Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G053001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R105
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G303150 - -
2 Sobic.010G172666 - -
3 Sobic.001G493600 vesicle-associated membrane protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G286351 - -
5 Sobic.009G239000 OsMADS78 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
6 Sobic.008G116900 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
7 Sobic.007G069450 - -
8 Sobic.010G111700 - -
9 Sobic.007G035100 cyclin, putative, expressed K05868: G2/mitotic-specific cyclin-B1
10 Sobic.002G069232 - -
11 Sobic.002G223100 annexin, putative, expressed -
12 Sobic.001G263801 - -
13 Sobic.002G005500 dirigent, putative, expressed -
14 Sobic.007G025350 - -
15 Sobic.004G274000 STE_MEK_ste7_MAP2K.4 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
16 Sobic.004G133800 expressed protein -
17 Sobic.009G017300 - -
18 Sobic.001G359601 - -
19 Sobic.002G012350 - -
20 Sobic.002G401301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G053001 Sobic009G053001 Sobic004G303150 Sobic004G303150 Sobic009G053001--Sobic004G303150 Sobic010G172666 Sobic010G172666 Sobic009G053001--Sobic010G172666 Sobic001G493600 Sobic001G493600 Sobic009G053001--Sobic001G493600 Sobic004G286351 Sobic004G286351 Sobic009G053001--Sobic004G286351 Sobic009G239000 Sobic009G239000 Sobic009G053001--Sobic009G239000 Sobic008G116900 Sobic008G116900 Sobic009G053001--Sobic008G116900 Sobic007G069450 Sobic007G069450 Sobic009G053001--Sobic007G069450 Sobic010G111700 Sobic010G111700 Sobic009G053001--Sobic010G111700 Sobic007G035100 Sobic007G035100 Sobic009G053001--Sobic007G035100 Sobic004G303150--Sobic010G172666 Sobic004G303150--Sobic001G493600 Sobic004G303150--Sobic009G239000 Sobic004G303150--Sobic004G286351 Sobic004G303150--Sobic009G053001 Sobic004G303150--Sobic008G116900 Sobic001G263801 Sobic001G263801 Sobic004G303150--Sobic001G263801 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic004G303150--Sobic002G005500 Sobic002G069232 Sobic002G069232 Sobic004G303150--Sobic002G069232 Sobic010G172666--Sobic001G493600 Sobic010G172666--Sobic004G303150 Sobic010G172666--Sobic004G286351 Sobic010G172666--Sobic009G239000 Sobic010G172666--Sobic009G053001 Sobic010G172666--Sobic007G069450 Sobic010G172666--Sobic010G111700 Sobic010G172666--Sobic007G035100 Sobic010G172666--Sobic008G116900 Sobic001G493600--Sobic010G172666 Sobic001G493600--Sobic004G303150 Sobic001G493600--Sobic004G286351 Sobic001G493600--Sobic009G239000 Sobic001G493600--Sobic009G053001 Sobic001G493600--Sobic007G069450 Sobic001G493600--Sobic010G111700 Sobic001G493600--Sobic007G035100 Sobic001G493600--Sobic008G116900 Sobic004G286351--Sobic001G493600 Sobic004G286351--Sobic010G172666 Sobic004G286351--Sobic010G111700 Sobic004G286351--Sobic007G035100 Sobic004G286351--Sobic007G069450 Sobic004G286351--Sobic004G303150 Sobic004G286351--Sobic009G239000 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic004G286351--Sobic004G274000 Sobic004G286351--Sobic009G053001 Sobic009G239000--Sobic010G172666 Sobic009G239000--Sobic001G493600 Sobic009G239000--Sobic004G303150 Sobic009G239000--Sobic008G116900 Sobic009G239000--Sobic002G069232 Sobic009G239000--Sobic004G286351 Sobic009G239000--Sobic009G053001 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic009G239000--Sobic004G133800 Sobic009G239000--Sobic007G069450 Sobic008G116900--Sobic002G069232 Sobic008G116900--Sobic009G239000 Sobic008G116900--Sobic004G133800 Sobic008G116900--Sobic004G303150 Sobic008G116900--Sobic010G172666 Sobic008G116900--Sobic001G493600 Sobic008G116900--Sobic002G005500 Sobic008G116900--Sobic001G263801 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic008G116900--Sobic007G025350 Sobic007G069450--Sobic010G111700 Sobic007G069450--Sobic007G035100 Sobic007G069450--Sobic004G286351 Sobic007G069450--Sobic004G274000 Sobic007G069450--Sobic001G493600 Sobic007G069450--Sobic010G172666 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic007G069450--Sobic004G181100 Sobic002G159400 Sobic002G159400 Sobic007G069450--Sobic002G159400 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic007G069450--Sobic006G042800 Sobic010G111700--Sobic007G035100 Sobic010G111700--Sobic004G274000 Sobic010G111700--Sobic004G286351 Sobic010G111700--Sobic007G069450 Sobic010G111700--Sobic004G181100 Sobic010G111700--Sobic006G042800 Sobic010G111700--Sobic002G159400 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic010G111700--Sobic002G188800 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic010G111700--Sobic002G401301 Sobic007G035100--Sobic010G111700 Sobic007G035100--Sobic004G274000 Sobic007G035100--Sobic004G286351 Sobic007G035100--Sobic007G069450 Sobic007G035100--Sobic004G181100 Sobic007G035100--Sobic006G042800 Sobic007G035100--Sobic002G159400 Sobic007G035100--Sobic002G188800 Sobic007G035100--Sobic002G401301
Octagon: transcription factors


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