Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G137900.3,Sobic.006G137900.4,Sobic.006G137900.2,Sobic.006G137900.1
Synonym Sb06g021730
Functional annotation heavy metal-associated domain containing protein, expressed
UniProt C5YBJ7
Pfam PF00403
Panther DB PTHR22814 PTHR22814:SF109
NCBI CDD KOG1603; Copper chaperone
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71050 : Heavy metal transport/detoxification superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g42350.1 : heavy metal-associated domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010781
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G207550 - -
2 Sobic.004G122700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
3 Sobic.001G138500 expressed protein -
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13 Sobic.001G033701 - -
14 Sobic.005G207600 - -
15 Sobic.002G046500 gibberellin 20 oxidase 1-B, putative, expressed -
16 Sobic.007G027400 MBTB16 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
17 Sobic.010G146350 - -
18 Sobic.004G327100 atATG18b, putative, expressed K17908: WIPI1_2, autophagy-related protein 18
19 Sobic.005G025500 expressed protein -
20 Sobic.010G228200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic006G137900--Sobic005G207550 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic006G137900--Sobic004G122700 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic006G137900--Sobic001G138500 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic006G137900--Sobic001G190600 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic006G137900--Sobic008G008701 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic006G137900--Sobic008G008601 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic006G137900--Sobic005G013700 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic006G137900--Sobic004G325150 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic006G137900--Sobic004G090900 Sobic005G207550--Sobic001G138500 Sobic005G207550--Sobic001G190600 Sobic005G207550--Sobic008G008701 Sobic005G207550--Sobic004G122700 Sobic005G207550--Sobic006G137900 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic005G207550--Sobic001G045300 Sobic005G207550--Sobic004G090900 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic005G207550--Sobic007G027400 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic005G207550--Sobic005G207600 Sobic004G122700--Sobic008G008701 Sobic004G122700--Sobic004G090900 Sobic004G122700--Sobic001G138500 Sobic004G122700--Sobic008G008601 Sobic004G122700--Sobic001G045300 Sobic004G122700--Sobic005G207550 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic004G122700--Sobic002G046500 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic004G122700--Sobic001G033701 Sobic004G122700--Sobic007G027400 Sobic001G138500--Sobic005G207550 Sobic001G138500--Sobic008G008701 Sobic001G138500--Sobic004G122700 Sobic001G138500--Sobic001G190600 Sobic001G138500--Sobic006G137900 Sobic001G138500--Sobic004G090900 Sobic001G138500--Sobic001G045300 Sobic001G138500--Sobic007G027400 Sobic001G138500--Sobic002G046500 Sobic001G190600--Sobic005G207550 Sobic001G190600--Sobic001G138500 Sobic001G190600--Sobic004G122700 Sobic001G190600--Sobic006G137900 Sobic001G190600--Sobic008G008701 Sobic001G190600--Sobic005G207600 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic001G190600--Sobic010G146350 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic001G190600--Sobic004G013400 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic001G190600--Sobic010G228200 Sobic008G008701--Sobic004G122700 Sobic008G008701--Sobic004G090900 Sobic008G008701--Sobic001G045300 Sobic008G008701--Sobic001G138500 Sobic008G008701--Sobic002G046500 Sobic008G008701--Sobic007G027400 Sobic008G008701--Sobic005G207550 Sobic008G008701--Sobic001G033701 Sobic008G008701--Sobic008G008601 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic008G008601--Sobic001G452300 Sobic008G008601--Sobic004G122700 Sobic008G008601--Sobic008G008701 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic008G008601--Sobic002G063500 Sobic008G008601--Sobic004G090900 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic008G008601--Sobic008G069901 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic008G008601--Sobic007G087500 Sobic008G008601--Sobic001G033701 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic008G008601--Sobic004G184900 Sobic005G013700--Sobic006G137900 Sobic005G013700--Sobic008G008601 Sobic005G013700--Sobic004G122700 Sobic005G013700--Sobic008G008701 Sobic005G013700--Sobic004G090900 Sobic005G013700--Sobic004G325150 Sobic005G013700--Sobic002G063500 Sobic005G013700--Sobic001G452300 Sobic005G013700--Sobic008G069901 Sobic004G325150--Sobic006G137900 Sobic004G325150--Sobic005G013700 Sobic004G325150--Sobic008G008701 Sobic003G407400 Sobic003G407400 Sobic004G325150--Sobic003G407400 Sobic004G325150--Sobic004G122700 Sobic004G325150--Sobic001G138500 Sobic004G325150--Sobic001G045300 Sobic004G325150--Sobic005G207550 Sobic004G325150--Sobic007G027400 Sobic004G090900--Sobic002G046500 Sobic004G090900--Sobic001G045300 Sobic004G090900--Sobic007G027400 Sobic004G090900--Sobic008G008701 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic004G090900--Sobic002G084100 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic004G090900--Sobic005G014600 Sobic004G090900--Sobic004G122700 Sobic004G090900--Sobic001G033701 Sobic003G245101 Sobic003G245101 Sobic004G090900--Sobic003G245101
Octagon: transcription factors


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