Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G147800.1
Synonym Sb08g019780, RSL2
Functional annotation helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
UniProt C5YQV8
Pfam PF00010
Panther DB PTHR16223 PTHR16223:SF47
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33880 : ROOT HAIR DEFECTIVE 6-LIKE 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g39850.1 : helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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14 Sobic.007G100900 - -
15 Sobic.001G160300 - -
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20 Sobic.002G084100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G147800 Sobic008G147800 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic008G147800--Sobic009G258200 Sobic010G065500 Sobic010G065500 Sobic008G147800--Sobic010G065500 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic008G147800--Sobic005G205000 Sobic003G083100 Sobic003G083100 Sobic008G147800--Sobic003G083100 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic008G147800--Sobic005G219800 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic008G147800--Sobic008G045900 Sobic007G131300 Sobic007G131300 Sobic008G147800--Sobic007G131300 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic008G147800--Sobic008G045100 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic008G147800--Sobic009G142600 Sobic009G258200--Sobic008G045900 Sobic009G258200--Sobic009G142600 Sobic009G258200--Sobic005G205000 Sobic009G258200--Sobic003G083100 Sobic005G120433 Sobic005G120433 Sobic009G258200--Sobic005G120433 Sobic009G258200--Sobic008G045100 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic009G258200--Sobic001G234700 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic010G065500--Sobic006G137900 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic010G065500--Sobic008G008601 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic010G065500--Sobic005G013700 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic010G065500--Sobic002G063500 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic010G065500--Sobic001G452300 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic010G065500--Sobic003G120050 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic010G065500--Sobic004G122700 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic010G065500--Sobic004G013400 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic010G065500--Sobic002G070400 Sobic005G205000--Sobic008G045900 Sobic005G205000--Sobic009G142600 Sobic005G205000--Sobic009G258200 Sobic005G205000--Sobic002G063500 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic005G205000--Sobic004G090900 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic005G205000--Sobic006G258200 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic005G205000--Sobic005G014600 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic005G205000--Sobic001G045300 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic005G205000--Sobic002G084100 Sobic003G083100--Sobic001G234700 Sobic005G219800--Sobic008G045900 Sobic005G219800--Sobic009G258200 Sobic005G219800--Sobic005G205000 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic005G219800--Sobic003G339400 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic005G219800--Sobic001G138500 Sobic005G219800--Sobic009G142600 Sobic005G219800--Sobic003G120050 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic005G219800--Sobic005G207550 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic005G219800--Sobic008G008701 Sobic008G045900--Sobic001G138500 Sobic008G045900--Sobic001G045300 Sobic008G045900--Sobic004G090900 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic008G045900--Sobic007G027400 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic008G045900--Sobic002G046500 Sobic008G045900--Sobic008G008701 Sobic008G045900--Sobic002G084100 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G045900--Sobic001G033701 Sobic008G045900--Sobic009G142600 Sobic007G131300--Sobic010G065500 Sobic007G131300--Sobic008G147800 Sobic007G131300--Sobic003G083100 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic007G131300--Sobic009G133100 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic007G131300--Sobic005G030200 Sobic007G131300--Sobic009G258200 Sobic008G055650 Sobic008G055650 Sobic007G131300--Sobic008G055650 Sobic007G131300--Sobic002G063500 Sobic005G050900 Sobic005G050900 Sobic007G131300--Sobic005G050900 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic008G045100--Sobic001G358101 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic008G045100--Sobic003G190701 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic008G045100--Sobic004G162800 Sobic008G045100--Sobic001G234700 Sobic009G142600--Sobic008G045900 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic009G142600--Sobic008G053700 Sobic009G142600--Sobic006G258200 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic009G142600--Sobic001G160300 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic009G142600--Sobic008G069901 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic009G142600--Sobic003G046000 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic009G142600--Sobic009G113300 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic009G142600--Sobic010G081500 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic009G142600--Sobic004G184900
Octagon: transcription factors


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