Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G088500.1
Synonym
Functional annotation OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PL12
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF75
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G28410 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g35940.1 : OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G120600 KED, putative, expressed -
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20 Sobic.003G021401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G088500 Sobic006G088500 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic006G088500--Sobic007G120600 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic006G088500--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic006G088500--Sobic008G096401 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic006G088500--Sobic001G060001 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic006G088500--Sobic010G267651 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic006G088500--Sobic004G181100 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic006G088500--Sobic002G188800 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic006G088500--Sobic010G146350 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic006G088500--Sobic005G207600 Sobic007G120600--Sobic004G052700 Sobic007G120600--Sobic008G096401 Sobic007G120600--Sobic001G060001 Sobic007G120600--Sobic010G146350 Sobic007G120600--Sobic005G207600 Sobic007G120600--Sobic010G267651 Sobic007G120600--Sobic004G181100 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic007G120600--Sobic010G228200 Sobic007G120600--Sobic002G188800 Sobic004G052700--Sobic008G096401 Sobic004G052700--Sobic007G120600 Sobic004G052700--Sobic001G060001 Sobic004G052700--Sobic004G181100 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic004G052700--Sobic006G042800 Sobic004G052700--Sobic010G267651 Sobic004G052700--Sobic002G188800 Sobic004G052700--Sobic010G146350 Sobic002G159400 Sobic002G159400 Sobic004G052700--Sobic002G159400 Sobic008G096401--Sobic004G052700 Sobic008G096401--Sobic007G120600 Sobic008G096401--Sobic001G060001 Sobic008G096401--Sobic004G181100 Sobic008G096401--Sobic006G042800 Sobic008G096401--Sobic010G267651 Sobic008G096401--Sobic002G188800 Sobic008G096401--Sobic010G146350 Sobic008G096401--Sobic002G159400 Sobic001G060001--Sobic007G120600 Sobic001G060001--Sobic004G052700 Sobic001G060001--Sobic008G096401 Sobic001G060001--Sobic010G146350 Sobic001G060001--Sobic005G207600 Sobic001G060001--Sobic010G228200 Sobic001G060001--Sobic004G181100 Sobic001G060001--Sobic010G267651 Sobic001G060001--Sobic006G042800 Sobic010G267651--Sobic002G188800 Sobic010G267651--Sobic007G120600 Sobic010G267651--Sobic008G096401 Sobic010G267651--Sobic004G052700 Sobic010G267651--Sobic004G181100 Sobic010G267651--Sobic001G060001 Sobic010G267651--Sobic006G042800 Sobic006G077900 Sobic006G077900 Sobic010G267651--Sobic006G077900 Sobic010G267651--Sobic002G159400 Sobic004G181100--Sobic006G042800 Sobic004G181100--Sobic002G188800 Sobic004G181100--Sobic002G159400 Sobic004G181100--Sobic008G096401 Sobic004G181100--Sobic004G052700 Sobic004G181100--Sobic007G120600 Sobic004G181100--Sobic010G267651 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic004G181100--Sobic004G274000 Sobic004G181100--Sobic001G060001 Sobic002G188800--Sobic004G181100 Sobic002G188800--Sobic010G267651 Sobic002G188800--Sobic006G042800 Sobic002G188800--Sobic002G159400 Sobic002G188800--Sobic008G096401 Sobic002G188800--Sobic004G052700 Sobic002G188800--Sobic004G274000 Sobic002G188800--Sobic007G120600 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic002G188800--Sobic002G401301 Sobic010G146350--Sobic005G207600 Sobic010G146350--Sobic010G228200 Sobic010G146350--Sobic007G120600 Sobic010G146350--Sobic001G060001 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic010G146350--Sobic001G190600 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic010G146350--Sobic005G207550 Sobic010G146350--Sobic004G052700 Sobic010G146350--Sobic008G096401 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic010G146350--Sobic006G137900 Sobic005G207600--Sobic010G146350 Sobic005G207600--Sobic010G228200 Sobic005G207600--Sobic001G190600 Sobic005G207600--Sobic005G207550 Sobic005G207600--Sobic001G060001 Sobic005G207600--Sobic007G120600 Sobic005G207600--Sobic006G137900 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic005G207600--Sobic001G138500 Sobic005G207600--Sobic004G052700
Octagon: transcription factors


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