Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G059566.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PBZ7
Pfam PF02902
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g13750.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G078600 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
2 Sobic.003G326100 nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase, putative, expressed -
3 Sobic.009G053001 - -
4 Sobic.003G118700 - -
5 Sobic.002G303950 - -
6 Sobic.009G196100 dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.001G539760 - -
8 Sobic.007G035100 cyclin, putative, expressed K05868: G2/mitotic-specific cyclin-B1
9 Sobic.010G111700 - -
10 Sobic.002G188800 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.004G274000 STE_MEK_ste7_MAP2K.4 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
12 Sobic.004G286351 - -
13 Sobic.004G181100 expressed protein -
14 Sobic.006G042800 expressed protein -
15 Sobic.007G069450 - -
16 Sobic.002G159400 expressed protein -
17 Sobic.001G060001 - -
18 Sobic.002G401301 - -
19 Sobic.001G493600 vesicle-associated membrane protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G096401 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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