Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G135300.1
Synonym CHS, Sb05g019890, ATCHS, TT4
Functional annotation chalcone and stilbene synthases, putative, expressed
UniProt C5Y3E3
Pfam PF08392
Panther DB PTHR11877 PTHR11877:SF29
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016747; transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups GO:0016020membrane GO:0006633fatty acid biosynthetic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G13930 : Chalcone and stilbene synthase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g32610.1 : chalcone and stilbene synthases, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048134
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic005G135300--Sobic005G068400 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic005G135300--Sobic008G131601 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic005G135300--Sobic006G088450 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic005G135300--Sobic002G288500 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic005G135300--Sobic003G364550 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic005G135300--Sobic001G336600 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic005G135300--Sobic002G051500 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic005G135300--Sobic002G091500 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic005G135300--Sobic004G295900 Sobic005G068400--Sobic006G088450 Sobic005G068400--Sobic005G135300 Sobic005G068400--Sobic002G288500 Sobic005G068400--Sobic008G131601 Sobic005G068400--Sobic002G051500 Sobic005G068400--Sobic003G364550 Sobic005G068400--Sobic001G336600 Sobic005G068400--Sobic004G295900 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic005G068400--Sobic003G352750 Sobic008G131601--Sobic005G135300 Sobic008G131601--Sobic001G336600 Sobic008G131601--Sobic002G091500 Sobic008G131601--Sobic005G068400 Sobic008G131601--Sobic006G088450 Sobic008G131601--Sobic003G364550 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic008G131601--Sobic007G193900 Sobic008G131601--Sobic003G352750 Sobic006G266850 Sobic006G266850 Sobic008G131601--Sobic006G266850 Sobic006G088450--Sobic005G068400 Sobic006G088450--Sobic005G135300 Sobic006G088450--Sobic002G288500 Sobic006G088450--Sobic008G131601 Sobic006G088450--Sobic004G295900 Sobic006G088450--Sobic002G051500 Sobic006G088450--Sobic003G364550 Sobic003G315000 Sobic003G315000 Sobic006G088450--Sobic003G315000 Sobic006G088450--Sobic001G336600 Sobic002G288500--Sobic006G088450 Sobic002G288500--Sobic005G068400 Sobic002G288500--Sobic005G135300 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic002G288500--Sobic009G223000 Sobic002G288500--Sobic002G051500 Sobic002G288500--Sobic003G364550 Sobic002G288500--Sobic008G131601 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic002G288500--Sobic009G036366 Sobic002G288500--Sobic004G295900 Sobic003G364550--Sobic001G336600 Sobic003G364550--Sobic005G135300 Sobic003G364550--Sobic005G068400 Sobic003G364550--Sobic008G131601 Sobic003G364550--Sobic002G051500 Sobic003G364550--Sobic006G088450 Sobic003G364550--Sobic002G288500 Sobic002G296800 Sobic002G296800 Sobic003G364550--Sobic002G296800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic003G364550--Sobic010G025200 Sobic001G336600--Sobic007G193900 Sobic001G336600--Sobic003G352750 Sobic001G336600--Sobic008G131601 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic001G336600--Sobic009G160900 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic001G336600--Sobic006G144900 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic001G336600--Sobic009G203600 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic001G336600--Sobic002G260500 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic001G336600--Sobic003G387400 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic001G336600--Sobic002G345100 Sobic002G051500--Sobic005G068400 Sobic002G051500--Sobic003G364550 Sobic002G051500--Sobic006G088450 Sobic002G051500--Sobic005G135300 Sobic002G051500--Sobic002G288500 Sobic003G035200 Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic008G131601 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic002G051500--Sobic007G072200 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic002G051500--Sobic009G240300 Sobic002G091500--Sobic008G131601 Sobic002G091500--Sobic006G266850 Sobic002G091500--Sobic005G135300 Sobic008G174000 Sobic008G174000 Sobic002G091500--Sobic008G174000 Sobic002G091500--Sobic001G336600 Sobic002G091500--Sobic003G315000 Sobic002G091500--Sobic006G088450 Sobic002G091500--Sobic005G068400 Sobic009G069400 Sobic009G069400 Sobic002G091500--Sobic009G069400 Sobic004G295900--Sobic005G068400 Sobic004G295900--Sobic006G088450 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic004G295900--Sobic010G249600 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic004G295900--Sobic007G226000 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic004G295900--Sobic009G149600 Sobic004G295900--Sobic002G288500 Sobic004G295900--Sobic005G135300 Sobic001G033800 Sobic001G033800 Sobic004G295900--Sobic001G033800 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic004G295900--Sobic007G185000
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