Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G200501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RNV8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044815
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G023100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
2 Sobic.007G087500 hypothetical protein -
3 Sobic.008G008601 - -
4 Sobic.003G120050 - -
5 Sobic.005G013700 - -
6 Sobic.001G452300 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G173900 - -
8 Sobic.004G122700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
9 Sobic.008G008701 - -
10 Sobic.005G059300 ctr copper transporter family protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G137900 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G138500 expressed protein -
13 Sobic.004G013400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed K01802: peptidylprolyl isomerase
14 Sobic.005G207550 - -
15 Sobic.001G190600 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
16 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
17 Sobic.004G090900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
18 Sobic.003G021401 - -
19 Sobic.010G091750 - -
20 Sobic.010G065500 BHLH transcription factor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic004G200501--Sobic003G023100 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic004G200501--Sobic007G087500 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic004G200501--Sobic008G008601 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic004G200501--Sobic003G120050 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic004G200501--Sobic005G013700 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic004G200501--Sobic001G452300 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic004G200501--Sobic004G173900 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic004G200501--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic004G200501--Sobic008G008701 Sobic003G023100--Sobic003G120050 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic003G023100--Sobic003G021401 Sobic003G023100--Sobic004G200501 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic003G023100--Sobic010G146350 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic003G023100--Sobic005G207600 Sobic002G277366 Sobic002G277366 Sobic003G023100--Sobic002G277366 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic003G023100--Sobic010G228200 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic003G023100--Sobic006G137900 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic003G023100--Sobic007G120600 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic007G087500--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic007G087500--Sobic008G053700 Sobic007G087500--Sobic001G452300 Sobic007G087500--Sobic008G008601 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic007G087500--Sobic002G063500 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic007G087500--Sobic004G184900 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic007G087500--Sobic008G069901 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic007G087500--Sobic010G091750 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic007G087500--Sobic003G046000 Sobic008G008601--Sobic001G452300 Sobic008G008601--Sobic004G122700 Sobic008G008601--Sobic008G008701 Sobic008G008601--Sobic002G063500 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic008G008601--Sobic004G090900 Sobic008G008601--Sobic008G069901 Sobic008G008601--Sobic007G087500 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic004G184900 Sobic003G120050--Sobic003G021401 Sobic003G120050--Sobic003G023100 Sobic003G120050--Sobic008G008601 Sobic003G120050--Sobic001G452300 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic003G120050--Sobic004G013400 Sobic003G120050--Sobic006G137900 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic003G120050--Sobic001G138500 Sobic003G120050--Sobic005G207600 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic003G120050--Sobic001G190600 Sobic005G013700--Sobic006G137900 Sobic005G013700--Sobic008G008601 Sobic005G013700--Sobic004G122700 Sobic005G013700--Sobic008G008701 Sobic005G013700--Sobic004G090900 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic005G013700--Sobic004G325150 Sobic005G013700--Sobic002G063500 Sobic005G013700--Sobic001G452300 Sobic005G013700--Sobic008G069901 Sobic001G452300--Sobic008G008601 Sobic001G452300--Sobic007G087500 Sobic001G452300--Sobic004G122700 Sobic001G452300--Sobic008G069901 Sobic001G452300--Sobic002G063500 Sobic001G452300--Sobic004G184900 Sobic001G452300--Sobic008G008701 Sobic001G452300--Sobic004G090900 Sobic001G452300--Sobic001G033701 Sobic005G059300 Sobic005G059300 Sobic004G173900--Sobic005G059300 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic004G173900--Sobic003G118750 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic004G173900--Sobic003G141400 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic004G173900--Sobic008G139200 Sobic004G173900--Sobic004G200501 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic004G173900--Sobic009G174833 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic004G173900--Sobic002G103400 Sobic007G201300 Sobic007G201300 Sobic004G173900--Sobic007G201300 Sobic004G173900--Sobic007G087500 Sobic004G122700--Sobic008G008701 Sobic004G122700--Sobic004G090900 Sobic004G122700--Sobic001G138500 Sobic004G122700--Sobic008G008601 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic004G122700--Sobic001G045300 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic004G122700--Sobic005G207550 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic004G122700--Sobic002G046500 Sobic004G122700--Sobic001G033701 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic004G122700--Sobic007G027400 Sobic008G008701--Sobic004G122700 Sobic008G008701--Sobic004G090900 Sobic008G008701--Sobic001G045300 Sobic008G008701--Sobic001G138500 Sobic008G008701--Sobic002G046500 Sobic008G008701--Sobic007G027400 Sobic008G008701--Sobic005G207550 Sobic008G008701--Sobic001G033701 Sobic008G008701--Sobic008G008601
Octagon: transcription factors


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