Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G275050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W5Z8 , C6JSM9
Pfam PF04434 PF03101 PF10551
Panther DB PTHR31669 PTHR31669:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology K17604; zinc finger SWIM domain-containing protein 3
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38180 : FAR1-related sequence 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g39790.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G118700 - -
2 Sobic.003G326100 nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase, putative, expressed -
3 Sobic.007G193900 expressed protein -
4 Sobic.002G188800 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.004G181100 expressed protein -
6 Sobic.008G096401 - -
7 Sobic.004G052700 hypothetical protein -
8 Sobic.006G042800 expressed protein -
9 Sobic.001G060001 - -
10 Sobic.002G159400 expressed protein -
11 Sobic.007G120600 KED, putative, expressed -
12 Sobic.007G035100 cyclin, putative, expressed K05868: G2/mitotic-specific cyclin-B1
13 Sobic.004G274000 STE_MEK_ste7_MAP2K.4 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
14 Sobic.010G111700 - -
15 Sobic.003G066250 - -
16 Sobic.010G267651 - -
17 Sobic.002G401301 - -
18 Sobic.010G146350 - -
19 Sobic.005G207600 - -
20 Sobic.008G059566 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G275050 Sobic002G275050 Sobic003G118700 Sobic003G118700 Sobic002G275050--Sobic003G118700 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic002G275050--Sobic003G326100 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic002G275050--Sobic007G193900 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic002G275050--Sobic002G188800 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic002G275050--Sobic004G181100 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic002G275050--Sobic008G096401 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic002G275050--Sobic004G052700 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic002G275050--Sobic006G042800 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic002G275050--Sobic001G060001 Sobic003G118700--Sobic003G326100 Sobic003G118700--Sobic002G188800 Sobic003G118700--Sobic004G181100 Sobic003G118700--Sobic008G096401 Sobic003G118700--Sobic004G052700 Sobic003G118700--Sobic006G042800 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic003G118700--Sobic007G120600 Sobic002G159400 Sobic002G159400 Sobic003G118700--Sobic002G159400 Sobic003G118700--Sobic001G060001 Sobic003G326100--Sobic002G188800 Sobic003G326100--Sobic001G060001 Sobic003G326100--Sobic004G181100 Sobic003G326100--Sobic008G096401 Sobic003G326100--Sobic004G052700 Sobic003G326100--Sobic007G120600 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic003G326100--Sobic002G401301 Sobic003G326100--Sobic006G042800 Sobic003G326100--Sobic002G159400 Sobic001G336600 Sobic001G336600 Sobic007G193900--Sobic001G336600 Sobic009G160900 Sobic009G160900 Sobic007G193900--Sobic009G160900 Sobic002G260500 Sobic002G260500 Sobic007G193900--Sobic002G260500 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic007G193900--Sobic004G013400 Sobic008G175933 Sobic008G175933 Sobic007G193900--Sobic008G175933 Sobic003G210701 Sobic003G210701 Sobic007G193900--Sobic003G210701 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic007G193900--Sobic009G258200 Sobic005G201800 Sobic005G201800 Sobic007G193900--Sobic005G201800 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic007G193900--Sobic007G027400 Sobic002G188800--Sobic004G181100 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic002G188800--Sobic010G267651 Sobic002G188800--Sobic006G042800 Sobic002G188800--Sobic002G159400 Sobic002G188800--Sobic008G096401 Sobic002G188800--Sobic004G052700 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic002G188800--Sobic004G274000 Sobic002G188800--Sobic007G120600 Sobic002G188800--Sobic002G401301 Sobic004G181100--Sobic006G042800 Sobic004G181100--Sobic002G188800 Sobic004G181100--Sobic002G159400 Sobic004G181100--Sobic008G096401 Sobic004G181100--Sobic004G052700 Sobic004G181100--Sobic007G120600 Sobic004G181100--Sobic010G267651 Sobic004G181100--Sobic004G274000 Sobic004G181100--Sobic001G060001 Sobic008G096401--Sobic004G052700 Sobic008G096401--Sobic007G120600 Sobic008G096401--Sobic001G060001 Sobic008G096401--Sobic004G181100 Sobic008G096401--Sobic006G042800 Sobic008G096401--Sobic010G267651 Sobic008G096401--Sobic002G188800 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic008G096401--Sobic010G146350 Sobic008G096401--Sobic002G159400 Sobic004G052700--Sobic008G096401 Sobic004G052700--Sobic007G120600 Sobic004G052700--Sobic001G060001 Sobic004G052700--Sobic004G181100 Sobic004G052700--Sobic006G042800 Sobic004G052700--Sobic010G267651 Sobic004G052700--Sobic002G188800 Sobic004G052700--Sobic010G146350 Sobic004G052700--Sobic002G159400 Sobic006G042800--Sobic002G159400 Sobic006G042800--Sobic004G181100 Sobic006G042800--Sobic002G188800 Sobic006G042800--Sobic008G096401 Sobic006G042800--Sobic004G052700 Sobic006G042800--Sobic007G120600 Sobic006G042800--Sobic010G267651 Sobic006G042800--Sobic004G274000 Sobic006G042800--Sobic001G060001 Sobic001G060001--Sobic007G120600 Sobic001G060001--Sobic004G052700 Sobic001G060001--Sobic008G096401 Sobic001G060001--Sobic010G146350 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic001G060001--Sobic005G207600 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic001G060001--Sobic010G228200 Sobic001G060001--Sobic004G181100 Sobic001G060001--Sobic010G267651 Sobic001G060001--Sobic006G042800
Octagon: transcription factors


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