Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G005500.1
Synonym Sb02g000710
Functional annotation dirigent, putative, expressed
UniProt A0A1W0W1M8
Pfam PF03018
Panther DB PTHR21495 PTHR21495:SF50
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G42510 : Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g01680.1 : dirigent, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G053001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic001G263801 Sobic001G263801 Sobic002G005500--Sobic001G263801 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic002G005500--Sobic007G025350 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic002G005500--Sobic003G226950 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic002G005500--Sobic010G201100 Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic002G005500--Sobic009G111700 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic002G005500--Sobic004G133800 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic002G005500--Sobic007G119101 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic002G005500--Sobic002G031301 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic002G005500--Sobic002G125500 Sobic001G263801--Sobic007G025350 Sobic001G263801--Sobic002G005500 Sobic001G263801--Sobic003G226950 Sobic001G263801--Sobic010G201100 Sobic001G263801--Sobic002G125500 Sobic001G263801--Sobic002G031301 Sobic001G263801--Sobic007G119101 Sobic001G263801--Sobic009G111700 Sobic001G263801--Sobic004G133800 Sobic007G025350--Sobic001G263801 Sobic007G025350--Sobic002G005500 Sobic007G025350--Sobic003G226950 Sobic007G025350--Sobic010G201100 Sobic007G025350--Sobic002G125500 Sobic007G025350--Sobic002G031301 Sobic007G025350--Sobic009G111700 Sobic007G025350--Sobic007G119101 Sobic007G025350--Sobic004G133800 Sobic003G226950--Sobic002G125500 Sobic003G226950--Sobic007G025350 Sobic003G226950--Sobic001G263801 Sobic003G226950--Sobic009G111700 Sobic003G226950--Sobic010G201100 Sobic003G226950--Sobic002G005500 Sobic003G226950--Sobic002G031301 Sobic003G226950--Sobic007G119101 Sobic004G240700 Sobic004G240700 Sobic003G226950--Sobic004G240700 Sobic010G201100--Sobic002G031301 Sobic010G201100--Sobic007G119101 Sobic010G201100--Sobic009G111700 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic010G201100--Sobic005G072850 Sobic010G201100--Sobic002G125500 Sobic010G201100--Sobic003G226950 Sobic010G201100--Sobic007G025350 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic010G201100--Sobic010G015100 Sobic010G201100--Sobic001G263801 Sobic009G111700--Sobic002G031301 Sobic009G111700--Sobic007G119101 Sobic009G111700--Sobic010G201100 Sobic009G111700--Sobic005G072850 Sobic009G111700--Sobic002G125500 Sobic009G111700--Sobic010G015100 Sobic009G111700--Sobic003G226950 Sobic009G111700--Sobic004G240700 Sobic009G111700--Sobic002G005500 Sobic002G069232 Sobic002G069232 Sobic004G133800--Sobic002G069232 Sobic008G116900 Sobic008G116900 Sobic004G133800--Sobic008G116900 Sobic004G133800--Sobic002G005500 Sobic004G133800--Sobic010G201100 Sobic004G133800--Sobic007G119101 Sobic004G133800--Sobic001G263801 Sobic004G133800--Sobic007G025350 Sobic004G133800--Sobic002G031301 Sobic004G133800--Sobic009G111700 Sobic007G119101--Sobic002G031301 Sobic007G119101--Sobic010G201100 Sobic007G119101--Sobic009G111700 Sobic007G119101--Sobic005G072850 Sobic007G119101--Sobic010G015100 Sobic007G119101--Sobic002G125500 Sobic007G119101--Sobic003G226950 Sobic007G119101--Sobic007G025350 Sobic007G119101--Sobic002G005500 Sobic002G031301--Sobic010G201100 Sobic002G031301--Sobic007G119101 Sobic002G031301--Sobic005G072850 Sobic002G031301--Sobic009G111700 Sobic002G031301--Sobic010G015100 Sobic002G031301--Sobic002G125500 Sobic002G031301--Sobic003G226950 Sobic002G031301--Sobic004G240700 Sobic002G031301--Sobic007G025350 Sobic002G125500--Sobic003G226950 Sobic002G125500--Sobic004G240700 Sobic002G125500--Sobic009G111700 Sobic002G125500--Sobic002G031301 Sobic002G125500--Sobic010G201100 Sobic002G125500--Sobic005G072850 Sobic002G125500--Sobic007G119101 Sobic002G125500--Sobic007G025350 Sobic002G125500--Sobic010G015100
Octagon: transcription factors


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