Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G273200.1
Synonym G2, POP1, CUT1, CER6, KCS6, Sb10g030750
Functional annotation 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed
UniProt C5Z2I5
Pfam PF08392
Panther DB PTHR31561 PTHR31561:SF17
NCBI CDD -
KEGG Orthology K15397; 3-ketoacyl-CoA synthase
Gene Ontology GO:0016747; transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups GO:0016020membrane GO:0006633fatty acid biosynthetic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G68530 : 3-ketoacyl-CoA synthase 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g14810.1 : 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032652 , Zm00025a042702 , Zm00025a029505 , Zm00025a021922
Brachypodium KQK18680 , KQK18679 , KQK08195
Barley HORVU3Hr1G054500.1
Wheat TraesCS7B02G449000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic010G273200--Sobic005G144101 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic010G273200--Sobic001G152240 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic010G273200--Sobic002G103400 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic010G273200--Sobic010G091750 Sobic003G060900 Sobic003G060900 Sobic010G273200--Sobic003G060900 Sobic009G029800 Sobic009G029800 Sobic010G273200--Sobic009G029800 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic010G273200--Sobic004G173800 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic010G273200--Sobic007G087500 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic010G273200--Sobic006G004700 Sobic005G144101--Sobic010G273200 Sobic005G144101--Sobic002G103400 Sobic005G144101--Sobic001G152240 Sobic005G144101--Sobic010G091750 Sobic005G144101--Sobic004G173800 Sobic005G144101--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic005G144101--Sobic008G053700 Sobic005G144101--Sobic007G087500 Sobic005G144101--Sobic009G029800 Sobic001G152240--Sobic002G103400 Sobic001G152240--Sobic010G273200 Sobic001G152240--Sobic005G144101 Sobic001G152240--Sobic004G173800 Sobic001G152240--Sobic008G053700 Sobic001G152240--Sobic006G004700 Sobic001G152240--Sobic010G091750 Sobic001G152240--Sobic007G087500 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic001G152240--Sobic003G046000 Sobic002G103400--Sobic001G152240 Sobic002G103400--Sobic005G144101 Sobic002G103400--Sobic010G273200 Sobic002G103400--Sobic008G053700 Sobic002G103400--Sobic006G004700 Sobic002G103400--Sobic010G091750 Sobic002G103400--Sobic004G173800 Sobic002G103400--Sobic007G087500 Sobic002G103400--Sobic003G046000 Sobic010G091750--Sobic002G103400 Sobic010G091750--Sobic010G273200 Sobic010G091750--Sobic007G087500 Sobic010G091750--Sobic005G144101 Sobic010G091750--Sobic001G152240 Sobic010G091750--Sobic006G004700 Sobic010G091750--Sobic008G053700 Sobic010G091750--Sobic004G173800 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic010G091750--Sobic001G452300 Sobic001G213150 Sobic001G213150 Sobic003G060900--Sobic001G213150 Sobic003G060900--Sobic010G273200 Sobic003G060900--Sobic009G029800 Sobic003G060900--Sobic005G144101 Sobic003G060900--Sobic010G091750 Sobic007G215300 Sobic007G215300 Sobic003G060900--Sobic007G215300 Sobic003G060900--Sobic002G103400 Sobic003G060900--Sobic001G152240 Sobic005G204400 Sobic005G204400 Sobic003G060900--Sobic005G204400 Sobic009G029800--Sobic001G213150 Sobic009G029800--Sobic003G060900 Sobic009G029800--Sobic010G273200 Sobic009G029800--Sobic005G144101 Sobic009G029800--Sobic007G215300 Sobic009G029800--Sobic002G103400 Sobic009G029800--Sobic001G152240 Sobic009G029800--Sobic010G091750 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic009G029800--Sobic003G141400 Sobic004G173800--Sobic008G053700 Sobic004G173800--Sobic006G004700 Sobic004G173800--Sobic001G152240 Sobic004G173800--Sobic002G103400 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic004G173800--Sobic002G260500 Sobic004G173800--Sobic003G046000 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic004G173800--Sobic006G076700 Sobic004G173800--Sobic007G087500 Sobic004G173800--Sobic005G144101 Sobic007G087500--Sobic006G004700 Sobic007G087500--Sobic008G053700 Sobic007G087500--Sobic001G452300 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic007G087500--Sobic008G008601 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic007G087500--Sobic002G063500 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic007G087500--Sobic004G184900 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic007G087500--Sobic008G069901 Sobic007G087500--Sobic010G091750 Sobic007G087500--Sobic003G046000 Sobic006G004700--Sobic008G053700 Sobic006G004700--Sobic003G046000 Sobic006G004700--Sobic007G087500 Sobic006G004700--Sobic002G063500 Sobic006G004700--Sobic008G069901 Sobic006G004700--Sobic004G184900 Sobic006G004700--Sobic004G173800 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic006G004700--Sobic001G160300 Sobic006G004700--Sobic006G076700
Octagon: transcription factors


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