Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G205000.3,Sobic.005G205000.1
Synonym Sb05g026000
Functional annotation F-box/LRR-repeat protein 3, putative, expressed
UniProt C6JSC3 , A0A1B6PTQ8
Pfam -
Panther DB PTHR24006 PTHR24006:SF442
NCBI CDD KOG1947; Leucine rich repeat proteins, some proteins contain F-box
KEGG Orthology K10268; F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G27920 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g36670.1 : F-box/LRR-repeat protein 3, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054317 , Zm00025a029189
Brachypodium KQJ86395
Barley HORVU5Hr1G024060.3 , HORVU5Hr1G024060.2 , HORVU5Hr1G024060.1 , HORVU5Hr1G024060.5 , HORVU5Hr1G024060.4
Wheat TraesCS5B02G097800 , TraesCS5B02G097800 , TraesCS5A02G091800 , TraesCS5A02G091800 , TraesCS5A02G091800 , TraesCS5D02G103900 , TraesCS5D02G103900 , TraesCS5D02G103900 , TraesCS5D02G103900 , TraesCS5D02G103900 , TraesCS5D02G103900 , TraesCS5D02G103900
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G159800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic005G205000--Sobic008G045900 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic005G205000--Sobic009G142600 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic005G205000--Sobic009G258200 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic005G205000--Sobic002G063500 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic005G205000--Sobic004G090900 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic005G205000--Sobic006G258200 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic005G205000--Sobic005G014600 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic005G205000--Sobic001G045300 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic005G205000--Sobic002G084100 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic008G045900--Sobic001G138500 Sobic008G045900--Sobic001G045300 Sobic008G045900--Sobic004G090900 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic008G045900--Sobic007G027400 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic008G045900--Sobic002G046500 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic008G045900--Sobic008G008701 Sobic008G045900--Sobic002G084100 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G045900--Sobic001G033701 Sobic008G045900--Sobic009G142600 Sobic009G142600--Sobic008G045900 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic009G142600--Sobic008G053700 Sobic009G142600--Sobic006G258200 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic009G142600--Sobic001G160300 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic009G142600--Sobic008G069901 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic009G142600--Sobic003G046000 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic009G142600--Sobic009G113300 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic009G142600--Sobic010G081500 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic009G142600--Sobic004G184900 Sobic009G258200--Sobic008G045900 Sobic009G258200--Sobic009G142600 Sobic009G258200--Sobic005G205000 Sobic003G083100 Sobic003G083100 Sobic009G258200--Sobic003G083100 Sobic005G120433 Sobic005G120433 Sobic009G258200--Sobic005G120433 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic009G258200--Sobic008G045100 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic009G258200--Sobic001G234700 Sobic002G063500--Sobic008G069901 Sobic002G063500--Sobic001G160300 Sobic002G063500--Sobic003G046000 Sobic002G063500--Sobic004G184900 Sobic002G063500--Sobic009G113300 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic002G063500--Sobic006G004700 Sobic002G063500--Sobic005G014600 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic002G063500--Sobic002G289601 Sobic002G063500--Sobic010G081500 Sobic004G090900--Sobic002G046500 Sobic004G090900--Sobic001G045300 Sobic004G090900--Sobic007G027400 Sobic004G090900--Sobic008G008701 Sobic004G090900--Sobic002G084100 Sobic004G090900--Sobic005G014600 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic004G090900--Sobic004G122700 Sobic004G090900--Sobic001G033701 Sobic003G245101 Sobic003G245101 Sobic004G090900--Sobic003G245101 Sobic006G258200--Sobic010G081500 Sobic006G258200--Sobic009G113300 Sobic006G258200--Sobic001G160300 Sobic006G258200--Sobic002G289601 Sobic009G159800 Sobic009G159800 Sobic006G258200--Sobic009G159800 Sobic006G258200--Sobic003G046000 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic006G258200--Sobic006G076700 Sobic006G258200--Sobic002G084100 Sobic006G258200--Sobic008G069901 Sobic005G014600--Sobic002G289601 Sobic005G014600--Sobic009G113300 Sobic005G014600--Sobic002G084100 Sobic005G014600--Sobic010G081500 Sobic005G014600--Sobic002G046500 Sobic005G014600--Sobic003G245101 Sobic005G014600--Sobic004G090900 Sobic005G014600--Sobic009G159800 Sobic005G014600--Sobic008G069901 Sobic001G045300--Sobic007G027400 Sobic001G045300--Sobic002G046500 Sobic001G045300--Sobic004G090900 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic001G045300--Sobic001G358101 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic001G045300--Sobic004G162800 Sobic001G045300--Sobic003G245101 Sobic001G045300--Sobic002G084100 Sobic001G045300--Sobic008G008701 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic001G045300--Sobic003G190701 Sobic002G084100--Sobic003G245101 Sobic002G084100--Sobic002G289601 Sobic002G084100--Sobic009G159800 Sobic002G084100--Sobic004G162800 Sobic002G084100--Sobic010G081500 Sobic002G084100--Sobic002G046500 Sobic002G084100--Sobic009G113300 Sobic002G084100--Sobic001G358101 Sobic002G084100--Sobic005G014600
Octagon: transcription factors


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