Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G024000.1
Synonym Sb08g002070
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YR50
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g43990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G024000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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2 Sobic.003G120050 - -
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11 Sobic.003G021401 - -
12 Sobic.005G013700 - -
13 Sobic.005G207550 - -
14 Sobic.008G008701 - -
15 Sobic.003G407400 - -
16 Sobic.003G023100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
17 Sobic.005G207600 - -
18 Sobic.004G090900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
19 Sobic.009G142600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cysteine-rich receptor-like protein kinase 6 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.007G087500 hypothetical protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic008G024000--Sobic007G100900 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic008G024000--Sobic003G120050 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic008G024000--Sobic006G137900 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic008G024000--Sobic004G013400 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic008G024000--Sobic001G138500 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic008G024000--Sobic008G008601 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic008G024000--Sobic004G122700 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic008G024000--Sobic001G452300 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic008G024000--Sobic001G190600 Sobic004G327100 Sobic004G327100 Sobic007G100900--Sobic004G327100 Sobic007G100900--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic007G100900--Sobic008G008701 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic007G100900--Sobic005G207550 Sobic007G100900--Sobic001G138500 Sobic007G100900--Sobic001G190600 Sobic007G100900--Sobic008G008601 Sobic007G100900--Sobic006G137900 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic007G100900--Sobic004G090900 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic003G120050--Sobic003G021401 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic003G120050--Sobic003G023100 Sobic003G120050--Sobic008G008601 Sobic003G120050--Sobic001G452300 Sobic003G120050--Sobic004G013400 Sobic003G120050--Sobic006G137900 Sobic003G120050--Sobic001G138500 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic003G120050--Sobic005G207600 Sobic003G120050--Sobic001G190600 Sobic006G137900--Sobic005G207550 Sobic006G137900--Sobic004G122700 Sobic006G137900--Sobic001G138500 Sobic006G137900--Sobic001G190600 Sobic006G137900--Sobic008G008701 Sobic006G137900--Sobic008G008601 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic006G137900--Sobic005G013700 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic006G137900--Sobic004G325150 Sobic006G137900--Sobic004G090900 Sobic004G013400--Sobic001G190600 Sobic004G013400--Sobic008G008601 Sobic004G013400--Sobic004G122700 Sobic004G013400--Sobic006G137900 Sobic004G013400--Sobic001G452300 Sobic004G013400--Sobic001G138500 Sobic004G013400--Sobic008G008701 Sobic004G013400--Sobic005G207550 Sobic004G013400--Sobic003G120050 Sobic001G138500--Sobic005G207550 Sobic001G138500--Sobic008G008701 Sobic001G138500--Sobic004G122700 Sobic001G138500--Sobic001G190600 Sobic001G138500--Sobic006G137900 Sobic001G138500--Sobic004G090900 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic001G138500--Sobic001G045300 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic001G138500--Sobic007G027400 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic001G138500--Sobic002G046500 Sobic008G008601--Sobic001G452300 Sobic008G008601--Sobic004G122700 Sobic008G008601--Sobic008G008701 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic008G008601--Sobic002G063500 Sobic008G008601--Sobic004G090900 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic008G008601--Sobic008G069901 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic008G008601--Sobic007G087500 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic001G033701 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic008G008601--Sobic004G184900 Sobic004G122700--Sobic008G008701 Sobic004G122700--Sobic004G090900 Sobic004G122700--Sobic001G138500 Sobic004G122700--Sobic008G008601 Sobic004G122700--Sobic001G045300 Sobic004G122700--Sobic005G207550 Sobic004G122700--Sobic002G046500 Sobic004G122700--Sobic001G033701 Sobic004G122700--Sobic007G027400 Sobic001G452300--Sobic008G008601 Sobic001G452300--Sobic007G087500 Sobic001G452300--Sobic004G122700 Sobic001G452300--Sobic008G069901 Sobic001G452300--Sobic002G063500 Sobic001G452300--Sobic004G184900 Sobic001G452300--Sobic008G008701 Sobic001G452300--Sobic004G090900 Sobic001G452300--Sobic001G033701 Sobic001G190600--Sobic005G207550 Sobic001G190600--Sobic001G138500 Sobic001G190600--Sobic004G122700 Sobic001G190600--Sobic006G137900 Sobic001G190600--Sobic008G008701 Sobic001G190600--Sobic005G207600 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic001G190600--Sobic010G146350 Sobic001G190600--Sobic004G013400 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic001G190600--Sobic010G228200
Octagon: transcription factors


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