Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G539760.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SCB1
Pfam PF03330 PF01357
Panther DB PTHR31692 PTHR31692:SF21
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65680 : expansin B2
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01650.1 : expansin precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051986 , Zm00025a021677 , Zm00025a021679 , Zm00025a021678 , Zm00025a024285 , Zm00025a024287 , Zm00025a021682 , Zm00025a021683 , Zm00025a021680 , Zm00025a021681
Brachypodium KQJ97763
Barley HORVU1Hr1G054250.9 , HORVU1Hr1G054250.8 , HORVU1Hr1G054250.5 , HORVU1Hr1G054250.7
Wheat TraesCS1A02G212200 , TraesCS1B02G226100 , TraesCS1A02G212600 , TraesCS1B02G225800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G326100 nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase, putative, expressed -
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20 Sobic.010G146350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G539760 Sobic001G539760 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic001G539760--Sobic003G326100 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic001G539760--Sobic004G181100 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic001G539760--Sobic002G188800 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic001G539760--Sobic006G042800 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic001G539760--Sobic001G060001 Sobic002G159400 Sobic002G159400 Sobic001G539760--Sobic002G159400 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic001G539760--Sobic008G096401 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic001G539760--Sobic004G052700 Sobic007G035100 Sobic007G035100 Sobic001G539760--Sobic007G035100 Sobic003G326100--Sobic002G188800 Sobic003G326100--Sobic001G060001 Sobic003G326100--Sobic004G181100 Sobic003G326100--Sobic008G096401 Sobic003G326100--Sobic004G052700 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic003G326100--Sobic007G120600 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic003G326100--Sobic002G401301 Sobic003G326100--Sobic006G042800 Sobic003G326100--Sobic002G159400 Sobic004G181100--Sobic006G042800 Sobic004G181100--Sobic002G188800 Sobic004G181100--Sobic002G159400 Sobic004G181100--Sobic008G096401 Sobic004G181100--Sobic004G052700 Sobic004G181100--Sobic007G120600 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic004G181100--Sobic010G267651 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic004G181100--Sobic004G274000 Sobic004G181100--Sobic001G060001 Sobic002G188800--Sobic004G181100 Sobic002G188800--Sobic010G267651 Sobic002G188800--Sobic006G042800 Sobic002G188800--Sobic002G159400 Sobic002G188800--Sobic008G096401 Sobic002G188800--Sobic004G052700 Sobic002G188800--Sobic004G274000 Sobic002G188800--Sobic007G120600 Sobic002G188800--Sobic002G401301 Sobic006G042800--Sobic002G159400 Sobic006G042800--Sobic004G181100 Sobic006G042800--Sobic002G188800 Sobic006G042800--Sobic008G096401 Sobic006G042800--Sobic004G052700 Sobic006G042800--Sobic007G120600 Sobic006G042800--Sobic010G267651 Sobic006G042800--Sobic004G274000 Sobic006G042800--Sobic001G060001 Sobic001G060001--Sobic007G120600 Sobic001G060001--Sobic004G052700 Sobic001G060001--Sobic008G096401 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic001G060001--Sobic010G146350 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic001G060001--Sobic005G207600 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic001G060001--Sobic010G228200 Sobic001G060001--Sobic004G181100 Sobic001G060001--Sobic010G267651 Sobic001G060001--Sobic006G042800 Sobic002G159400--Sobic006G042800 Sobic002G159400--Sobic004G181100 Sobic002G159400--Sobic002G188800 Sobic002G159400--Sobic008G096401 Sobic002G159400--Sobic004G052700 Sobic002G159400--Sobic004G274000 Sobic002G159400--Sobic007G120600 Sobic002G159400--Sobic010G267651 Sobic002G159400--Sobic001G060001 Sobic008G096401--Sobic004G052700 Sobic008G096401--Sobic007G120600 Sobic008G096401--Sobic001G060001 Sobic008G096401--Sobic004G181100 Sobic008G096401--Sobic006G042800 Sobic008G096401--Sobic010G267651 Sobic008G096401--Sobic002G188800 Sobic008G096401--Sobic010G146350 Sobic008G096401--Sobic002G159400 Sobic004G052700--Sobic008G096401 Sobic004G052700--Sobic007G120600 Sobic004G052700--Sobic001G060001 Sobic004G052700--Sobic004G181100 Sobic004G052700--Sobic006G042800 Sobic004G052700--Sobic010G267651 Sobic004G052700--Sobic002G188800 Sobic004G052700--Sobic010G146350 Sobic004G052700--Sobic002G159400 Sobic010G111700 Sobic010G111700 Sobic007G035100--Sobic010G111700 Sobic007G035100--Sobic004G274000 Sobic004G286351 Sobic004G286351 Sobic007G035100--Sobic004G286351 Sobic007G069450 Sobic007G069450 Sobic007G035100--Sobic007G069450 Sobic007G035100--Sobic004G181100 Sobic007G035100--Sobic006G042800 Sobic007G035100--Sobic002G159400 Sobic007G035100--Sobic002G188800 Sobic007G035100--Sobic002G401301
Octagon: transcription factors


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