Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G119400.1
Synonym Sb07g019480
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YKN0
Pfam -
Panther DB PTHR35757
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19540 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g29780.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006025
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7A02G287200 , TraesCS7D02G287500 , TraesCS7B02G185500 , TraesCS7B02G185500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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12 Sobic.003G046000 - -
13 Sobic.006G076700 - -
14 Sobic.002G084100 - -
15 Sobic.010G081500 - -
16 Sobic.005G041700 - -
17 Sobic.009G113300 - -
18 Sobic.001G160300 - -
19 Sobic.005G029866 - -
20 Sobic.008G069901 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G119400 Sobic007G119400 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic007G119400--Sobic003G339400 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic007G119400--Sobic009G142600 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic007G119400--Sobic008G045900 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic007G119400--Sobic005G205000 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic007G119400--Sobic009G258200 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic007G119400--Sobic010G010100 Sobic010G103300 Sobic010G103300 Sobic007G119400--Sobic010G103300 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic007G119400--Sobic006G258200 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic007G119400--Sobic008G053700 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic003G339400--Sobic005G219800 Sobic003G339400--Sobic009G258200 Sobic003G339400--Sobic005G205000 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic003G339400--Sobic003G289300 Sobic003G339400--Sobic007G119400 Sobic003G339400--Sobic008G045900 Sobic003G339400--Sobic009G142600 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic003G339400--Sobic007G090418 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic003G339400--Sobic005G040950 Sobic009G142600--Sobic008G045900 Sobic009G142600--Sobic008G053700 Sobic009G142600--Sobic006G258200 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic009G142600--Sobic001G160300 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic009G142600--Sobic008G069901 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic009G142600--Sobic003G046000 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic009G142600--Sobic009G113300 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic009G142600--Sobic010G081500 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic009G142600--Sobic004G184900 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic008G045900--Sobic001G138500 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic008G045900--Sobic001G045300 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic008G045900--Sobic004G090900 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic008G045900--Sobic007G027400 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic008G045900--Sobic002G046500 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic008G045900--Sobic008G008701 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic008G045900--Sobic002G084100 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G045900--Sobic001G033701 Sobic008G045900--Sobic009G142600 Sobic005G205000--Sobic008G045900 Sobic005G205000--Sobic009G142600 Sobic005G205000--Sobic009G258200 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic005G205000--Sobic002G063500 Sobic005G205000--Sobic004G090900 Sobic005G205000--Sobic006G258200 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic005G205000--Sobic005G014600 Sobic005G205000--Sobic001G045300 Sobic005G205000--Sobic002G084100 Sobic009G258200--Sobic008G045900 Sobic009G258200--Sobic009G142600 Sobic009G258200--Sobic005G205000 Sobic003G083100 Sobic003G083100 Sobic009G258200--Sobic003G083100 Sobic005G120433 Sobic005G120433 Sobic009G258200--Sobic005G120433 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic009G258200--Sobic008G045100 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic009G258200--Sobic001G234700 Sobic005G059300 Sobic005G059300 Sobic010G010100--Sobic005G059300 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic010G010100--Sobic010G091750 Sobic010G010100--Sobic009G142600 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic010G010100--Sobic002G103400 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic010G010100--Sobic005G144101 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic010G010100--Sobic007G087500 Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic010G010100--Sobic010G273200 Sobic010G010100--Sobic008G053700 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic010G010100--Sobic006G004700 Sobic010G103300--Sobic008G053700 Sobic010G103300--Sobic006G004700 Sobic010G103300--Sobic003G046000 Sobic010G103300--Sobic008G069901 Sobic010G103300--Sobic004G184900 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic010G103300--Sobic001G452300 Sobic010G103300--Sobic002G063500 Sobic010G103300--Sobic007G087500 Sobic010G103300--Sobic009G113300 Sobic006G258200--Sobic010G081500 Sobic006G258200--Sobic009G113300 Sobic006G258200--Sobic001G160300 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic006G258200--Sobic002G289601 Sobic009G159800 Sobic009G159800 Sobic006G258200--Sobic009G159800 Sobic006G258200--Sobic003G046000 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic006G258200--Sobic006G076700 Sobic006G258200--Sobic002G084100 Sobic006G258200--Sobic008G069901 Sobic008G053700--Sobic006G004700 Sobic008G053700--Sobic003G046000 Sobic008G053700--Sobic008G069901 Sobic008G053700--Sobic004G184900 Sobic008G053700--Sobic006G076700 Sobic008G053700--Sobic007G087500 Sobic008G053700--Sobic002G063500 Sobic008G053700--Sobic001G160300 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic008G053700--Sobic004G173800
Octagon: transcription factors


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