Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G078966.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5B0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G207550 - -
2 Sobic.007G027400 MBTB16 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
3 Sobic.008G008701 - -
4 Sobic.001G045300 ubiquitin family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G090900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
6 Sobic.004G122700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
7 Sobic.002G046500 gibberellin 20 oxidase 1-B, putative, expressed -
8 Sobic.001G138500 expressed protein -
9 Sobic.005G041700 - -
10 Sobic.001G358101 - -
11 Sobic.001G033701 - -
12 Sobic.004G162800 - -
13 Sobic.003G245101 - -
14 Sobic.002G084100 - -
15 Sobic.005G014600 OsMan09 - Endo-Beta-Mannanase, expressed K19355: mannan endo-1,4-beta-mannosidase
16 Sobic.003G190701 - -
17 Sobic.002G289601 - -
18 Sobic.010G140800 - -
19 Sobic.001G190600 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
20 Sobic.009G113300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G078966 Sobic008G078966 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic008G078966--Sobic005G207550 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic008G078966--Sobic007G027400 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic008G078966--Sobic008G008701 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic008G078966--Sobic001G045300 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic008G078966--Sobic004G090900 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic008G078966--Sobic004G122700 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic008G078966--Sobic002G046500 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic008G078966--Sobic001G138500 Sobic005G041700 Sobic005G041700 Sobic008G078966--Sobic005G041700 Sobic005G207550--Sobic001G138500 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic005G207550--Sobic001G190600 Sobic005G207550--Sobic008G008701 Sobic005G207550--Sobic004G122700 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic005G207550--Sobic006G137900 Sobic005G207550--Sobic001G045300 Sobic005G207550--Sobic004G090900 Sobic005G207550--Sobic007G027400 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic005G207550--Sobic005G207600 Sobic007G027400--Sobic001G045300 Sobic007G027400--Sobic002G046500 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic007G027400--Sobic001G358101 Sobic007G027400--Sobic004G090900 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic007G027400--Sobic004G162800 Sobic003G245101 Sobic003G245101 Sobic007G027400--Sobic003G245101 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic007G027400--Sobic002G084100 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic007G027400--Sobic003G190701 Sobic007G027400--Sobic008G008701 Sobic008G008701--Sobic004G122700 Sobic008G008701--Sobic004G090900 Sobic008G008701--Sobic001G045300 Sobic008G008701--Sobic001G138500 Sobic008G008701--Sobic002G046500 Sobic008G008701--Sobic007G027400 Sobic008G008701--Sobic005G207550 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G008701--Sobic001G033701 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic008G008701--Sobic008G008601 Sobic001G045300--Sobic007G027400 Sobic001G045300--Sobic002G046500 Sobic001G045300--Sobic004G090900 Sobic001G045300--Sobic001G358101 Sobic001G045300--Sobic004G162800 Sobic001G045300--Sobic003G245101 Sobic001G045300--Sobic002G084100 Sobic001G045300--Sobic008G008701 Sobic001G045300--Sobic003G190701 Sobic004G090900--Sobic002G046500 Sobic004G090900--Sobic001G045300 Sobic004G090900--Sobic007G027400 Sobic004G090900--Sobic008G008701 Sobic004G090900--Sobic002G084100 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic004G090900--Sobic005G014600 Sobic004G090900--Sobic004G122700 Sobic004G090900--Sobic001G033701 Sobic004G090900--Sobic003G245101 Sobic004G122700--Sobic008G008701 Sobic004G122700--Sobic004G090900 Sobic004G122700--Sobic001G138500 Sobic004G122700--Sobic008G008601 Sobic004G122700--Sobic001G045300 Sobic004G122700--Sobic005G207550 Sobic004G122700--Sobic002G046500 Sobic004G122700--Sobic001G033701 Sobic004G122700--Sobic007G027400 Sobic002G046500--Sobic004G090900 Sobic002G046500--Sobic001G045300 Sobic002G046500--Sobic007G027400 Sobic002G046500--Sobic002G084100 Sobic002G046500--Sobic003G245101 Sobic002G046500--Sobic004G162800 Sobic002G046500--Sobic001G358101 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic002G046500--Sobic002G289601 Sobic002G046500--Sobic005G014600 Sobic001G138500--Sobic005G207550 Sobic001G138500--Sobic008G008701 Sobic001G138500--Sobic004G122700 Sobic001G138500--Sobic001G190600 Sobic001G138500--Sobic006G137900 Sobic001G138500--Sobic004G090900 Sobic001G138500--Sobic001G045300 Sobic001G138500--Sobic007G027400 Sobic001G138500--Sobic002G046500 Sobic010G140800 Sobic010G140800 Sobic005G041700--Sobic010G140800 Sobic009G159800 Sobic009G159800 Sobic005G041700--Sobic009G159800 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic005G041700--Sobic001G234700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.