Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G303950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W6C6
Pfam -
Panther DB PTHR33116 PTHR33116:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g11400.1 : hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G078600 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
2 Sobic.008G024000 expressed protein -
3 Sobic.008G078966 - -
4 Sobic.001G060001 - -
5 Sobic.009G196100 dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G326100 nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase, putative, expressed -
7 Sobic.010G146350 - -
8 Sobic.005G207600 - -
9 Sobic.002G063201 - -
10 Sobic.010G228200 expressed protein -
11 Sobic.006G088500 OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.007G120600 KED, putative, expressed -
13 Sobic.004G327100 atATG18b, putative, expressed K17908: WIPI1_2, autophagy-related protein 18
14 Sobic.003G023100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
15 Sobic.007G100900 - -
16 Sobic.003G120050 - -
17 Sobic.004G052700 hypothetical protein -
18 Sobic.008G096401 - -
19 Sobic.003G021401 - -
20 Sobic.005G207550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G303950 Sobic002G303950 Sobic002G078600 Sobic002G078600 Sobic002G303950--Sobic002G078600 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic002G303950--Sobic008G024000 Sobic008G078966 Sobic008G078966 Sobic002G303950--Sobic008G078966 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic002G303950--Sobic001G060001 Sobic009G196100 Sobic009G196100 Sobic002G303950--Sobic009G196100 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic002G303950--Sobic003G326100 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic002G303950--Sobic010G146350 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic002G303950--Sobic005G207600 Sobic002G063201 Sobic002G063201 Sobic002G303950--Sobic002G063201 Sobic002G078600--Sobic002G303950 Sobic002G078600--Sobic003G326100 Sobic002G078600--Sobic009G196100 Sobic002G078600--Sobic001G060001 Sobic003G391700 Sobic003G391700 Sobic002G078600--Sobic003G391700 Sobic002G078600--Sobic008G078966 Sobic002G078600--Sobic008G024000 Sobic002G078600--Sobic010G146350 Sobic002G078600--Sobic005G207600 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic008G024000--Sobic007G100900 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic008G024000--Sobic003G120050 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic008G024000--Sobic006G137900 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic008G024000--Sobic004G013400 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic008G024000--Sobic001G138500 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic008G024000--Sobic008G008601 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic008G024000--Sobic004G122700 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic008G024000--Sobic001G452300 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic008G024000--Sobic001G190600 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic008G078966--Sobic005G207550 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic008G078966--Sobic007G027400 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic008G078966--Sobic008G008701 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic008G078966--Sobic001G045300 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic008G078966--Sobic004G090900 Sobic008G078966--Sobic004G122700 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic008G078966--Sobic002G046500 Sobic008G078966--Sobic001G138500 Sobic005G041700 Sobic005G041700 Sobic008G078966--Sobic005G041700 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic001G060001--Sobic007G120600 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic001G060001--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic001G060001--Sobic008G096401 Sobic001G060001--Sobic010G146350 Sobic001G060001--Sobic005G207600 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic001G060001--Sobic010G228200 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic001G060001--Sobic004G181100 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic001G060001--Sobic010G267651 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic001G060001--Sobic006G042800 Sobic009G196100--Sobic001G060001 Sobic009G196100--Sobic007G120600 Sobic009G196100--Sobic002G078600 Sobic007G007650 Sobic007G007650 Sobic009G196100--Sobic007G007650 Sobic009G196100--Sobic004G052700 Sobic009G196100--Sobic008G096401 Sobic009G196100--Sobic003G326100 Sobic009G196100--Sobic010G267651 Sobic009G196100--Sobic010G146350 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic003G326100--Sobic002G188800 Sobic003G326100--Sobic001G060001 Sobic003G326100--Sobic004G181100 Sobic003G326100--Sobic008G096401 Sobic003G326100--Sobic004G052700 Sobic003G326100--Sobic007G120600 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic003G326100--Sobic002G401301 Sobic003G326100--Sobic006G042800 Sobic002G159400 Sobic002G159400 Sobic003G326100--Sobic002G159400 Sobic010G146350--Sobic005G207600 Sobic010G146350--Sobic010G228200 Sobic010G146350--Sobic007G120600 Sobic010G146350--Sobic001G060001 Sobic010G146350--Sobic001G190600 Sobic010G146350--Sobic005G207550 Sobic010G146350--Sobic004G052700 Sobic010G146350--Sobic008G096401 Sobic010G146350--Sobic006G137900 Sobic005G207600--Sobic010G146350 Sobic005G207600--Sobic010G228200 Sobic005G207600--Sobic001G190600 Sobic005G207600--Sobic005G207550 Sobic005G207600--Sobic001G060001 Sobic005G207600--Sobic007G120600 Sobic005G207600--Sobic006G137900 Sobic005G207600--Sobic001G138500 Sobic005G207600--Sobic004G052700 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic002G063201--Sobic003G021401 Sobic002G063201--Sobic003G120050 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic002G063201--Sobic003G023100 Sobic002G063201--Sobic010G228200 Sobic002G063201--Sobic010G146350 Sobic002G063201--Sobic005G207600 Sobic002G063201--Sobic001G452300 Sobic004G327100 Sobic004G327100 Sobic002G063201--Sobic004G327100 Sobic002G063201--Sobic008G008601
Octagon: transcription factors


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