Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G035450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S4Q7
Pfam PF05553
Panther DB PTHR33098:SF15 PTHR33098
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g03400.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040355
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G081100 - -
2 Sobic.004G338600 - -
3 Sobic.005G061300 - -
4 Sobic.003G289300 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G339400 RING-H2 finger protein ATL5G, putative, expressed -
6 Sobic.005G040950 - -
7 Sobic.009G240300 chloroplast unusual positioning protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G333150 - -
9 Sobic.007G072200 - -
10 Sobic.001G533600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G119400 expressed protein -
12 Sobic.006G029900 nucampholin, putative, expressed K13100: pre-mRNA-splicing factor CWC22
13 Sobic.009G258200 - -
14 Sobic.005G219800 - -
15 Sobic.008G045900 - -
16 Sobic.003G210701 - -
17 Sobic.006G144900 G-patch domain containing protein, putative, expressed K13103: tuftelin-interacting protein 11
18 Sobic.002G345100 expressed protein -
19 Sobic.007G090418 - -
20 Sobic.001G494350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G035450 Sobic001G035450 Sobic005G081100 Sobic005G081100 Sobic001G035450--Sobic005G081100 Sobic004G338600 Sobic004G338600 Sobic001G035450--Sobic004G338600 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic001G035450--Sobic005G061300 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic001G035450--Sobic003G289300 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic001G035450--Sobic003G339400 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic001G035450--Sobic005G040950 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic001G035450--Sobic009G240300 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic001G035450--Sobic003G333150 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic001G035450--Sobic007G072200 Sobic006G029900 Sobic006G029900 Sobic005G081100--Sobic006G029900 Sobic005G081100--Sobic001G035450 Sobic005G081100--Sobic005G061300 Sobic005G081100--Sobic003G333150 Sobic001G533600 Sobic001G533600 Sobic005G081100--Sobic001G533600 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic005G081100--Sobic010G025200 Sobic005G135500 Sobic005G135500 Sobic005G081100--Sobic005G135500 Sobic005G225700 Sobic005G225700 Sobic005G081100--Sobic005G225700 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic005G081100--Sobic003G002800 Sobic004G338600--Sobic009G240300 Sobic004G338600--Sobic007G072200 Sobic004G338600--Sobic001G035450 Sobic004G338600--Sobic003G289300 Sobic004G338600--Sobic005G040950 Sobic001G494350 Sobic001G494350 Sobic004G338600--Sobic001G494350 Sobic002G076200 Sobic002G076200 Sobic004G338600--Sobic002G076200 Sobic004G338600--Sobic003G339400 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic004G338600--Sobic009G203600 Sobic005G061300--Sobic003G333150 Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic005G061300--Sobic005G114000 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic005G061300--Sobic006G144900 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic005G061300--Sobic008G045900 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic005G061300--Sobic002G345100 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic005G061300--Sobic001G001000 Sobic005G061300--Sobic003G002800 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic005G061300--Sobic003G210701 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic005G061300--Sobic002G067050 Sobic003G289300--Sobic005G040950 Sobic003G289300--Sobic003G339400 Sobic007G119400 Sobic007G119400 Sobic003G289300--Sobic007G119400 Sobic001G437600 Sobic001G437600 Sobic003G289300--Sobic001G437600 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic003G289300--Sobic005G219800 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic003G289300--Sobic001G241500 Sobic003G289300--Sobic002G076200 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic003G289300--Sobic009G258200 Sobic010G051900 Sobic010G051900 Sobic003G289300--Sobic010G051900 Sobic003G339400--Sobic005G219800 Sobic003G339400--Sobic009G258200 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic003G339400--Sobic005G205000 Sobic003G339400--Sobic003G289300 Sobic003G339400--Sobic007G119400 Sobic003G339400--Sobic008G045900 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic003G339400--Sobic009G142600 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic003G339400--Sobic007G090418 Sobic003G339400--Sobic005G040950 Sobic005G040950--Sobic003G289300 Sobic005G040950--Sobic003G339400 Sobic005G040950--Sobic010G051900 Sobic005G040950--Sobic001G437600 Sobic005G040950--Sobic001G241500 Sobic005G040950--Sobic007G119400 Sobic005G040950--Sobic002G076200 Sobic005G040950--Sobic005G219800 Sobic005G040950--Sobic001G494350 Sobic009G240300--Sobic004G338600 Sobic007G226000 Sobic007G226000 Sobic009G240300--Sobic007G226000 Sobic009G240300--Sobic001G494350 Sobic009G240300--Sobic007G072200 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic009G240300--Sobic007G185000 Sobic003G035200 Sobic003G035200 Sobic009G240300--Sobic003G035200 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic009G240300--Sobic002G288500 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic009G240300--Sobic002G051500 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic009G240300--Sobic005G068400 Sobic003G333150--Sobic005G061300 Sobic003G333150--Sobic006G144900 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic003G333150--Sobic008G045300 Sobic003G333150--Sobic002G345100 Sobic003G333150--Sobic005G114000 Sobic003G333150--Sobic003G002800 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic003G333150--Sobic004G293600 Sobic003G333150--Sobic010G025200 Sobic003G333150--Sobic009G203600 Sobic007G072200--Sobic001G241500 Sobic007G072200--Sobic003G339400 Sobic007G072200--Sobic003G289300 Sobic007G072200--Sobic005G040950 Sobic007G072200--Sobic004G338600 Sobic007G072200--Sobic002G076200 Sobic007G072200--Sobic009G240300 Sobic007G072200--Sobic001G494350 Sobic007G072200--Sobic005G219800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.