Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G029900.1
Synonym Sb06g003080
Functional annotation nucampholin, putative, expressed
UniProt C5YD66
Pfam PF02847
Panther DB PTHR18034 PTHR18034:SF3
NCBI CDD KOG2140; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology K13100; pre-mRNA-splicing factor CWC22
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G80930 : MIF4G domain-containing protein / MA3 domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g15420.1 : nucampholin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic006G029900 Sobic006G029900 Sobic005G081100 Sobic005G081100 Sobic006G029900--Sobic005G081100 Sobic006G198200 Sobic006G198200 Sobic006G029900--Sobic006G198200 Sobic007G139800 Sobic007G139800 Sobic006G029900--Sobic007G139800 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic006G029900--Sobic005G061300 Sobic001G035450 Sobic001G035450 Sobic006G029900--Sobic001G035450 Sobic001G223000 Sobic001G223000 Sobic006G029900--Sobic001G223000 Sobic001G533600 Sobic001G533600 Sobic006G029900--Sobic001G533600 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic006G029900--Sobic010G025200 Sobic004G312900 Sobic004G312900 Sobic006G029900--Sobic004G312900 Sobic005G081100--Sobic006G029900 Sobic005G081100--Sobic001G035450 Sobic005G081100--Sobic005G061300 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic005G081100--Sobic003G333150 Sobic005G081100--Sobic001G533600 Sobic005G081100--Sobic010G025200 Sobic005G135500 Sobic005G135500 Sobic005G081100--Sobic005G135500 Sobic005G225700 Sobic005G225700 Sobic005G081100--Sobic005G225700 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic005G081100--Sobic003G002800 Sobic003G184600 Sobic003G184600 Sobic006G198200--Sobic003G184600 Sobic004G304900 Sobic004G304900 Sobic006G198200--Sobic004G304900 Sobic006G198200--Sobic001G533600 Sobic006G198200--Sobic010G025200 Sobic006G198200--Sobic003G333150 Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic006G198200--Sobic005G114000 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic006G198200--Sobic010G265100 Sobic009G020200 Sobic009G020200 Sobic006G198200--Sobic009G020200 Sobic001G190700 Sobic001G190700 Sobic006G198200--Sobic001G190700 Sobic002G349800 Sobic002G349800 Sobic007G139800--Sobic002G349800 Sobic009G017300 Sobic009G017300 Sobic007G139800--Sobic009G017300 Sobic009G239000 Sobic009G239000 Sobic007G139800--Sobic009G239000 Sobic002G069232 Sobic002G069232 Sobic007G139800--Sobic002G069232 Sobic008G116900 Sobic008G116900 Sobic007G139800--Sobic008G116900 Sobic004G303150 Sobic004G303150 Sobic007G139800--Sobic004G303150 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic007G139800--Sobic004G133800 Sobic010G172666 Sobic010G172666 Sobic007G139800--Sobic010G172666 Sobic001G493600 Sobic001G493600 Sobic007G139800--Sobic001G493600 Sobic005G061300--Sobic003G333150 Sobic005G061300--Sobic005G114000 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic005G061300--Sobic006G144900 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic005G061300--Sobic008G045900 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic005G061300--Sobic002G345100 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic005G061300--Sobic001G001000 Sobic005G061300--Sobic003G002800 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic005G061300--Sobic003G210701 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic005G061300--Sobic002G067050 Sobic001G035450--Sobic005G081100 Sobic004G338600 Sobic004G338600 Sobic001G035450--Sobic004G338600 Sobic001G035450--Sobic005G061300 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic001G035450--Sobic003G289300 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic001G035450--Sobic003G339400 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic001G035450--Sobic005G040950 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic001G035450--Sobic009G240300 Sobic001G035450--Sobic003G333150 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic001G035450--Sobic007G072200 Sobic001G223000--Sobic010G025200 Sobic006G102600 Sobic006G102600 Sobic001G223000--Sobic006G102600 Sobic006G077100 Sobic006G077100 Sobic001G223000--Sobic006G077100 Sobic003G323750 Sobic003G323750 Sobic001G223000--Sobic003G323750 Sobic006G077900 Sobic006G077900 Sobic001G223000--Sobic006G077900 Sobic003G201800 Sobic003G201800 Sobic001G223000--Sobic003G201800 Sobic006G138700 Sobic006G138700 Sobic001G223000--Sobic006G138700 Sobic001G223000--Sobic007G139800 Sobic002G277366 Sobic002G277366 Sobic001G223000--Sobic002G277366 Sobic001G533600--Sobic005G114000 Sobic001G533600--Sobic005G061300 Sobic003G008100 Sobic003G008100 Sobic001G533600--Sobic003G008100 Sobic001G533600--Sobic003G333150 Sobic008G183900 Sobic008G183900 Sobic001G533600--Sobic008G183900 Sobic008G172400 Sobic008G172400 Sobic001G533600--Sobic008G172400 Sobic001G533600--Sobic010G025200 Sobic001G533600--Sobic006G144900 Sobic001G533600--Sobic006G198200 Sobic010G025200--Sobic006G144900 Sobic010G025200--Sobic003G333150 Sobic010G025200--Sobic005G114000 Sobic010G025200--Sobic005G061300 Sobic003G387400 Sobic003G387400 Sobic010G025200--Sobic003G387400 Sobic010G025200--Sobic003G002800 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic010G025200--Sobic002G260500 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic010G025200--Sobic009G160900 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic010G025200--Sobic005G005100 Sobic004G312900--Sobic002G349800 Sobic004G312900--Sobic007G139800 Sobic010G062600 Sobic010G062600 Sobic004G312900--Sobic010G062600 Sobic008G183800 Sobic008G183800 Sobic004G312900--Sobic008G183800 Sobic004G312900--Sobic009G017300 Sobic010G247900 Sobic010G247900 Sobic004G312900--Sobic010G247900 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic004G312900--Sobic007G119101 Sobic009G044501 Sobic009G044501 Sobic004G312900--Sobic009G044501 Sobic004G312900--Sobic004G133800
Octagon: transcription factors


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