Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G315000.4,Sobic.003G315000.3,Sobic.003G315000.5
Synonym Sb03g036260, HB54, ATHB54
Functional annotation homeobox-leucine zipper protein ATHB-54, putative, expressed
UniProt A0A1W0VZV8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G27050 : homeobox protein 54
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g56969.1 : homeobox-leucine zipper protein ATHB-54, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G076370.2 , HORVU3Hr1G076370.3 , HORVU3Hr1G076370.1 , HORVU3Hr1G076370.6 , HORVU3Hr1G076370.4 , HORVU3Hr1G076370.5
Wheat TraesCS3A02G319200 , TraesCS3B02G346900 , TraesCS3D02G312100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G315000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic003G315000 Sobic003G315000 Sobic006G266850 Sobic006G266850 Sobic003G315000--Sobic006G266850 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic003G315000--Sobic006G088450 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic003G315000--Sobic002G091500 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic003G315000--Sobic005G135300 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic003G315000--Sobic005G068400 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic003G315000--Sobic008G131601 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic003G315000--Sobic002G288500 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic003G315000--Sobic002G051500 Sobic002G176800 Sobic002G176800 Sobic003G315000--Sobic002G176800 Sobic006G266850--Sobic002G091500 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic006G266850--Sobic010G210050 Sobic006G246400 Sobic006G246400 Sobic006G266850--Sobic006G246400 Sobic006G266850--Sobic008G131601 Sobic006G266850--Sobic003G315000 Sobic006G266850--Sobic002G176800 Sobic006G266850--Sobic005G135300 Sobic006G266850--Sobic006G088450 Sobic010G196433 Sobic010G196433 Sobic006G266850--Sobic010G196433 Sobic006G088450--Sobic005G068400 Sobic006G088450--Sobic005G135300 Sobic006G088450--Sobic002G288500 Sobic006G088450--Sobic008G131601 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic006G088450--Sobic004G295900 Sobic006G088450--Sobic002G051500 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic006G088450--Sobic003G364550 Sobic006G088450--Sobic003G315000 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic006G088450--Sobic001G336600 Sobic002G091500--Sobic008G131601 Sobic002G091500--Sobic006G266850 Sobic002G091500--Sobic005G135300 Sobic008G174000 Sobic008G174000 Sobic002G091500--Sobic008G174000 Sobic002G091500--Sobic001G336600 Sobic002G091500--Sobic003G315000 Sobic002G091500--Sobic006G088450 Sobic002G091500--Sobic005G068400 Sobic009G069400 Sobic009G069400 Sobic002G091500--Sobic009G069400 Sobic005G135300--Sobic005G068400 Sobic005G135300--Sobic008G131601 Sobic005G135300--Sobic006G088450 Sobic005G135300--Sobic002G288500 Sobic005G135300--Sobic003G364550 Sobic005G135300--Sobic001G336600 Sobic005G135300--Sobic002G051500 Sobic005G135300--Sobic002G091500 Sobic005G135300--Sobic004G295900 Sobic005G068400--Sobic006G088450 Sobic005G068400--Sobic005G135300 Sobic005G068400--Sobic002G288500 Sobic005G068400--Sobic008G131601 Sobic005G068400--Sobic002G051500 Sobic005G068400--Sobic003G364550 Sobic005G068400--Sobic001G336600 Sobic005G068400--Sobic004G295900 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic005G068400--Sobic003G352750 Sobic008G131601--Sobic005G135300 Sobic008G131601--Sobic001G336600 Sobic008G131601--Sobic002G091500 Sobic008G131601--Sobic005G068400 Sobic008G131601--Sobic006G088450 Sobic008G131601--Sobic003G364550 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic008G131601--Sobic007G193900 Sobic008G131601--Sobic003G352750 Sobic008G131601--Sobic006G266850 Sobic002G288500--Sobic006G088450 Sobic002G288500--Sobic005G068400 Sobic002G288500--Sobic005G135300 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic002G288500--Sobic009G223000 Sobic002G288500--Sobic002G051500 Sobic002G288500--Sobic003G364550 Sobic002G288500--Sobic008G131601 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic002G288500--Sobic009G036366 Sobic002G288500--Sobic004G295900 Sobic002G051500--Sobic005G068400 Sobic002G051500--Sobic003G364550 Sobic002G051500--Sobic006G088450 Sobic002G051500--Sobic005G135300 Sobic002G051500--Sobic002G288500 Sobic003G035200 Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic008G131601 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic002G051500--Sobic007G072200 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic002G051500--Sobic009G240300 Sobic002G176800--Sobic010G210050 Sobic009G162550 Sobic009G162550 Sobic002G176800--Sobic009G162550 Sobic002G176800--Sobic006G266850 Sobic002G176800--Sobic005G135300 Sobic002G176800--Sobic008G131601 Sobic002G176800--Sobic010G196433 Sobic002G176800--Sobic009G036366 Sobic002G176800--Sobic006G088450 Sobic006G208700 Sobic006G208700 Sobic002G176800--Sobic006G208700
Octagon: transcription factors


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