Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G349800.1
Synonym Sb02g037200, SUMO2, SUM2, ATSUMO2
Functional annotation ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed
UniProt C5XCC8
Pfam PF11976
Panther DB PTHR10562 PTHR10562:SF19
NCBI CDD KOG1769; Ubiquitin-like proteins
KEGG Orthology K12160; SUMO, small ubiquitin-related modifier
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G55160 : small ubiquitin-like modifier 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g38650.1 : ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G349800 Sobic002G349800 Sobic007G139800 Sobic007G139800 Sobic002G349800--Sobic007G139800 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic002G349800--Sobic004G133800 Sobic002G069232 Sobic002G069232 Sobic002G349800--Sobic002G069232 Sobic008G116900 Sobic008G116900 Sobic002G349800--Sobic008G116900 Sobic010G062600 Sobic010G062600 Sobic002G349800--Sobic010G062600 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic002G349800--Sobic002G005500 Sobic009G239000 Sobic009G239000 Sobic002G349800--Sobic009G239000 Sobic009G017300 Sobic009G017300 Sobic002G349800--Sobic009G017300 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic002G349800--Sobic007G119101 Sobic007G139800--Sobic002G349800 Sobic007G139800--Sobic009G017300 Sobic007G139800--Sobic009G239000 Sobic007G139800--Sobic002G069232 Sobic007G139800--Sobic008G116900 Sobic004G303150 Sobic004G303150 Sobic007G139800--Sobic004G303150 Sobic007G139800--Sobic004G133800 Sobic010G172666 Sobic010G172666 Sobic007G139800--Sobic010G172666 Sobic001G493600 Sobic001G493600 Sobic007G139800--Sobic001G493600 Sobic004G133800--Sobic002G069232 Sobic004G133800--Sobic008G116900 Sobic004G133800--Sobic002G005500 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic004G133800--Sobic010G201100 Sobic004G133800--Sobic007G119101 Sobic001G263801 Sobic001G263801 Sobic004G133800--Sobic001G263801 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic004G133800--Sobic007G025350 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic004G133800--Sobic002G031301 Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic004G133800--Sobic009G111700 Sobic002G069232--Sobic004G133800 Sobic002G069232--Sobic008G116900 Sobic002G069232--Sobic009G239000 Sobic002G069232--Sobic004G303150 Sobic002G069232--Sobic010G172666 Sobic002G069232--Sobic001G493600 Sobic002G069232--Sobic002G005500 Sobic002G069232--Sobic001G263801 Sobic002G069232--Sobic007G025350 Sobic008G116900--Sobic002G069232 Sobic008G116900--Sobic009G239000 Sobic008G116900--Sobic004G133800 Sobic008G116900--Sobic004G303150 Sobic008G116900--Sobic010G172666 Sobic008G116900--Sobic001G493600 Sobic008G116900--Sobic002G005500 Sobic008G116900--Sobic001G263801 Sobic008G116900--Sobic007G025350 Sobic010G062600--Sobic002G349800 Sobic010G062600--Sobic004G133800 Sobic010G062600--Sobic002G069232 Sobic010G062600--Sobic002G005500 Sobic010G062600--Sobic008G116900 Sobic001G359601 Sobic001G359601 Sobic010G062600--Sobic001G359601 Sobic010G062600--Sobic009G239000 Sobic010G062600--Sobic001G263801 Sobic010G062600--Sobic009G111700 Sobic002G005500--Sobic001G263801 Sobic002G005500--Sobic007G025350 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic002G005500--Sobic003G226950 Sobic002G005500--Sobic010G201100 Sobic002G005500--Sobic009G111700 Sobic002G005500--Sobic004G133800 Sobic002G005500--Sobic007G119101 Sobic002G005500--Sobic002G031301 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic002G005500--Sobic002G125500 Sobic009G239000--Sobic010G172666 Sobic009G239000--Sobic001G493600 Sobic009G239000--Sobic004G303150 Sobic009G239000--Sobic008G116900 Sobic009G239000--Sobic002G069232 Sobic004G286351 Sobic004G286351 Sobic009G239000--Sobic004G286351 Sobic009G053001 Sobic009G053001 Sobic009G239000--Sobic009G053001 Sobic009G239000--Sobic004G133800 Sobic007G069450 Sobic007G069450 Sobic009G239000--Sobic007G069450 Sobic006G138700 Sobic006G138700 Sobic009G017300--Sobic006G138700 Sobic009G017300--Sobic009G239000 Sobic009G017300--Sobic007G139800 Sobic009G017300--Sobic008G116900 Sobic009G017300--Sobic002G069232 Sobic009G017300--Sobic001G359601 Sobic009G017300--Sobic004G303150 Sobic009G017300--Sobic010G172666 Sobic009G017300--Sobic001G493600 Sobic007G119101--Sobic002G031301 Sobic007G119101--Sobic010G201100 Sobic007G119101--Sobic009G111700 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic007G119101--Sobic005G072850 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic007G119101--Sobic010G015100 Sobic007G119101--Sobic002G125500 Sobic007G119101--Sobic003G226950 Sobic007G119101--Sobic007G025350 Sobic007G119101--Sobic002G005500
Octagon: transcription factors


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