Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G111700.1
Synonym AtLEA5, SAG21, Sb09g018000
Functional annotation late embryogenesis abundant protein, putative, expressed
UniProt C5YWU5
Pfam PF03242
Panther DB PTHR33509 PTHR33509:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006950; response to stress


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G02380 : senescence-associated gene 21
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g29930.1 : late embryogenesis abundant protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK06700
Barley HORVU1Hr1G058850.1 , HORVU1Hr1G058850.2
Wheat TraesCS1A02G230800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G111700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.010G257900 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
19 Sobic.002G069232 - -
20 Sobic.008G116900 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic009G111700--Sobic002G031301 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic009G111700--Sobic007G119101 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic009G111700--Sobic010G201100 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic009G111700--Sobic005G072850 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic009G111700--Sobic002G125500 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic009G111700--Sobic010G015100 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic009G111700--Sobic003G226950 Sobic004G240700 Sobic004G240700 Sobic009G111700--Sobic004G240700 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic009G111700--Sobic002G005500 Sobic002G031301--Sobic010G201100 Sobic002G031301--Sobic007G119101 Sobic002G031301--Sobic005G072850 Sobic002G031301--Sobic009G111700 Sobic002G031301--Sobic010G015100 Sobic002G031301--Sobic002G125500 Sobic002G031301--Sobic003G226950 Sobic002G031301--Sobic004G240700 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic002G031301--Sobic007G025350 Sobic007G119101--Sobic002G031301 Sobic007G119101--Sobic010G201100 Sobic007G119101--Sobic009G111700 Sobic007G119101--Sobic005G072850 Sobic007G119101--Sobic010G015100 Sobic007G119101--Sobic002G125500 Sobic007G119101--Sobic003G226950 Sobic007G119101--Sobic007G025350 Sobic007G119101--Sobic002G005500 Sobic010G201100--Sobic002G031301 Sobic010G201100--Sobic007G119101 Sobic010G201100--Sobic009G111700 Sobic010G201100--Sobic005G072850 Sobic010G201100--Sobic002G125500 Sobic010G201100--Sobic003G226950 Sobic010G201100--Sobic007G025350 Sobic010G201100--Sobic010G015100 Sobic001G263801 Sobic001G263801 Sobic010G201100--Sobic001G263801 Sobic005G072850--Sobic010G015100 Sobic005G072850--Sobic002G031301 Sobic005G072850--Sobic007G119101 Sobic005G072850--Sobic009G111700 Sobic005G072850--Sobic010G201100 Sobic005G072850--Sobic004G240700 Sobic005G072850--Sobic002G125500 Sobic005G072850--Sobic003G226950 Sobic006G130900 Sobic006G130900 Sobic005G072850--Sobic006G130900 Sobic002G125500--Sobic003G226950 Sobic002G125500--Sobic004G240700 Sobic002G125500--Sobic009G111700 Sobic002G125500--Sobic002G031301 Sobic002G125500--Sobic010G201100 Sobic002G125500--Sobic005G072850 Sobic002G125500--Sobic007G119101 Sobic002G125500--Sobic007G025350 Sobic002G125500--Sobic010G015100 Sobic010G015100--Sobic005G072850 Sobic010G015100--Sobic002G031301 Sobic010G015100--Sobic004G240700 Sobic010G015100--Sobic009G111700 Sobic010G015100--Sobic007G119101 Sobic010G015100--Sobic006G130900 Sobic010G015100--Sobic010G201100 Sobic010G015100--Sobic002G125500 Sobic003G315600 Sobic003G315600 Sobic010G015100--Sobic003G315600 Sobic003G226950--Sobic002G125500 Sobic003G226950--Sobic007G025350 Sobic003G226950--Sobic001G263801 Sobic003G226950--Sobic009G111700 Sobic003G226950--Sobic010G201100 Sobic003G226950--Sobic002G005500 Sobic003G226950--Sobic002G031301 Sobic003G226950--Sobic007G119101 Sobic003G226950--Sobic004G240700 Sobic004G240700--Sobic002G125500 Sobic004G240700--Sobic006G130900 Sobic004G240700--Sobic010G015100 Sobic004G240700--Sobic005G072850 Sobic004G240700--Sobic009G111700 Sobic004G240700--Sobic002G031301 Sobic004G240700--Sobic003G226950 Sobic004G240700--Sobic010G201100 Sobic004G240700--Sobic007G119101 Sobic002G005500--Sobic001G263801 Sobic002G005500--Sobic007G025350 Sobic002G005500--Sobic003G226950 Sobic002G005500--Sobic010G201100 Sobic002G005500--Sobic009G111700 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic002G005500--Sobic004G133800 Sobic002G005500--Sobic007G119101 Sobic002G005500--Sobic002G031301 Sobic002G005500--Sobic002G125500
Octagon: transcription factors


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