Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G387400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q7K9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G174833 - -
2 Sobic.004G173900 - -
3 Sobic.006G144900 G-patch domain containing protein, putative, expressed K13103: tuftelin-interacting protein 11
4 Sobic.007G201300 30S ribosomal protein S16, putative, expressed -
5 Sobic.003G118750 - -
6 Sobic.002G260500 - -
7 Sobic.003G210701 - -
8 Sobic.004G200501 - -
9 Sobic.008G139200 - -
10 Sobic.002G345100 expressed protein -
11 Sobic.004G048201 - -
12 Sobic.009G160900 expressed protein -
13 Sobic.005G061300 - -
14 Sobic.009G142600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cysteine-rich receptor-like protein kinase 6 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.005G059300 ctr copper transporter family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G333150 - -
17 Sobic.008G045900 - -
18 Sobic.001G160300 - -
19 Sobic.001G033701 - -
20 Sobic.010G025200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic003G387400--Sobic009G174833 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic003G387400--Sobic004G173900 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic003G387400--Sobic006G144900 Sobic007G201300 Sobic007G201300 Sobic003G387400--Sobic007G201300 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic003G387400--Sobic003G118750 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic003G387400--Sobic002G260500 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic003G387400--Sobic003G210701 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic003G387400--Sobic004G200501 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic003G387400--Sobic008G139200 Sobic009G174833--Sobic004G173900 Sobic004G048201 Sobic004G048201 Sobic009G174833--Sobic004G048201 Sobic009G174833--Sobic007G201300 Sobic009G174833--Sobic004G200501 Sobic009G174833--Sobic008G139200 Sobic005G059300 Sobic005G059300 Sobic009G174833--Sobic005G059300 Sobic009G174833--Sobic003G387400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic009G174833--Sobic008G045900 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic009G174833--Sobic008G045100 Sobic004G173900--Sobic005G059300 Sobic004G173900--Sobic003G118750 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic004G173900--Sobic003G141400 Sobic004G173900--Sobic008G139200 Sobic004G173900--Sobic004G200501 Sobic004G173900--Sobic009G174833 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic004G173900--Sobic002G103400 Sobic004G173900--Sobic007G201300 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic004G173900--Sobic007G087500 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic006G144900--Sobic002G345100 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic006G144900--Sobic003G002800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic006G144900--Sobic010G025200 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic006G144900--Sobic003G333150 Sobic006G144900--Sobic002G260500 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic006G144900--Sobic009G142600 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic006G144900--Sobic009G160900 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic006G144900--Sobic005G061300 Sobic006G144900--Sobic003G210701 Sobic007G201300--Sobic009G174833 Sobic007G201300--Sobic004G173900 Sobic007G201300--Sobic004G200501 Sobic007G201300--Sobic008G045100 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic007G201300--Sobic001G160300 Sobic007G201300--Sobic008G045900 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic007G201300--Sobic001G234700 Sobic003G118750--Sobic003G141400 Sobic003G118750--Sobic004G173900 Sobic003G118750--Sobic005G059300 Sobic009G029800 Sobic009G029800 Sobic003G118750--Sobic009G029800 Sobic001G213150 Sobic001G213150 Sobic003G118750--Sobic001G213150 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic003G118750--Sobic010G091750 Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic003G118750--Sobic010G273200 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic003G118750--Sobic010G010100 Sobic003G118750--Sobic002G103400 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic002G260500--Sobic004G173800 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic002G260500--Sobic008G053700 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic002G260500--Sobic006G004700 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic002G260500--Sobic003G046000 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic002G260500--Sobic008G069901 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic002G260500--Sobic006G076700 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic002G260500--Sobic004G184900 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic002G260500--Sobic006G258200 Sobic002G260500--Sobic001G160300 Sobic003G210701--Sobic001G234700 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic004G200501--Sobic003G023100 Sobic004G200501--Sobic007G087500 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic004G200501--Sobic008G008601 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic004G200501--Sobic003G120050 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic004G200501--Sobic005G013700 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic004G200501--Sobic001G452300 Sobic004G200501--Sobic004G173900 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic004G200501--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic004G200501--Sobic008G008701 Sobic008G139200--Sobic004G173900 Sobic008G139200--Sobic003G118750 Sobic008G139200--Sobic005G059300 Sobic008G139200--Sobic004G200501 Sobic008G139200--Sobic003G141400 Sobic008G139200--Sobic009G174833 Sobic008G139200--Sobic010G010100 Sobic008G139200--Sobic010G091750 Sobic008G139200--Sobic007G087500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.