Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G364550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W0J6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G336600 COBRA-like protein precursor, putative, expressed -
2 Sobic.005G135300 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed -
3 Sobic.005G068400 - -
4 Sobic.008G131601 - -
5 Sobic.002G051500 expressed protein -
6 Sobic.006G088450 - -
7 Sobic.002G288500 serine/threonine kinase, putative, expressed -
8 Sobic.002G296800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cell cycle control protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G025200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G203600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@Receptor-like protein kinase HSL1(PubMedID : 31721651)@receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.003G078700 lipid phosphatase protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G185000 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G144900 G-patch domain containing protein, putative, expressed K13103: tuftelin-interacting protein 11
14 Sobic.002G076200 - -
15 Sobic.003G035200 profilin domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G162550 - -
17 Sobic.009G055000 - -
18 Sobic.002G382400 - -
19 Sobic.003G308900 expressed protein -
20 Sobic.003G243750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic003G364550--Sobic001G336600 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic003G364550--Sobic005G135300 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic003G364550--Sobic005G068400 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic003G364550--Sobic008G131601 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic003G364550--Sobic002G051500 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic003G364550--Sobic006G088450 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic003G364550--Sobic002G288500 Sobic002G296800 Sobic002G296800 Sobic003G364550--Sobic002G296800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic003G364550--Sobic010G025200 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic001G336600--Sobic007G193900 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic001G336600--Sobic003G352750 Sobic001G336600--Sobic008G131601 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic001G336600--Sobic009G160900 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic001G336600--Sobic006G144900 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic001G336600--Sobic009G203600 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic001G336600--Sobic002G260500 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic001G336600--Sobic003G387400 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic001G336600--Sobic002G345100 Sobic005G135300--Sobic005G068400 Sobic005G135300--Sobic008G131601 Sobic005G135300--Sobic006G088450 Sobic005G135300--Sobic002G288500 Sobic005G135300--Sobic003G364550 Sobic005G135300--Sobic001G336600 Sobic005G135300--Sobic002G051500 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic005G135300--Sobic002G091500 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic005G135300--Sobic004G295900 Sobic005G068400--Sobic006G088450 Sobic005G068400--Sobic005G135300 Sobic005G068400--Sobic002G288500 Sobic005G068400--Sobic008G131601 Sobic005G068400--Sobic002G051500 Sobic005G068400--Sobic003G364550 Sobic005G068400--Sobic001G336600 Sobic005G068400--Sobic004G295900 Sobic005G068400--Sobic003G352750 Sobic008G131601--Sobic005G135300 Sobic008G131601--Sobic001G336600 Sobic008G131601--Sobic002G091500 Sobic008G131601--Sobic005G068400 Sobic008G131601--Sobic006G088450 Sobic008G131601--Sobic003G364550 Sobic008G131601--Sobic007G193900 Sobic008G131601--Sobic003G352750 Sobic006G266850 Sobic006G266850 Sobic008G131601--Sobic006G266850 Sobic002G051500--Sobic005G068400 Sobic002G051500--Sobic003G364550 Sobic002G051500--Sobic006G088450 Sobic002G051500--Sobic005G135300 Sobic002G051500--Sobic002G288500 Sobic003G035200 Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic008G131601 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic002G051500--Sobic007G072200 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic002G051500--Sobic009G240300 Sobic006G088450--Sobic005G068400 Sobic006G088450--Sobic005G135300 Sobic006G088450--Sobic002G288500 Sobic006G088450--Sobic008G131601 Sobic006G088450--Sobic004G295900 Sobic006G088450--Sobic002G051500 Sobic006G088450--Sobic003G364550 Sobic003G315000 Sobic003G315000 Sobic006G088450--Sobic003G315000 Sobic006G088450--Sobic001G336600 Sobic002G288500--Sobic006G088450 Sobic002G288500--Sobic005G068400 Sobic002G288500--Sobic005G135300 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic002G288500--Sobic009G223000 Sobic002G288500--Sobic002G051500 Sobic002G288500--Sobic003G364550 Sobic002G288500--Sobic008G131601 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic002G288500--Sobic009G036366 Sobic002G288500--Sobic004G295900 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic002G296800--Sobic003G308900 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic002G296800--Sobic002G377400 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic002G296800--Sobic010G249600 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic002G296800--Sobic007G185000 Sobic002G296800--Sobic003G364550 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic002G296800--Sobic003G243750 Sobic005G090700 Sobic005G090700 Sobic002G296800--Sobic005G090700 Sobic010G133450 Sobic010G133450 Sobic002G296800--Sobic010G133450 Sobic009G055000 Sobic009G055000 Sobic002G296800--Sobic009G055000 Sobic010G025200--Sobic006G144900 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic010G025200--Sobic003G333150 Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic010G025200--Sobic005G114000 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic010G025200--Sobic005G061300 Sobic010G025200--Sobic003G387400 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic010G025200--Sobic003G002800 Sobic010G025200--Sobic002G260500 Sobic010G025200--Sobic009G160900 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic010G025200--Sobic005G005100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.