Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G072200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PG58
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G241500 MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
2 Sobic.003G339400 RING-H2 finger protein ATL5G, putative, expressed -
3 Sobic.003G289300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G040950 - -
5 Sobic.004G338600 - -
6 Sobic.002G076200 - -
7 Sobic.009G240300 chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G494350 - -
9 Sobic.005G219800 - -
10 Sobic.009G258200 - -
11 Sobic.002G051500 expressed protein -
12 Sobic.005G219900 NB-ARC domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G205000 F-box/LRR-repeat protein 3, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
14 Sobic.007G090418 - -
15 Sobic.007G193900 expressed protein -
16 Sobic.006G144900 G-patch domain containing protein, putative, expressed K13103: tuftelin-interacting protein 11
17 Sobic.008G045900 - -
18 Sobic.005G106900 expressed protein K17757: ATP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase
19 Sobic.009G142600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cysteine-rich receptor-like protein kinase 6 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.008G147800 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic007G072200--Sobic001G241500 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic007G072200--Sobic003G339400 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic007G072200--Sobic003G289300 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic007G072200--Sobic005G040950 Sobic004G338600 Sobic004G338600 Sobic007G072200--Sobic004G338600 Sobic002G076200 Sobic002G076200 Sobic007G072200--Sobic002G076200 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic007G072200--Sobic009G240300 Sobic001G494350 Sobic001G494350 Sobic007G072200--Sobic001G494350 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic007G072200--Sobic005G219800 Sobic001G241500--Sobic005G040950 Sobic001G241500--Sobic003G289300 Sobic001G241500--Sobic007G072200 Sobic010G051900 Sobic010G051900 Sobic001G241500--Sobic010G051900 Sobic001G241500--Sobic003G339400 Sobic001G241500--Sobic001G494350 Sobic005G106900 Sobic005G106900 Sobic001G241500--Sobic005G106900 Sobic003G157800 Sobic003G157800 Sobic001G241500--Sobic003G157800 Sobic005G219900 Sobic005G219900 Sobic001G241500--Sobic005G219900 Sobic003G339400--Sobic005G219800 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic003G339400--Sobic009G258200 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic003G339400--Sobic005G205000 Sobic003G339400--Sobic003G289300 Sobic007G119400 Sobic007G119400 Sobic003G339400--Sobic007G119400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic003G339400--Sobic008G045900 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic003G339400--Sobic009G142600 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic003G339400--Sobic007G090418 Sobic003G339400--Sobic005G040950 Sobic003G289300--Sobic005G040950 Sobic003G289300--Sobic003G339400 Sobic003G289300--Sobic007G119400 Sobic001G437600 Sobic001G437600 Sobic003G289300--Sobic001G437600 Sobic003G289300--Sobic005G219800 Sobic003G289300--Sobic001G241500 Sobic003G289300--Sobic002G076200 Sobic003G289300--Sobic009G258200 Sobic003G289300--Sobic010G051900 Sobic005G040950--Sobic003G289300 Sobic005G040950--Sobic003G339400 Sobic005G040950--Sobic010G051900 Sobic005G040950--Sobic001G437600 Sobic005G040950--Sobic001G241500 Sobic005G040950--Sobic007G119400 Sobic005G040950--Sobic002G076200 Sobic005G040950--Sobic005G219800 Sobic005G040950--Sobic001G494350 Sobic004G338600--Sobic009G240300 Sobic004G338600--Sobic007G072200 Sobic001G035450 Sobic001G035450 Sobic004G338600--Sobic001G035450 Sobic004G338600--Sobic003G289300 Sobic004G338600--Sobic005G040950 Sobic004G338600--Sobic001G494350 Sobic004G338600--Sobic002G076200 Sobic004G338600--Sobic003G339400 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic004G338600--Sobic009G203600 Sobic002G076200--Sobic001G437600 Sobic002G076200--Sobic009G142600 Sobic002G076200--Sobic003G339400 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic002G076200--Sobic006G144900 Sobic002G076200--Sobic009G203600 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic002G076200--Sobic010G010100 Sobic002G076200--Sobic009G258200 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic002G076200--Sobic002G260500 Sobic002G076200--Sobic007G119400 Sobic009G240300--Sobic004G338600 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic009G240300--Sobic007G226000 Sobic009G240300--Sobic001G494350 Sobic009G240300--Sobic007G072200 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic009G240300--Sobic007G185000 Sobic003G035200 Sobic003G035200 Sobic009G240300--Sobic003G035200 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic009G240300--Sobic002G288500 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic009G240300--Sobic002G051500 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic009G240300--Sobic005G068400 Sobic001G494350--Sobic005G040950 Sobic001G494350--Sobic003G289300 Sobic001G494350--Sobic003G157800 Sobic001G494350--Sobic003G035200 Sobic001G494350--Sobic009G203600 Sobic001G494350--Sobic003G339400 Sobic001G494350--Sobic007G185000 Sobic001G494350--Sobic002G076200 Sobic001G494350--Sobic009G240300 Sobic005G219800--Sobic008G045900 Sobic005G219800--Sobic009G258200 Sobic005G219800--Sobic005G205000 Sobic005G219800--Sobic003G339400 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic005G219800--Sobic001G138500 Sobic005G219800--Sobic009G142600 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic005G219800--Sobic003G120050 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic005G219800--Sobic005G207550 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic005G219800--Sobic008G008701
Octagon: transcription factors


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