Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G002800.5,Sobic.003G002800.2,Sobic.003G002800.4,Sobic.003G002800.3
Synonym Sb03g000420, NFD6
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XJI6 , A0A1B6Q0K2
Pfam -
Panther DB PTHR33156 PTHR33156:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G20585 : nuclear fusion defective 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g13720.1,LOC_Os01g13720.4,LOC_Os01g13720.3 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022784
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G004700 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
2 Sobic.008G053700 - -
3 Sobic.004G173800 - -
4 Sobic.007G087500 hypothetical protein -
5 Sobic.001G152240 - -
6 Sobic.003G046000 - -
7 Sobic.002G103400 - -
8 Sobic.005G025500 expressed protein -
9 Sobic.001G033701 - -
10 Sobic.008G069901 - -
11 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.004G184900 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G076700 - -
14 Sobic.002G260500 - -
15 Sobic.010G273200 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
16 Sobic.008G008601 - -
17 Sobic.005G144101 - -
18 Sobic.001G452300 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G160300 - -
20 Sobic.009G113300 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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