Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G005100.1
Synonym TBL34, Sb05g000600
Functional annotation PMR5, putative, expressed
UniProt C5Y306
Pfam PF14416 PF13839
Panther DB PTHR32285 PTHR32285:SF46
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G38320 : TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 34
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g01570.1 : PMR5, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040477 , Zm00025a040478 , Zm00025a053664 , Zm00025a033279
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G004700 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
2 Sobic.002G070400 - -
3 Sobic.008G053700 - -
4 Sobic.007G087500 hypothetical protein -
5 Sobic.004G173800 - -
6 Sobic.005G144101 - -
7 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
8 Sobic.002G103400 - -
9 Sobic.005G013700 - -
10 Sobic.003G046000 - -
11 Sobic.001G160300 - -
12 Sobic.001G152240 - -
13 Sobic.008G069901 - -
14 Sobic.008G008601 - -
15 Sobic.004G184900 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G076700 - -
17 Sobic.010G091750 - -
18 Sobic.009G113300 - -
19 Sobic.006G258200 - -
20 Sobic.001G452300 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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