Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G078700.6,Sobic.003G078700.2,Sobic.003G078700.11,Sobic.003G078700.5,Sobic.003G078700.7,Sobic.003G078700.9,Sobic.003G078700.3,Sobic.003G078700.8,Sobic.003G078700.4,Sobic.003G078700.10,Sobic.003G078700.1
Synonym Sb03g006640, LPP3, ATLPP3
Functional annotation lipid phosphatase protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q1X8
Pfam PF01569
Panther DB PTHR10165 PTHR10165:SF80
NCBI CDD KOG3030; Lipid phosphate phosphatase and related enzymes of the PAP2 family
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G02600 : lipid phosphate phosphatase 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g04660.1 : lipid phosphatase protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035592
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G008430.8 , HORVU3Hr1G008430.1 , HORVU3Hr1G008430.2 , HORVU3Hr1G008430.3 , HORVU3Hr1G008430.4 , HORVU3Hr1G008430.5 , HORVU3Hr1G008430.6 , HORVU3Hr1G008430.7
Wheat TraesCS3D02G051000 , TraesCS3D02G051000 , TraesCS3D02G051000 , TraesCS3A02G052100 , TraesCS3A02G052100 , TraesCS3A02G052100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G244901 - -
2 Sobic.009G162550 - -
3 Sobic.003G364550 - -
4 Sobic.003G262500 OsPOP3 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed -
5 Sobic.010G105900 - -
6 Sobic.006G088450 - -
7 Sobic.005G135300 chalcone and stilbene synthases, putative, expressed -
8 Sobic.002G051500 expressed protein -
9 Sobic.003G443601 - -
10 Sobic.009G223000 - -
11 Sobic.002G288500 serine/threonine kinase, putative, expressed -
12 Sobic.005G068400 - -
13 Sobic.010G249600 macrophage migration inhibitory factor, putative, expressed -
14 Sobic.008G131601 - -
15 Sobic.002G176800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@NAD kinase, putative, expressed K00858: ppnK, NAD+ kinase
16 Sobic.010G210050 - -
17 Sobic.009G216200 - -
18 Sobic.002G296800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cell cycle control protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G377501 - -
20 Sobic.009G055000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G078700 Sobic003G078700 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic003G078700--Sobic002G244901 Sobic009G162550 Sobic009G162550 Sobic003G078700--Sobic009G162550 Sobic003G364550 Sobic003G364550 Sobic003G078700--Sobic003G364550 Sobic003G262500 Sobic003G262500 Sobic003G078700--Sobic003G262500 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic003G078700--Sobic010G105900 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic003G078700--Sobic006G088450 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic003G078700--Sobic005G135300 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic003G078700--Sobic002G051500 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic003G078700--Sobic003G443601 Sobic003G375800 Sobic003G375800 Sobic002G244901--Sobic003G375800 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic002G244901--Sobic004G358150 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic002G244901--Sobic002G086700 Sobic002G244901--Sobic003G443601 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic002G244901--Sobic006G151100 Sobic002G244901--Sobic003G078700 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic002G244901--Sobic002G377501 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic002G244901--Sobic010G210050 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic002G244901--Sobic009G223000 Sobic003G352750 Sobic003G352750 Sobic009G162550--Sobic003G352750 Sobic004G096000 Sobic004G096000 Sobic009G162550--Sobic004G096000 Sobic002G176800 Sobic002G176800 Sobic009G162550--Sobic002G176800 Sobic009G162550--Sobic003G078700 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic009G162550--Sobic008G131601 Sobic009G162550--Sobic003G262500 Sobic009G162550--Sobic005G135300 Sobic009G162550--Sobic003G364550 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic009G162550--Sobic005G068400 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic003G364550--Sobic001G336600 Sobic003G364550--Sobic005G135300 Sobic003G364550--Sobic005G068400 Sobic003G364550--Sobic008G131601 Sobic003G364550--Sobic002G051500 Sobic003G364550--Sobic006G088450 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic003G364550--Sobic002G288500 Sobic002G296800 Sobic002G296800 Sobic003G364550--Sobic002G296800 Sobic010G025200 Sobic010G025200 Sobic003G364550--Sobic010G025200 Sobic006G082100 Sobic006G082100 Sobic003G262500--Sobic006G082100 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic003G262500--Sobic009G181900 Sobic009G112500 Sobic009G112500 Sobic003G262500--Sobic009G112500 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic003G262500--Sobic002G377400 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic003G262500--Sobic010G249600 Sobic003G262500--Sobic010G105900 Sobic006G249600 Sobic006G249600 Sobic003G262500--Sobic006G249600 Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic003G262500--Sobic002G387000 Sobic002G398600 Sobic002G398600 Sobic003G262500--Sobic002G398600 Sobic008G016800 Sobic008G016800 Sobic010G105900--Sobic008G016800 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic010G105900--Sobic001G212900 Sobic008G160100 Sobic008G160100 Sobic010G105900--Sobic008G160100 Sobic001G109400 Sobic001G109400 Sobic010G105900--Sobic001G109400 Sobic002G197400 Sobic002G197400 Sobic010G105900--Sobic002G197400 Sobic010G105900--Sobic006G249600 Sobic007G189900 Sobic007G189900 Sobic010G105900--Sobic007G189900 Sobic002G110600 Sobic002G110600 Sobic010G105900--Sobic002G110600 Sobic010G105900--Sobic003G262500 Sobic006G088450--Sobic005G068400 Sobic006G088450--Sobic005G135300 Sobic006G088450--Sobic002G288500 Sobic006G088450--Sobic008G131601 Sobic004G295900 Sobic004G295900 Sobic006G088450--Sobic004G295900 Sobic006G088450--Sobic002G051500 Sobic006G088450--Sobic003G364550 Sobic003G315000 Sobic003G315000 Sobic006G088450--Sobic003G315000 Sobic006G088450--Sobic001G336600 Sobic005G135300--Sobic005G068400 Sobic005G135300--Sobic008G131601 Sobic005G135300--Sobic006G088450 Sobic005G135300--Sobic002G288500 Sobic005G135300--Sobic003G364550 Sobic005G135300--Sobic001G336600 Sobic005G135300--Sobic002G051500 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic005G135300--Sobic002G091500 Sobic005G135300--Sobic004G295900 Sobic002G051500--Sobic005G068400 Sobic002G051500--Sobic003G364550 Sobic002G051500--Sobic006G088450 Sobic002G051500--Sobic005G135300 Sobic002G051500--Sobic002G288500 Sobic003G035200 Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic003G035200 Sobic002G051500--Sobic008G131601 Sobic007G072200 Sobic007G072200 Sobic002G051500--Sobic007G072200 Sobic009G240300 Sobic009G240300 Sobic002G051500--Sobic009G240300 Sobic008G141700 Sobic008G141700 Sobic003G443601--Sobic008G141700 Sobic003G443601--Sobic002G244901 Sobic003G443601--Sobic002G377501 Sobic009G216200 Sobic009G216200 Sobic003G443601--Sobic009G216200 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic003G443601--Sobic002G259900 Sobic003G443601--Sobic006G151100 Sobic003G443601--Sobic010G105900 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic003G443601--Sobic008G016400 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic003G443601--Sobic003G069601
Octagon: transcription factors


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