Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G035200.3,Sobic.003G035200.2,Sobic.003G035200.1,Sobic.003G035200.5,Sobic.003G035200.4,Sobic.003G035200.6
Synonym PRF3, PFN3
Functional annotation profilin domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q155 , A0A1B6Q133 , A0A1B6Q143 , A0A1W0VVI9
Pfam PF00235
Panther DB PTHR11604 PTHR11604:SF7
NCBI CDD KOG1755; Profilin
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G19770 : profilin 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g05880.1 : profilin domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK03116 , KQK03115
Barley HORVU7Hr1G040070.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G494350 - -
2 Sobic.002G051500 expressed protein -
3 Sobic.007G185000 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
4 Sobic.009G240300 chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G068400 - -
6 Sobic.007G226000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@2-aminoethanethiol dioxygenase, putative, expressed K10712: cysteamine dioxygenase
7 Sobic.003G308900 expressed protein -
8 Sobic.003G364550 - -
9 Sobic.007G072200 - -
10 Sobic.003G157800 - -
11 Sobic.006G088450 - -
12 Sobic.003G092150 - -
13 Sobic.009G203600 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@Receptor-like protein kinase HSL1(PubMedID : 31721651)@receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.009G047033 - -
15 Sobic.010G051900 expressed protein -
16 Sobic.001G241500 MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
17 Sobic.005G135300 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed -
18 Sobic.002G076200 - -
19 Sobic.004G338600 - -
20 Sobic.010G051600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G035200 Sobic003G035200 Sobic001G494350 Sobic001G494350 Sobic003G035200--Sobic001G494350 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic003G035200--Sobic002G051500 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic003G035200--Sobic007G185000 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic003G035200--Sobic009G240300 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic003G035200--Sobic005G068400 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic003G035200--Sobic007G226000 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic003G035200--Sobic003G308900 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic003G035200--Sobic003G364550 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic003G035200--Sobic007G072200 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic001G494350--Sobic005G040950 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic001G494350--Sobic003G289300 Sobic003G157800 Sobic003G157800 Sobic001G494350--Sobic003G157800 Sobic001G494350--Sobic003G035200 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic001G494350--Sobic009G203600 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic001G494350--Sobic003G339400 Sobic001G494350--Sobic007G185000 Sobic002G076200 Sobic002G076200 Sobic001G494350--Sobic002G076200 Sobic001G494350--Sobic009G240300 Sobic002G051500--Sobic005G068400 Sobic002G051500--Sobic003G364550 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic002G051500--Sobic006G088450 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic002G051500--Sobic005G135300 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic002G051500--Sobic002G288500 Sobic002G051500--Sobic003G035200 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic002G051500--Sobic008G131601 Sobic002G051500--Sobic007G072200 Sobic002G051500--Sobic009G240300 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic007G185000--Sobic002G377400 Sobic007G185000--Sobic003G308900 Sobic003G243750 Sobic003G243750 Sobic007G185000--Sobic003G243750 Sobic003G440500 Sobic003G440500 Sobic007G185000--Sobic003G440500 Sobic007G185000--Sobic009G203600 Sobic007G165100 Sobic007G165100 Sobic007G185000--Sobic007G165100 Sobic007G185000--Sobic007G226000 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic007G185000--Sobic009G047033 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic007G185000--Sobic010G249600 Sobic004G338600 Sobic004G338600 Sobic009G240300--Sobic004G338600 Sobic009G240300--Sobic007G226000 Sobic009G240300--Sobic001G494350 Sobic009G240300--Sobic007G072200 Sobic009G240300--Sobic007G185000 Sobic009G240300--Sobic003G035200 Sobic009G240300--Sobic002G288500 Sobic009G240300--Sobic002G051500 Sobic009G240300--Sobic005G068400 Sobic005G068400--Sobic006G088450 Sobic005G068400--Sobic005G135300 Sobic005G068400--Sobic002G288500 Sobic005G068400--Sobic008G131601 Sobic005G068400--Sobic002G051500 Sobic005G068400--Sobic003G364550 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic005G068400--Sobic001G336600 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic005G068400--Sobic004G295900 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic005G068400--Sobic003G352750 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic007G226000--Sobic008G065700 Sobic007G226000--Sobic007G185000 Sobic007G226000--Sobic010G249600 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic007G226000--Sobic004G224000 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic007G226000--Sobic003G149400 Sobic001G367900 Sobic001G367900 Sobic007G226000--Sobic001G367900 Sobic007G226000--Sobic009G240300 Sobic007G226000--Sobic003G440500 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic007G226000--Sobic003G092150 Sobic003G308900--Sobic002G377400 Sobic003G308900--Sobic007G185000 Sobic003G308900--Sobic010G249600 Sobic003G308900--Sobic003G440500 Sobic002G296800 Sobic002G296800 Sobic003G308900--Sobic002G296800 Sobic005G090700 Sobic005G090700 Sobic003G308900--Sobic005G090700 Sobic003G308900--Sobic003G243750 Sobic003G308900--Sobic008G065700 Sobic008G159800 Sobic008G159800 Sobic003G308900--Sobic008G159800 Sobic003G364550--Sobic001G336600 Sobic003G364550--Sobic005G135300 Sobic003G364550--Sobic005G068400 Sobic003G364550--Sobic008G131601 Sobic003G364550--Sobic002G051500 Sobic003G364550--Sobic006G088450 Sobic003G364550--Sobic002G288500 Sobic003G364550--Sobic002G296800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic003G364550--Sobic010G025200 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic007G072200--Sobic001G241500 Sobic007G072200--Sobic003G339400 Sobic007G072200--Sobic003G289300 Sobic007G072200--Sobic005G040950 Sobic007G072200--Sobic004G338600 Sobic007G072200--Sobic002G076200 Sobic007G072200--Sobic009G240300 Sobic007G072200--Sobic001G494350 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic007G072200--Sobic005G219800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.