Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G183800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PEF7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G183800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G126000 - -
2 Sobic.010G062600 - -
3 Sobic.007G025350 - -
4 Sobic.001G263801 - -
5 Sobic.002G005500 dirigent, putative, expressed -
6 Sobic.003G226950 - -
7 Sobic.002G125500 aquaporin protein, putative, expressed -
8 Sobic.010G201100 expressed protein -
9 Sobic.002G031301 - -
10 Sobic.009G111700 late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G119101 - -
12 Sobic.009G044501 - -
13 Sobic.004G133800 expressed protein -
14 Sobic.005G072850 - -
15 Sobic.002G349800 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
16 Sobic.004G240700 expressed protein -
17 Sobic.001G359601 - -
18 Sobic.004G303150 - -
19 Sobic.010G015100 expressed protein -
20 Sobic.008G116900 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G183800 Sobic008G183800 Sobic001G126000 Sobic001G126000 Sobic008G183800--Sobic001G126000 Sobic010G062600 Sobic010G062600 Sobic008G183800--Sobic010G062600 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic008G183800--Sobic007G025350 Sobic001G263801 Sobic001G263801 Sobic008G183800--Sobic001G263801 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic008G183800--Sobic002G005500 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic008G183800--Sobic003G226950 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic008G183800--Sobic002G125500 Sobic010G201100 Sobic010G201100 Sobic008G183800--Sobic010G201100 Sobic002G031301 Sobic002G031301 Sobic008G183800--Sobic002G031301 Sobic001G126000--Sobic008G183800 Sobic001G493600 Sobic001G493600 Sobic001G126000--Sobic001G493600 Sobic010G172666 Sobic010G172666 Sobic001G126000--Sobic010G172666 Sobic001G126000--Sobic010G062600 Sobic004G286351 Sobic004G286351 Sobic001G126000--Sobic004G286351 Sobic004G303150 Sobic004G303150 Sobic001G126000--Sobic004G303150 Sobic009G239000 Sobic009G239000 Sobic001G126000--Sobic009G239000 Sobic010G111700 Sobic010G111700 Sobic001G126000--Sobic010G111700 Sobic009G053001 Sobic009G053001 Sobic001G126000--Sobic009G053001 Sobic002G349800 Sobic002G349800 Sobic010G062600--Sobic002G349800 Sobic004G133800 Sobic004G133800 Sobic010G062600--Sobic004G133800 Sobic002G069232 Sobic002G069232 Sobic010G062600--Sobic002G069232 Sobic010G062600--Sobic002G005500 Sobic008G116900 Sobic008G116900 Sobic010G062600--Sobic008G116900 Sobic001G359601 Sobic001G359601 Sobic010G062600--Sobic001G359601 Sobic010G062600--Sobic009G239000 Sobic010G062600--Sobic001G263801 Sobic009G111700 Sobic009G111700 Sobic010G062600--Sobic009G111700 Sobic007G025350--Sobic001G263801 Sobic007G025350--Sobic002G005500 Sobic007G025350--Sobic003G226950 Sobic007G025350--Sobic010G201100 Sobic007G025350--Sobic002G125500 Sobic007G025350--Sobic002G031301 Sobic007G025350--Sobic009G111700 Sobic007G119101 Sobic007G119101 Sobic007G025350--Sobic007G119101 Sobic007G025350--Sobic004G133800 Sobic001G263801--Sobic007G025350 Sobic001G263801--Sobic002G005500 Sobic001G263801--Sobic003G226950 Sobic001G263801--Sobic010G201100 Sobic001G263801--Sobic002G125500 Sobic001G263801--Sobic002G031301 Sobic001G263801--Sobic007G119101 Sobic001G263801--Sobic009G111700 Sobic001G263801--Sobic004G133800 Sobic002G005500--Sobic001G263801 Sobic002G005500--Sobic007G025350 Sobic002G005500--Sobic003G226950 Sobic002G005500--Sobic010G201100 Sobic002G005500--Sobic009G111700 Sobic002G005500--Sobic004G133800 Sobic002G005500--Sobic007G119101 Sobic002G005500--Sobic002G031301 Sobic002G005500--Sobic002G125500 Sobic003G226950--Sobic002G125500 Sobic003G226950--Sobic007G025350 Sobic003G226950--Sobic001G263801 Sobic003G226950--Sobic009G111700 Sobic003G226950--Sobic010G201100 Sobic003G226950--Sobic002G005500 Sobic003G226950--Sobic002G031301 Sobic003G226950--Sobic007G119101 Sobic004G240700 Sobic004G240700 Sobic003G226950--Sobic004G240700 Sobic002G125500--Sobic003G226950 Sobic002G125500--Sobic004G240700 Sobic002G125500--Sobic009G111700 Sobic002G125500--Sobic002G031301 Sobic002G125500--Sobic010G201100 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic002G125500--Sobic005G072850 Sobic002G125500--Sobic007G119101 Sobic002G125500--Sobic007G025350 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic002G125500--Sobic010G015100 Sobic010G201100--Sobic002G031301 Sobic010G201100--Sobic007G119101 Sobic010G201100--Sobic009G111700 Sobic010G201100--Sobic005G072850 Sobic010G201100--Sobic002G125500 Sobic010G201100--Sobic003G226950 Sobic010G201100--Sobic007G025350 Sobic010G201100--Sobic010G015100 Sobic010G201100--Sobic001G263801 Sobic002G031301--Sobic010G201100 Sobic002G031301--Sobic007G119101 Sobic002G031301--Sobic005G072850 Sobic002G031301--Sobic009G111700 Sobic002G031301--Sobic010G015100 Sobic002G031301--Sobic002G125500 Sobic002G031301--Sobic003G226950 Sobic002G031301--Sobic004G240700 Sobic002G031301--Sobic007G025350
Octagon: transcription factors


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