Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G051900.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YHE1
Pfam PF04601
Panther DB PTHR31205 PTHR31205:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g06580.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041602 , Zm00025a041606 , Zm00025a041601
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G040950 - -
2 Sobic.008G119100 - -
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8 Sobic.003G157800 - -
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10 Sobic.001G494350 - -
11 Sobic.001G437600 - -
12 Sobic.007G185000 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
13 Sobic.005G201100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
14 Sobic.005G219900 NB-ARC domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G339400 RING-H2 finger protein ATL5G, putative, expressed -
16 Sobic.002G076200 - -
17 Sobic.005G106900 expressed protein K17757: ATP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase
18 Sobic.003G092150 - -
19 Sobic.007G072200 - -
20 Sobic.009G037600 RNA methyltransferase, TrmH family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G051900 Sobic010G051900 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic010G051900--Sobic005G040950 Sobic008G119100 Sobic008G119100 Sobic010G051900--Sobic008G119100 Sobic002G076450 Sobic002G076450 Sobic010G051900--Sobic002G076450 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic010G051900--Sobic009G047033 Sobic010G051600 Sobic010G051600 Sobic010G051900--Sobic010G051600 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic010G051900--Sobic003G289300 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic010G051900--Sobic001G241500 Sobic003G157800 Sobic003G157800 Sobic010G051900--Sobic003G157800 Sobic001G524900 Sobic001G524900 Sobic010G051900--Sobic001G524900 Sobic005G040950--Sobic003G289300 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic005G040950--Sobic003G339400 Sobic005G040950--Sobic010G051900 Sobic001G437600 Sobic001G437600 Sobic005G040950--Sobic001G437600 Sobic005G040950--Sobic001G241500 Sobic007G119400 Sobic007G119400 Sobic005G040950--Sobic007G119400 Sobic002G076200 Sobic002G076200 Sobic005G040950--Sobic002G076200 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic005G040950--Sobic005G219800 Sobic001G494350 Sobic001G494350 Sobic005G040950--Sobic001G494350 Sobic008G119100--Sobic002G076450 Sobic008G119100--Sobic010G051900 Sobic008G119100--Sobic001G524900 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic008G119100--Sobic001G367900 Sobic003G331200 Sobic003G331200 Sobic008G119100--Sobic003G331200 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic008G119100--Sobic003G092150 Sobic008G119100--Sobic005G040950 Sobic008G119100--Sobic009G047033 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic008G119100--Sobic007G226000 Sobic002G076450--Sobic008G119100 Sobic002G076450--Sobic010G051900 Sobic002G076450--Sobic009G047033 Sobic005G201100 Sobic005G201100 Sobic002G076450--Sobic005G201100 Sobic002G076450--Sobic001G524900 Sobic002G076450--Sobic005G040950 Sobic006G128450 Sobic006G128450 Sobic002G076450--Sobic006G128450 Sobic002G076450--Sobic003G092150 Sobic002G076450--Sobic003G289300 Sobic009G047033--Sobic010G051600 Sobic009G047033--Sobic010G051900 Sobic003G091900 Sobic003G091900 Sobic009G047033--Sobic003G091900 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic009G047033--Sobic007G185000 Sobic009G047033--Sobic002G076450 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic009G047033--Sobic004G343733 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic009G047033--Sobic003G308900 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic009G047033--Sobic010G213100 Sobic009G047033--Sobic003G092150 Sobic010G051600--Sobic009G047033 Sobic010G051600--Sobic001G437600 Sobic010G051600--Sobic010G051900 Sobic010G051600--Sobic002G076200 Sobic010G051600--Sobic005G040950 Sobic005G106900 Sobic005G106900 Sobic010G051600--Sobic005G106900 Sobic010G051600--Sobic007G185000 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic010G051600--Sobic010G010100 Sobic005G059300 Sobic005G059300 Sobic010G051600--Sobic005G059300 Sobic003G289300--Sobic005G040950 Sobic003G289300--Sobic003G339400 Sobic003G289300--Sobic007G119400 Sobic003G289300--Sobic001G437600 Sobic003G289300--Sobic005G219800 Sobic003G289300--Sobic001G241500 Sobic003G289300--Sobic002G076200 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic003G289300--Sobic009G258200 Sobic003G289300--Sobic010G051900 Sobic001G241500--Sobic005G040950 Sobic001G241500--Sobic003G289300 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic001G241500--Sobic007G072200 Sobic001G241500--Sobic010G051900 Sobic001G241500--Sobic003G339400 Sobic001G241500--Sobic001G494350 Sobic001G241500--Sobic005G106900 Sobic001G241500--Sobic003G157800 Sobic005G219900 Sobic005G219900 Sobic001G241500--Sobic005G219900 Sobic003G157800--Sobic005G040950 Sobic003G157800--Sobic001G494350 Sobic003G157800--Sobic001G437600 Sobic003G157800--Sobic003G289300 Sobic003G157800--Sobic005G106900 Sobic006G102600 Sobic006G102600 Sobic003G157800--Sobic006G102600 Sobic003G157800--Sobic003G339400 Sobic003G157800--Sobic001G241500 Sobic003G157800--Sobic010G051900 Sobic001G524900--Sobic008G119100 Sobic001G524900--Sobic002G076450 Sobic001G524900--Sobic010G051900 Sobic002G227100 Sobic002G227100 Sobic001G524900--Sobic002G227100 Sobic007G174200 Sobic007G174200 Sobic001G524900--Sobic007G174200 Sobic001G524900--Sobic001G367900 Sobic010G242000 Sobic010G242000 Sobic001G524900--Sobic010G242000 Sobic001G524900--Sobic009G047033 Sobic006G152801 Sobic006G152801 Sobic001G524900--Sobic006G152801
Octagon: transcription factors


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