Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G359601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S9L7
Pfam PF01679
Panther DB PTHR21659 PTHR21659:SF19
NCBI CDD KOG1773; Stress responsive protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G05890 : Low temperature and salt responsive protein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g44180.1 : OsRCI2-10 - Hydrophobic protein LTI6A, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052306
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G263801 - -
2 Sobic.007G025350 - -
3 Sobic.002G005500 dirigent, putative, expressed -
4 Sobic.010G201100 expressed protein -
5 Sobic.009G111700 late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
6 Sobic.007G119101 - -
7 Sobic.004G133800 expressed protein -
8 Sobic.002G031301 - -
9 Sobic.003G226950 - -
10 Sobic.002G125500 aquaporin protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G072850 - -
12 Sobic.002G069232 - -
13 Sobic.008G116900 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
14 Sobic.010G015100 expressed protein -
15 Sobic.004G303150 - -
16 Sobic.004G240700 expressed protein -
17 Sobic.009G017300 - -
18 Sobic.010G172666 - -
19 Sobic.009G239000 OsMADS78 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
20 Sobic.009G237900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G359601 Sobic001G359601 Sobic001G263801 Sobic001G263801 Sobic001G359601--Sobic001G263801 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic001G359601--Sobic007G025350 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic001G359601--Sobic002G005500 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic001G359601--Sobic010G201100 Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic001G359601--Sobic009G111700 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic001G359601--Sobic007G119101 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic001G359601--Sobic004G133800 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic001G359601--Sobic002G031301 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic001G359601--Sobic003G226950 Sobic001G263801--Sobic007G025350 Sobic001G263801--Sobic002G005500 Sobic001G263801--Sobic003G226950 Sobic001G263801--Sobic010G201100 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic001G263801--Sobic002G125500 Sobic001G263801--Sobic002G031301 Sobic001G263801--Sobic007G119101 Sobic001G263801--Sobic009G111700 Sobic001G263801--Sobic004G133800 Sobic007G025350--Sobic001G263801 Sobic007G025350--Sobic002G005500 Sobic007G025350--Sobic003G226950 Sobic007G025350--Sobic010G201100 Sobic007G025350--Sobic002G125500 Sobic007G025350--Sobic002G031301 Sobic007G025350--Sobic009G111700 Sobic007G025350--Sobic007G119101 Sobic007G025350--Sobic004G133800 Sobic002G005500--Sobic001G263801 Sobic002G005500--Sobic007G025350 Sobic002G005500--Sobic003G226950 Sobic002G005500--Sobic010G201100 Sobic002G005500--Sobic009G111700 Sobic002G005500--Sobic004G133800 Sobic002G005500--Sobic007G119101 Sobic002G005500--Sobic002G031301 Sobic002G005500--Sobic002G125500 Sobic010G201100--Sobic002G031301 Sobic010G201100--Sobic007G119101 Sobic010G201100--Sobic009G111700 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic010G201100--Sobic005G072850 Sobic010G201100--Sobic002G125500 Sobic010G201100--Sobic003G226950 Sobic010G201100--Sobic007G025350 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic010G201100--Sobic010G015100 Sobic010G201100--Sobic001G263801 Sobic009G111700--Sobic002G031301 Sobic009G111700--Sobic007G119101 Sobic009G111700--Sobic010G201100 Sobic009G111700--Sobic005G072850 Sobic009G111700--Sobic002G125500 Sobic009G111700--Sobic010G015100 Sobic009G111700--Sobic003G226950 Sobic004G240700 Sobic004G240700 Sobic009G111700--Sobic004G240700 Sobic009G111700--Sobic002G005500 Sobic007G119101--Sobic002G031301 Sobic007G119101--Sobic010G201100 Sobic007G119101--Sobic009G111700 Sobic007G119101--Sobic005G072850 Sobic007G119101--Sobic010G015100 Sobic007G119101--Sobic002G125500 Sobic007G119101--Sobic003G226950 Sobic007G119101--Sobic007G025350 Sobic007G119101--Sobic002G005500 Sobic002G069232 Sobic002G069232 Sobic004G133800--Sobic002G069232 Sobic008G116900 Sobic008G116900 Sobic004G133800--Sobic008G116900 Sobic004G133800--Sobic002G005500 Sobic004G133800--Sobic010G201100 Sobic004G133800--Sobic007G119101 Sobic004G133800--Sobic001G263801 Sobic004G133800--Sobic007G025350 Sobic004G133800--Sobic002G031301 Sobic004G133800--Sobic009G111700 Sobic002G031301--Sobic010G201100 Sobic002G031301--Sobic007G119101 Sobic002G031301--Sobic005G072850 Sobic002G031301--Sobic009G111700 Sobic002G031301--Sobic010G015100 Sobic002G031301--Sobic002G125500 Sobic002G031301--Sobic003G226950 Sobic002G031301--Sobic004G240700 Sobic002G031301--Sobic007G025350 Sobic003G226950--Sobic002G125500 Sobic003G226950--Sobic007G025350 Sobic003G226950--Sobic001G263801 Sobic003G226950--Sobic009G111700 Sobic003G226950--Sobic010G201100 Sobic003G226950--Sobic002G005500 Sobic003G226950--Sobic002G031301 Sobic003G226950--Sobic007G119101 Sobic003G226950--Sobic004G240700
Octagon: transcription factors


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