Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G103300.4,Sobic.010G103300.3,Sobic.010G103300.2
Synonym Sb10g009010
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
membrane attack complex component/perforin/complement C9, putative, expressed
UniProt A0A1W0VSA6 , A0A194YIB6
Pfam PF01823
Panther DB PTHR33199 PTHR33199:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G14780 : MAC/Perforin domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g14050.1 : membrane attack complex component/perforin/complement C9, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049356 , Zm00025a021961
Brachypodium KQK18725 , PNT69688 , KQK18727 , KQK18726 , KQK18723 , KQK02019 , PNT69685 , PNT69684 , PNT69686 , KQK02021 , PNT69687 , KQK02023 , PNT76116 , PNT76118 , PNT76115 , KQK02020 , PNT76117 , KQK02022 , KQK18724
Barley HORVU7Hr1G041160.9 , HORVU7Hr1G041160.8 , HORVU6Hr1G074210.8 , HORVU6Hr1G074210.9 , HORVU6Hr1G074210.2 , HORVU6Hr1G074210.3 , HORVU7Hr1G041160.3 , HORVU7Hr1G041160.2 , HORVU6Hr1G074210.6 , HORVU7Hr1G041160.4 , HORVU6Hr1G074210.4 , HORVU7Hr1G041160.6 , HORVU6Hr1G074210.1 , HORVU7Hr1G041160.5 , HORVU6Hr1G074210.7 , HORVU7Hr1G041160.7 , HORVU7Hr1G041160.14 , HORVU6Hr1G074210.5 , HORVU7Hr1G041160.11 , HORVU7Hr1G041160.10 , HORVU7Hr1G041160.13 , HORVU7Hr1G041160.12 , HORVU6Hr1G074210.10
Wheat TraesCS6B02G328600 , TraesCS6B02G328600 , TraesCS7A02G200600 , TraesCS6A02G299100 , TraesCS6A02G299100 , TraesCS6D02G278800 , TraesCS6D02G278800 , TraesCS6D02G278800 , TraesCS7A02G200600 , TraesCS7D02G203900 , TraesCS7B02G107400
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cDNA sequences
Sobic.010G103300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G053700 - -
2 Sobic.006G004700 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
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8 Sobic.007G087500 hypothetical protein -
9 Sobic.009G113300 - -
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11 Sobic.006G076700 - -
12 Sobic.006G258200 - -
13 Sobic.010G081500 - -
14 Sobic.002G289601 - -
15 Sobic.008G008601 - -
16 Sobic.005G014600 OsMan09 - Endo-Beta-Mannanase, expressed K19355: mannan endo-1,4-beta-mannosidase
17 Sobic.004G173800 - -
18 Sobic.005G029866 - -
19 Sobic.009G159800 - -
20 Sobic.002G084100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G103300 Sobic010G103300 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic010G103300--Sobic008G053700 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic010G103300--Sobic006G004700 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic010G103300--Sobic003G046000 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic010G103300--Sobic008G069901 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic010G103300--Sobic004G184900 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic010G103300--Sobic001G452300 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic010G103300--Sobic002G063500 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic010G103300--Sobic007G087500 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic010G103300--Sobic009G113300 Sobic008G053700--Sobic006G004700 Sobic008G053700--Sobic003G046000 Sobic008G053700--Sobic008G069901 Sobic008G053700--Sobic004G184900 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic008G053700--Sobic006G076700 Sobic008G053700--Sobic007G087500 Sobic008G053700--Sobic002G063500 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic008G053700--Sobic001G160300 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic008G053700--Sobic004G173800 Sobic006G004700--Sobic008G053700 Sobic006G004700--Sobic003G046000 Sobic006G004700--Sobic007G087500 Sobic006G004700--Sobic002G063500 Sobic006G004700--Sobic008G069901 Sobic006G004700--Sobic004G184900 Sobic006G004700--Sobic004G173800 Sobic006G004700--Sobic001G160300 Sobic006G004700--Sobic006G076700 Sobic003G046000--Sobic008G069901 Sobic003G046000--Sobic004G184900 Sobic003G046000--Sobic006G076700 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic003G046000--Sobic006G258200 Sobic003G046000--Sobic009G113300 Sobic003G046000--Sobic001G160300 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic003G046000--Sobic010G081500 Sobic003G046000--Sobic008G053700 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic003G046000--Sobic002G289601 Sobic008G069901--Sobic003G046000 Sobic008G069901--Sobic004G184900 Sobic008G069901--Sobic009G113300 Sobic008G069901--Sobic010G081500 Sobic008G069901--Sobic002G289601 Sobic008G069901--Sobic001G160300 Sobic008G069901--Sobic006G258200 Sobic008G069901--Sobic002G063500 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic008G069901--Sobic005G014600 Sobic004G184900--Sobic008G069901 Sobic004G184900--Sobic003G046000 Sobic004G184900--Sobic009G113300 Sobic004G184900--Sobic010G081500 Sobic004G184900--Sobic002G289601 Sobic004G184900--Sobic006G258200 Sobic004G184900--Sobic001G160300 Sobic004G184900--Sobic006G076700 Sobic004G184900--Sobic005G014600 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic001G452300--Sobic008G008601 Sobic001G452300--Sobic007G087500 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic001G452300--Sobic004G122700 Sobic001G452300--Sobic008G069901 Sobic001G452300--Sobic002G063500 Sobic001G452300--Sobic004G184900 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic001G452300--Sobic008G008701 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic001G452300--Sobic004G090900 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic001G452300--Sobic001G033701 Sobic002G063500--Sobic008G069901 Sobic002G063500--Sobic001G160300 Sobic002G063500--Sobic003G046000 Sobic002G063500--Sobic004G184900 Sobic002G063500--Sobic009G113300 Sobic002G063500--Sobic006G004700 Sobic002G063500--Sobic005G014600 Sobic002G063500--Sobic002G289601 Sobic002G063500--Sobic010G081500 Sobic007G087500--Sobic006G004700 Sobic007G087500--Sobic008G053700 Sobic007G087500--Sobic001G452300 Sobic007G087500--Sobic008G008601 Sobic007G087500--Sobic002G063500 Sobic007G087500--Sobic004G184900 Sobic007G087500--Sobic008G069901 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic007G087500--Sobic010G091750 Sobic007G087500--Sobic003G046000 Sobic009G113300--Sobic010G081500 Sobic009G113300--Sobic002G289601 Sobic009G113300--Sobic006G258200 Sobic009G113300--Sobic001G160300 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic009G113300--Sobic002G084100 Sobic009G159800 Sobic009G159800 Sobic009G113300--Sobic009G159800 Sobic009G113300--Sobic008G069901 Sobic009G113300--Sobic005G014600 Sobic003G245101 Sobic003G245101 Sobic009G113300--Sobic003G245101
Octagon: transcription factors


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