002G345100 Sobic006G144900--Sobic003G002800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic006G144900--Sobic010G025200 Sobic006G144900--Sobic003G333150 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic006G144900--Sobic002G260500 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic006G144900--Sobic009G142600 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic006G144900--Sobic009G160900 Sobic006G144900--Sobic005G061300 Sobic006G144900--Sobic003G210701 Sobic001G001000--Sobic001G033701 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic001G001000--Sobic001G138500 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic001G001000--Sobic008G008701 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic001G001000--Sobic001G045300 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic001G001000--Sobic007G027400 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic001G001000--Sobic005G207550 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic001G001000--Sobic008G045100 Sobic001G001000--Sobic003G210701 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic001G001000--Sobic004G122700 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic003G210701--Sobic001G234700 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic003G002800--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic003G002800--Sobic008G053700 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic003G002800--Sobic004G173800 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic003G002800--Sobic007G087500 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic003G002800--Sobic001G152240 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic003G002800--Sobic003G046000 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic003G002800--Sobic002G103400 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic003G002800--Sobic005G025500 Sobic003G002800--Sobic001G033701 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic001G033701--Sobic004G090900 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic001G033701--Sobic002G046500 Sobic001G033701--Sobic001G045300 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic001G033701--Sobic002G289601 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic001G033701--Sobic005G014600 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic001G033701--Sobic002G084100 Sobic001G033701--Sobic007G027400 Sobic001G033701--Sobic008G008701 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic001G033701--Sobic009G113300 Sobic001G160300--Sobic009G113300 Sobic001G160300--Sobic010G081500 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic001G160300--Sobic006G258200 Sobic001G160300--Sobic002G289601 Sobic001G160300--Sobic003G046000 Sobic009G159800 Sobic009G159800 Sobic001G160300--Sobic009G159800 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic001G160300--Sobic008G069901 Sobic001G160300--Sobic002G084100 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic001G160300--Sobic006G076700 Sobic008G045900--Sobic001G138500 Sobic008G045900--Sobic001G045300 Sobic008G045900--Sobic004G090900 Sobic008G045900--Sobic007G027400 Sobic008G045900--Sobic002G046500 Sobic008G045900--Sobic008G008701 Sobic008G045900--Sobic002G084100 Sobic008G045900--Sobic001G033701 Sobic008G045900--Sobic009G142600 Sobic010G081500--Sobic002G289601 Sobic010G081500--Sobic009G113300 Sobic010G081500--Sobic009G159800 Sobic010G081500--Sobic006G258200 Sobic010G081500--Sobic002G084100 Sobic003G245101 Sobic003G245101 Sobic010G081500--Sobic003G245101 Sobic010G081500--Sobic001G160300 Sobic010G081500--Sobic005G014600 Sobic010G081500--Sobic008G069901
Octagon: transcription factors


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