Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G312900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YSG6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044082
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G068130.1 , HORVU1Hr1G068130.3 , HORVU1Hr1G068130.2 , HORVU1Hr1G068130.4
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G349800 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
2 Sobic.007G139800 - -
3 Sobic.010G062600 - -
4 Sobic.008G183800 - -
5 Sobic.009G017300 - -
6 Sobic.010G247900 plant-specific domain TIGR01568 family protein, expressed -
7 Sobic.007G119101 - -
8 Sobic.009G044501 - -
9 Sobic.004G133800 expressed protein -
10 Sobic.002G005500 dirigent, putative, expressed -
11 Sobic.008G116900 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
12 Sobic.002G069232 - -
13 Sobic.001G263801 - -
14 Sobic.001G126000 - -
15 Sobic.009G111700 late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G025350 - -
17 Sobic.010G201100 expressed protein -
18 Sobic.009G239000 OsMADS78 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
19 Sobic.002G031301 - -
20 Sobic.004G303150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G312900 Sobic004G312900 Sobic002G349800 Sobic002G349800 Sobic004G312900--Sobic002G349800 Sobic007G139800 Sobic007G139800 Sobic004G312900--Sobic007G139800 Sobic010G062600 Sobic010G062600 Sobic004G312900--Sobic010G062600 Sobic008G183800 Sobic008G183800 Sobic004G312900--Sobic008G183800 Sobic009G017300 Sobic009G017300 Sobic004G312900--Sobic009G017300 Sobic010G247900 Sobic010G247900 Sobic004G312900--Sobic010G247900 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic004G312900--Sobic007G119101 Sobic009G044501 Sobic009G044501 Sobic004G312900--Sobic009G044501 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic004G312900--Sobic004G133800 Sobic002G349800--Sobic007G139800 Sobic002G349800--Sobic004G133800 Sobic002G069232 Sobic002G069232 Sobic002G349800--Sobic002G069232 Sobic008G116900 Sobic008G116900 Sobic002G349800--Sobic008G116900 Sobic002G349800--Sobic010G062600 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic002G349800--Sobic002G005500 Sobic009G239000 Sobic009G239000 Sobic002G349800--Sobic009G239000 Sobic002G349800--Sobic009G017300 Sobic002G349800--Sobic007G119101 Sobic007G139800--Sobic002G349800 Sobic007G139800--Sobic009G017300 Sobic007G139800--Sobic009G239000 Sobic007G139800--Sobic002G069232 Sobic007G139800--Sobic008G116900 Sobic004G303150 Sobic004G303150 Sobic007G139800--Sobic004G303150 Sobic007G139800--Sobic004G133800 Sobic010G172666 Sobic010G172666 Sobic007G139800--Sobic010G172666 Sobic001G493600 Sobic001G493600 Sobic007G139800--Sobic001G493600 Sobic010G062600--Sobic002G349800 Sobic010G062600--Sobic004G133800 Sobic010G062600--Sobic002G069232 Sobic010G062600--Sobic002G005500 Sobic010G062600--Sobic008G116900 Sobic001G359601 Sobic001G359601 Sobic010G062600--Sobic001G359601 Sobic010G062600--Sobic009G239000 Sobic001G263801 Sobic001G263801 Sobic010G062600--Sobic001G263801 Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic010G062600--Sobic009G111700 Sobic001G126000 Sobic001G126000 Sobic008G183800--Sobic001G126000 Sobic008G183800--Sobic010G062600 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic008G183800--Sobic007G025350 Sobic008G183800--Sobic001G263801 Sobic008G183800--Sobic002G005500 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic008G183800--Sobic003G226950 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic008G183800--Sobic002G125500 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic008G183800--Sobic010G201100 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic008G183800--Sobic002G031301 Sobic006G138700 Sobic006G138700 Sobic009G017300--Sobic006G138700 Sobic009G017300--Sobic009G239000 Sobic009G017300--Sobic007G139800 Sobic009G017300--Sobic008G116900 Sobic009G017300--Sobic002G069232 Sobic009G017300--Sobic001G359601 Sobic009G017300--Sobic004G303150 Sobic009G017300--Sobic010G172666 Sobic009G017300--Sobic001G493600 Sobic010G247900--Sobic004G312900 Sobic004G200600 Sobic004G200600 Sobic010G247900--Sobic004G200600 Sobic003G035200 Sobic003G035200 Sobic010G247900--Sobic003G035200 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic010G247900--Sobic009G240300 Sobic006G172400 Sobic006G172400 Sobic010G247900--Sobic006G172400 Sobic010G247900--Sobic002G349800 Sobic010G247900--Sobic007G139800 Sobic001G336900 Sobic001G336900 Sobic010G247900--Sobic001G336900 Sobic002G174100 Sobic002G174100 Sobic010G247900--Sobic002G174100 Sobic007G119101--Sobic002G031301 Sobic007G119101--Sobic010G201100 Sobic007G119101--Sobic009G111700 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic007G119101--Sobic005G072850 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic007G119101--Sobic010G015100 Sobic007G119101--Sobic002G125500 Sobic007G119101--Sobic003G226950 Sobic007G119101--Sobic007G025350 Sobic007G119101--Sobic002G005500 Sobic004G240700 Sobic004G240700 Sobic009G044501--Sobic004G240700 Sobic009G044501--Sobic002G125500 Sobic006G130900 Sobic006G130900 Sobic009G044501--Sobic006G130900 Sobic009G044501--Sobic003G226950 Sobic009G044501--Sobic005G072850 Sobic009G044501--Sobic010G015100 Sobic009G044501--Sobic009G111700 Sobic009G044501--Sobic002G031301 Sobic009G044501--Sobic007G119101 Sobic004G133800--Sobic002G069232 Sobic004G133800--Sobic008G116900 Sobic004G133800--Sobic002G005500 Sobic004G133800--Sobic010G201100 Sobic004G133800--Sobic007G119101 Sobic004G133800--Sobic001G263801 Sobic004G133800--Sobic007G025350 Sobic004G133800--Sobic002G031301 Sobic004G133800--Sobic009G111700
Octagon: transcription factors


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