Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G070400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q9S2
Pfam PF15697
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G20100 : -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016016
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G005100 PMR5, putative, expressed -
2 Sobic.005G013700 - -
3 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
4 Sobic.006G004700 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
5 Sobic.008G008601 - -
6 Sobic.008G069901 - -
7 Sobic.001G160300 - -
8 Sobic.003G046000 - -
9 Sobic.005G025500 expressed protein -
10 Sobic.009G113300 - -
11 Sobic.004G090900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
12 Sobic.007G087500 hypothetical protein -
13 Sobic.001G452300 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G289601 - -
15 Sobic.004G184900 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G081500 - -
17 Sobic.004G122700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
18 Sobic.010G065500 BHLH transcription factor, putative, expressed -
19 Sobic.005G014600 OsMan09 - Endo-Beta-Mannanase, expressed K19355: mannan endo-1,4-beta-mannosidase
20 Sobic.008G053700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic002G070400--Sobic005G005100 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic002G070400--Sobic005G013700 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic002G070400--Sobic002G063500 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic002G070400--Sobic006G004700 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic002G070400--Sobic008G008601 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic002G070400--Sobic008G069901 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic002G070400--Sobic001G160300 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic002G070400--Sobic003G046000 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic002G070400--Sobic005G025500 Sobic005G005100--Sobic006G004700 Sobic005G005100--Sobic002G070400 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic005G005100--Sobic008G053700 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic005G005100--Sobic007G087500 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic005G005100--Sobic004G173800 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic005G005100--Sobic005G144101 Sobic005G005100--Sobic002G063500 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic005G005100--Sobic002G103400 Sobic005G005100--Sobic005G013700 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic005G013700--Sobic006G137900 Sobic005G013700--Sobic008G008601 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic005G013700--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic005G013700--Sobic008G008701 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic005G013700--Sobic004G090900 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic005G013700--Sobic004G325150 Sobic005G013700--Sobic002G063500 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic005G013700--Sobic001G452300 Sobic005G013700--Sobic008G069901 Sobic002G063500--Sobic008G069901 Sobic002G063500--Sobic001G160300 Sobic002G063500--Sobic003G046000 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic002G063500--Sobic004G184900 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic002G063500--Sobic009G113300 Sobic002G063500--Sobic006G004700 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic002G063500--Sobic005G014600 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic002G063500--Sobic002G289601 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic002G063500--Sobic010G081500 Sobic006G004700--Sobic008G053700 Sobic006G004700--Sobic003G046000 Sobic006G004700--Sobic007G087500 Sobic006G004700--Sobic002G063500 Sobic006G004700--Sobic008G069901 Sobic006G004700--Sobic004G184900 Sobic006G004700--Sobic004G173800 Sobic006G004700--Sobic001G160300 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic006G004700--Sobic006G076700 Sobic008G008601--Sobic001G452300 Sobic008G008601--Sobic004G122700 Sobic008G008601--Sobic008G008701 Sobic008G008601--Sobic002G063500 Sobic008G008601--Sobic004G090900 Sobic008G008601--Sobic008G069901 Sobic008G008601--Sobic007G087500 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic004G184900 Sobic008G069901--Sobic003G046000 Sobic008G069901--Sobic004G184900 Sobic008G069901--Sobic009G113300 Sobic008G069901--Sobic010G081500 Sobic008G069901--Sobic002G289601 Sobic008G069901--Sobic001G160300 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic008G069901--Sobic006G258200 Sobic008G069901--Sobic002G063500 Sobic008G069901--Sobic005G014600 Sobic001G160300--Sobic009G113300 Sobic001G160300--Sobic010G081500 Sobic001G160300--Sobic006G258200 Sobic001G160300--Sobic002G289601 Sobic001G160300--Sobic003G046000 Sobic009G159800 Sobic009G159800 Sobic001G160300--Sobic009G159800 Sobic001G160300--Sobic008G069901 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic001G160300--Sobic002G084100 Sobic001G160300--Sobic006G076700 Sobic003G046000--Sobic008G069901 Sobic003G046000--Sobic004G184900 Sobic003G046000--Sobic006G076700 Sobic003G046000--Sobic006G258200 Sobic003G046000--Sobic009G113300 Sobic003G046000--Sobic001G160300 Sobic003G046000--Sobic010G081500 Sobic003G046000--Sobic008G053700 Sobic003G046000--Sobic002G289601 Sobic005G025500--Sobic008G008601 Sobic005G025500--Sobic005G014600 Sobic005G025500--Sobic004G122700 Sobic005G025500--Sobic004G090900 Sobic005G025500--Sobic008G069901 Sobic005G025500--Sobic008G008701 Sobic005G025500--Sobic002G063500 Sobic005G025500--Sobic001G452300 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic005G025500--Sobic002G046500
Octagon: transcription factors


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