Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G001000.1
Synonym Sb01g000255
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QGN5
Pfam -
Panther DB PTHR33698 PTHR33698:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G41470 : Nuclear transport factor 2 (NTF2) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g64380.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G033701 - -
2 Sobic.001G138500 expressed protein -
3 Sobic.008G008701 - -
4 Sobic.001G045300 ubiquitin family protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G027400 MBTB16 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
6 Sobic.005G207550 - -
7 Sobic.008G045100 - -
8 Sobic.003G210701 - -
9 Sobic.004G122700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
10 Sobic.006G137900 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G090900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
12 Sobic.002G046500 gibberellin 20 oxidase 1-B, putative, expressed -
13 Sobic.001G190600 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
14 Sobic.004G325150 - -
15 Sobic.004G013400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed K01802: peptidylprolyl isomerase
16 Sobic.001G358101 - -
17 Sobic.004G162800 - -
18 Sobic.003G245101 - -
19 Sobic.002G084100 - -
20 Sobic.003G190701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic001G001000--Sobic001G033701 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic001G001000--Sobic001G138500 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic001G001000--Sobic008G008701 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic001G001000--Sobic001G045300 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic001G001000--Sobic007G027400 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic001G001000--Sobic005G207550 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic001G001000--Sobic008G045100 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic001G001000--Sobic003G210701 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic001G001000--Sobic004G122700 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic001G033701--Sobic004G090900 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic001G033701--Sobic002G046500 Sobic001G033701--Sobic001G045300 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic001G033701--Sobic002G289601 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic001G033701--Sobic005G014600 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic001G033701--Sobic002G084100 Sobic001G033701--Sobic007G027400 Sobic001G033701--Sobic008G008701 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic001G033701--Sobic009G113300 Sobic001G138500--Sobic005G207550 Sobic001G138500--Sobic008G008701 Sobic001G138500--Sobic004G122700 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic001G138500--Sobic001G190600 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic001G138500--Sobic006G137900 Sobic001G138500--Sobic004G090900 Sobic001G138500--Sobic001G045300 Sobic001G138500--Sobic007G027400 Sobic001G138500--Sobic002G046500 Sobic008G008701--Sobic004G122700 Sobic008G008701--Sobic004G090900 Sobic008G008701--Sobic001G045300 Sobic008G008701--Sobic001G138500 Sobic008G008701--Sobic002G046500 Sobic008G008701--Sobic007G027400 Sobic008G008701--Sobic005G207550 Sobic008G008701--Sobic001G033701 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic008G008701--Sobic008G008601 Sobic001G045300--Sobic007G027400 Sobic001G045300--Sobic002G046500 Sobic001G045300--Sobic004G090900 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic001G045300--Sobic001G358101 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic001G045300--Sobic004G162800 Sobic003G245101 Sobic003G245101 Sobic001G045300--Sobic003G245101 Sobic001G045300--Sobic002G084100 Sobic001G045300--Sobic008G008701 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic001G045300--Sobic003G190701 Sobic007G027400--Sobic001G045300 Sobic007G027400--Sobic002G046500 Sobic007G027400--Sobic001G358101 Sobic007G027400--Sobic004G090900 Sobic007G027400--Sobic004G162800 Sobic007G027400--Sobic003G245101 Sobic007G027400--Sobic002G084100 Sobic007G027400--Sobic003G190701 Sobic007G027400--Sobic008G008701 Sobic005G207550--Sobic001G138500 Sobic005G207550--Sobic001G190600 Sobic005G207550--Sobic008G008701 Sobic005G207550--Sobic004G122700 Sobic005G207550--Sobic006G137900 Sobic005G207550--Sobic001G045300 Sobic005G207550--Sobic004G090900 Sobic005G207550--Sobic007G027400 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic005G207550--Sobic005G207600 Sobic008G045100--Sobic001G358101 Sobic008G045100--Sobic003G190701 Sobic008G045100--Sobic004G162800 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic008G045100--Sobic001G234700 Sobic003G210701--Sobic001G234700 Sobic004G122700--Sobic008G008701 Sobic004G122700--Sobic004G090900 Sobic004G122700--Sobic001G138500 Sobic004G122700--Sobic008G008601 Sobic004G122700--Sobic001G045300 Sobic004G122700--Sobic005G207550 Sobic004G122700--Sobic002G046500 Sobic004G122700--Sobic001G033701 Sobic004G122700--Sobic007G027400
Octagon: transcription factors


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