Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G201900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YQS6
Pfam -
Panther DB PTHR35737 PTHR35737:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g38180.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031829 , Zm00025a021316
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G029900 nucampholin, putative, expressed K13100: pre-mRNA-splicing factor CWC22
2 Sobic.005G081100 - -
3 Sobic.009G153366 - -
4 Sobic.006G198200 OsFBX151 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G078450 - -
6 Sobic.009G046300 - -
7 Sobic.002G070700 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.003G079725 - -
9 Sobic.001G533600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
10 Sobic.007G223150 - -
11 Sobic.001G365332 - -
12 Sobic.004G346700 expressed protein -
13 Sobic.007G164101 - -
14 Sobic.004G197700 expressed protein -
15 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
16 Sobic.009G069450 - -
17 Sobic.001G028301 - -
18 Sobic.002G216300 - -
19 Sobic.003G080500 Ser/Thr protein kinase, putative, expressed -
20 Sobic.008G157700 BURP domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G201900 Sobic004G201900 Sobic006G029900 Sobic006G029900 Sobic004G201900--Sobic006G029900 Sobic005G081100 Sobic005G081100 Sobic004G201900--Sobic005G081100 Sobic009G153366 Sobic009G153366 Sobic004G201900--Sobic009G153366 Sobic006G198200 Sobic006G198200 Sobic004G201900--Sobic006G198200 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic004G201900--Sobic006G078450 Sobic009G046300 Sobic009G046300 Sobic004G201900--Sobic009G046300 Sobic002G070700 Sobic002G070700 Sobic004G201900--Sobic002G070700 Sobic003G079725 Sobic003G079725 Sobic004G201900--Sobic003G079725 Sobic001G533600 Sobic001G533600 Sobic004G201900--Sobic001G533600 Sobic006G029900--Sobic005G081100 Sobic006G029900--Sobic006G198200 Sobic007G139800 Sobic007G139800 Sobic006G029900--Sobic007G139800 Sobic005G061300 Sobic005G061300 Sobic006G029900--Sobic005G061300 Sobic001G035450 Sobic001G035450 Sobic006G029900--Sobic001G035450 Sobic001G223000 Sobic001G223000 Sobic006G029900--Sobic001G223000 Sobic006G029900--Sobic001G533600 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic006G029900--Sobic010G025200 Sobic004G312900 Sobic004G312900 Sobic006G029900--Sobic004G312900 Sobic005G081100--Sobic006G029900 Sobic005G081100--Sobic001G035450 Sobic005G081100--Sobic005G061300 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic005G081100--Sobic003G333150 Sobic005G081100--Sobic001G533600 Sobic005G081100--Sobic010G025200 Sobic005G135500 Sobic005G135500 Sobic005G081100--Sobic005G135500 Sobic005G225700 Sobic005G225700 Sobic005G081100--Sobic005G225700 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic005G081100--Sobic003G002800 Sobic009G153366--Sobic009G046300 Sobic002G216300 Sobic002G216300 Sobic009G153366--Sobic002G216300 Sobic006G172100 Sobic006G172100 Sobic009G153366--Sobic006G172100 Sobic002G256400 Sobic002G256400 Sobic009G153366--Sobic002G256400 Sobic009G153366--Sobic006G198200 Sobic010G257200 Sobic010G257200 Sobic009G153366--Sobic010G257200 Sobic001G190700 Sobic001G190700 Sobic009G153366--Sobic001G190700 Sobic009G153366--Sobic006G029900 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic009G153366--Sobic009G240300 Sobic003G184600 Sobic003G184600 Sobic006G198200--Sobic003G184600 Sobic004G304900 Sobic004G304900 Sobic006G198200--Sobic004G304900 Sobic006G198200--Sobic001G533600 Sobic006G198200--Sobic010G025200 Sobic006G198200--Sobic003G333150 Sobic005G114000 Sobic005G114000 Sobic006G198200--Sobic005G114000 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic006G198200--Sobic010G265100 Sobic009G020200 Sobic009G020200 Sobic006G198200--Sobic009G020200 Sobic006G198200--Sobic001G190700 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic006G078450--Sobic001G365332 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic006G078450--Sobic006G017266 Sobic006G078450--Sobic003G079725 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic006G078450--Sobic005G183450 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic006G078450--Sobic004G346700 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic006G078450--Sobic006G020350 Sobic003G128575 Sobic003G128575 Sobic006G078450--Sobic003G128575 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic006G078450--Sobic006G005550 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic006G078450--Sobic003G168350 Sobic009G046300--Sobic009G153366 Sobic009G046300--Sobic002G216300 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic009G046300--Sobic003G137300 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic009G046300--Sobic007G135301 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic009G046300--Sobic005G137500 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic009G046300--Sobic006G087250 Sobic009G046300--Sobic006G172100 Sobic006G130100 Sobic006G130100 Sobic009G046300--Sobic006G130100 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic009G046300--Sobic003G423400 Sobic003G080500 Sobic003G080500 Sobic002G070700--Sobic003G080500 Sobic007G072166 Sobic007G072166 Sobic002G070700--Sobic007G072166 Sobic007G189300 Sobic007G189300 Sobic002G070700--Sobic007G189300 Sobic006G030250 Sobic006G030250 Sobic002G070700--Sobic006G030250 Sobic010G127500 Sobic010G127500 Sobic002G070700--Sobic010G127500 Sobic001G028301 Sobic001G028301 Sobic002G070700--Sobic001G028301 Sobic007G223150 Sobic007G223150 Sobic002G070700--Sobic007G223150 Sobic005G134301 Sobic005G134301 Sobic002G070700--Sobic005G134301 Sobic008G091100 Sobic008G091100 Sobic002G070700--Sobic008G091100 Sobic003G079725--Sobic006G078450 Sobic003G079725--Sobic006G017266 Sobic003G079725--Sobic006G020350 Sobic003G079725--Sobic003G128575 Sobic003G079725--Sobic005G183450 Sobic005G093600 Sobic005G093600 Sobic003G079725--Sobic005G093600 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic003G079725--Sobic009G069450 Sobic003G079725--Sobic001G365332 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic003G079725--Sobic010G173600 Sobic001G533600--Sobic005G114000 Sobic001G533600--Sobic005G061300 Sobic003G008100 Sobic003G008100 Sobic001G533600--Sobic003G008100 Sobic001G533600--Sobic003G333150 Sobic008G183900 Sobic008G183900 Sobic001G533600--Sobic008G183900 Sobic008G172400 Sobic008G172400 Sobic001G533600--Sobic008G172400 Sobic001G533600--Sobic010G025200 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic001G533600--Sobic006G144900 Sobic001G533600--Sobic006G198200
Octagon: transcription factors


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