Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G240300.1,Sobic.009G240300.2
Synonym Sb09g029200
Functional annotation chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PA79
Pfam -
Panther DB PTHR31342 PTHR31342:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G18570 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g49820.1 : chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028233 , Zm00025a044651
Brachypodium PNT70674 , KQK04756 , KQK08986
Barley HORVU1Hr1G090530.2 , HORVU1Hr1G090530.3 , HORVU1Hr1G090530.1 , HORVU1Hr1G090530.6 , HORVU1Hr1G090530.7 , HORVU1Hr1G090530.4 , HORVU1Hr1G090530.5 , HORVU1Hr1G090530.8 , HORVU1Hr1G090530.9 , HORVU1Hr1G090530.10 , HORVU1Hr1G090530.11 , HORVU1Hr1G090530.12 , HORVU1Hr1G090530.13 , HORVU1Hr1G090530.14 , HORVU1Hr1G090530.15
Wheat TraesCS1A02G412100 , TraesCS1D02G419900 , TraesCS1D02G419900 , TraesCS1B02G442500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G240300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic004G338600 Sobic004G338600 Sobic009G240300--Sobic004G338600 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic009G240300--Sobic007G226000 Sobic001G494350 Sobic001G494350 Sobic009G240300--Sobic001G494350 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic009G240300--Sobic007G072200 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic009G240300--Sobic007G185000 Sobic003G035200 Sobic003G035200 Sobic009G240300--Sobic003G035200 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic009G240300--Sobic002G288500 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic009G240300--Sobic002G051500 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic009G240300--Sobic005G068400 Sobic004G338600--Sobic009G240300 Sobic004G338600--Sobic007G072200 Sobic001G035450 Sobic001G035450 Sobic004G338600--Sobic001G035450 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic004G338600--Sobic003G289300 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic004G338600--Sobic005G040950 Sobic004G338600--Sobic001G494350 Sobic002G076200 Sobic002G076200 Sobic004G338600--Sobic002G076200 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic004G338600--Sobic003G339400 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic004G338600--Sobic009G203600 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic007G226000--Sobic008G065700 Sobic007G226000--Sobic007G185000 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic007G226000--Sobic010G249600 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic007G226000--Sobic004G224000 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic007G226000--Sobic003G149400 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic007G226000--Sobic001G367900 Sobic007G226000--Sobic009G240300 Sobic003G440500 Sobic003G440500 Sobic007G226000--Sobic003G440500 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic007G226000--Sobic003G092150 Sobic001G494350--Sobic005G040950 Sobic001G494350--Sobic003G289300 Sobic003G157800 Sobic003G157800 Sobic001G494350--Sobic003G157800 Sobic001G494350--Sobic003G035200 Sobic001G494350--Sobic009G203600 Sobic001G494350--Sobic003G339400 Sobic001G494350--Sobic007G185000 Sobic001G494350--Sobic002G076200 Sobic001G494350--Sobic009G240300 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic007G072200--Sobic001G241500 Sobic007G072200--Sobic003G339400 Sobic007G072200--Sobic003G289300 Sobic007G072200--Sobic005G040950 Sobic007G072200--Sobic004G338600 Sobic007G072200--Sobic002G076200 Sobic007G072200--Sobic009G240300 Sobic007G072200--Sobic001G494350 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic007G072200--Sobic005G219800 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic007G185000--Sobic002G377400 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic007G185000--Sobic003G308900 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic007G185000--Sobic003G243750 Sobic007G185000--Sobic003G440500 Sobic007G185000--Sobic009G203600 Sobic007G165100 Sobic007G165100 Sobic007G185000--Sobic007G165100 Sobic007G185000--Sobic007G226000 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic007G185000--Sobic009G047033 Sobic007G185000--Sobic010G249600 Sobic003G035200--Sobic001G494350 Sobic003G035200--Sobic002G051500 Sobic003G035200--Sobic007G185000 Sobic003G035200--Sobic009G240300 Sobic003G035200--Sobic005G068400 Sobic003G035200--Sobic007G226000 Sobic003G035200--Sobic003G308900 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic003G035200--Sobic003G364550 Sobic003G035200--Sobic007G072200 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic002G288500--Sobic006G088450 Sobic002G288500--Sobic005G068400 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic002G288500--Sobic005G135300 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic002G288500--Sobic009G223000 Sobic002G288500--Sobic002G051500 Sobic002G288500--Sobic003G364550 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic002G288500--Sobic008G131601 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic002G288500--Sobic009G036366 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic002G288500--Sobic004G295900 Sobic002G051500--Sobic005G068400 Sobic002G051500--Sobic003G364550 Sobic002G051500--Sobic006G088450 Sobic002G051500--Sobic005G135300 Sobic002G051500--Sobic002G288500 Sobic002G051500--Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic008G131601 Sobic002G051500--Sobic007G072200 Sobic002G051500--Sobic009G240300 Sobic005G068400--Sobic006G088450 Sobic005G068400--Sobic005G135300 Sobic005G068400--Sobic002G288500 Sobic005G068400--Sobic008G131601 Sobic005G068400--Sobic002G051500 Sobic005G068400--Sobic003G364550 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic005G068400--Sobic001G336600 Sobic005G068400--Sobic004G295900 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic005G068400--Sobic003G352750
Octagon: transcription factors


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