Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G339400.1
Synonym Sb03g038350
Functional annotation RING-H2 finger protein ATL5G, putative, expressed
UniProt C5XNB7
Pfam PF13639
Panther DB PTHR15710
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G09100 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g57460.1 : RING-H2 finger protein ATL5G, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.004G162800 - -
20 Sobic.003G190701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic003G339400--Sobic005G219800 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic003G339400--Sobic009G258200 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic003G339400--Sobic005G205000 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic003G339400--Sobic003G289300 Sobic007G119400 Sobic007G119400 Sobic003G339400--Sobic007G119400 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic003G339400--Sobic008G045900 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic003G339400--Sobic009G142600 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic003G339400--Sobic007G090418 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic003G339400--Sobic005G040950 Sobic005G219800--Sobic008G045900 Sobic005G219800--Sobic009G258200 Sobic005G219800--Sobic005G205000 Sobic005G219800--Sobic003G339400 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic005G219800--Sobic001G138500 Sobic005G219800--Sobic009G142600 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic005G219800--Sobic003G120050 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic005G219800--Sobic005G207550 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic005G219800--Sobic008G008701 Sobic009G258200--Sobic008G045900 Sobic009G258200--Sobic009G142600 Sobic009G258200--Sobic005G205000 Sobic003G083100 Sobic003G083100 Sobic009G258200--Sobic003G083100 Sobic005G120433 Sobic005G120433 Sobic009G258200--Sobic005G120433 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic009G258200--Sobic008G045100 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic009G258200--Sobic001G234700 Sobic005G205000--Sobic008G045900 Sobic005G205000--Sobic009G142600 Sobic005G205000--Sobic009G258200 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic005G205000--Sobic002G063500 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic005G205000--Sobic004G090900 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic005G205000--Sobic006G258200 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic005G205000--Sobic005G014600 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic005G205000--Sobic001G045300 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic005G205000--Sobic002G084100 Sobic003G289300--Sobic005G040950 Sobic003G289300--Sobic003G339400 Sobic003G289300--Sobic007G119400 Sobic001G437600 Sobic001G437600 Sobic003G289300--Sobic001G437600 Sobic003G289300--Sobic005G219800 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic003G289300--Sobic001G241500 Sobic002G076200 Sobic002G076200 Sobic003G289300--Sobic002G076200 Sobic003G289300--Sobic009G258200 Sobic010G051900 Sobic010G051900 Sobic003G289300--Sobic010G051900 Sobic007G119400--Sobic003G339400 Sobic007G119400--Sobic009G142600 Sobic007G119400--Sobic008G045900 Sobic007G119400--Sobic005G205000 Sobic007G119400--Sobic009G258200 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic007G119400--Sobic010G010100 Sobic010G103300 Sobic010G103300 Sobic007G119400--Sobic010G103300 Sobic007G119400--Sobic006G258200 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic007G119400--Sobic008G053700 Sobic008G045900--Sobic001G138500 Sobic008G045900--Sobic001G045300 Sobic008G045900--Sobic004G090900 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic008G045900--Sobic007G027400 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic008G045900--Sobic002G046500 Sobic008G045900--Sobic008G008701 Sobic008G045900--Sobic002G084100 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G045900--Sobic001G033701 Sobic008G045900--Sobic009G142600 Sobic009G142600--Sobic008G045900 Sobic009G142600--Sobic008G053700 Sobic009G142600--Sobic006G258200 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic009G142600--Sobic001G160300 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic009G142600--Sobic008G069901 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic009G142600--Sobic003G046000 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic009G142600--Sobic009G113300 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic009G142600--Sobic010G081500 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic009G142600--Sobic004G184900 Sobic008G078966 Sobic008G078966 Sobic007G090418--Sobic008G078966 Sobic007G090418--Sobic008G045900 Sobic007G090418--Sobic009G258200 Sobic007G090418--Sobic009G142600 Sobic007G090418--Sobic001G234700 Sobic005G040950--Sobic003G289300 Sobic005G040950--Sobic003G339400 Sobic005G040950--Sobic010G051900 Sobic005G040950--Sobic001G437600 Sobic005G040950--Sobic001G241500 Sobic005G040950--Sobic007G119400 Sobic005G040950--Sobic002G076200 Sobic005G040950--Sobic005G219800 Sobic001G494350 Sobic001G494350 Sobic005G040950--Sobic001G494350
Octagon: transcription factors


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