Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G066250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VW10
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
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Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G267651 - -
2 Sobic.007G120600 KED, putative, expressed -
3 Sobic.004G052700 hypothetical protein -
4 Sobic.008G096401 - -
5 Sobic.001G060001 - -
6 Sobic.002G188800 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
7 Sobic.003G023100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
8 Sobic.006G077900 cysteine synthase, putative, expressed K01738: cysteine synthase
9 Sobic.010G146350 - -
10 Sobic.006G042800 expressed protein -
11 Sobic.005G207600 - -
12 Sobic.003G021401 - -
13 Sobic.004G181100 expressed protein -
14 Sobic.002G277366 - -
15 Sobic.002G159400 expressed protein -
16 Sobic.003G120050 - -
17 Sobic.010G228200 expressed protein -
18 Sobic.002G401301 - -
19 Sobic.002G063201 - -
20 Sobic.006G088500 OsFBX135 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G066250 Sobic003G066250 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic003G066250--Sobic010G267651 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic003G066250--Sobic007G120600 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic003G066250--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic003G066250--Sobic008G096401 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic003G066250--Sobic001G060001 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic003G066250--Sobic002G188800 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic003G066250--Sobic003G023100 Sobic006G077900 Sobic006G077900 Sobic003G066250--Sobic006G077900 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic003G066250--Sobic010G146350 Sobic010G267651--Sobic002G188800 Sobic010G267651--Sobic007G120600 Sobic010G267651--Sobic008G096401 Sobic010G267651--Sobic004G052700 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic010G267651--Sobic004G181100 Sobic010G267651--Sobic001G060001 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic010G267651--Sobic006G042800 Sobic010G267651--Sobic006G077900 Sobic002G159400 Sobic002G159400 Sobic010G267651--Sobic002G159400 Sobic007G120600--Sobic004G052700 Sobic007G120600--Sobic008G096401 Sobic007G120600--Sobic001G060001 Sobic007G120600--Sobic010G146350 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic007G120600--Sobic005G207600 Sobic007G120600--Sobic010G267651 Sobic007G120600--Sobic004G181100 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic007G120600--Sobic010G228200 Sobic007G120600--Sobic002G188800 Sobic004G052700--Sobic008G096401 Sobic004G052700--Sobic007G120600 Sobic004G052700--Sobic001G060001 Sobic004G052700--Sobic004G181100 Sobic004G052700--Sobic006G042800 Sobic004G052700--Sobic010G267651 Sobic004G052700--Sobic002G188800 Sobic004G052700--Sobic010G146350 Sobic004G052700--Sobic002G159400 Sobic008G096401--Sobic004G052700 Sobic008G096401--Sobic007G120600 Sobic008G096401--Sobic001G060001 Sobic008G096401--Sobic004G181100 Sobic008G096401--Sobic006G042800 Sobic008G096401--Sobic010G267651 Sobic008G096401--Sobic002G188800 Sobic008G096401--Sobic010G146350 Sobic008G096401--Sobic002G159400 Sobic001G060001--Sobic007G120600 Sobic001G060001--Sobic004G052700 Sobic001G060001--Sobic008G096401 Sobic001G060001--Sobic010G146350 Sobic001G060001--Sobic005G207600 Sobic001G060001--Sobic010G228200 Sobic001G060001--Sobic004G181100 Sobic001G060001--Sobic010G267651 Sobic001G060001--Sobic006G042800 Sobic002G188800--Sobic004G181100 Sobic002G188800--Sobic010G267651 Sobic002G188800--Sobic006G042800 Sobic002G188800--Sobic002G159400 Sobic002G188800--Sobic008G096401 Sobic002G188800--Sobic004G052700 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic002G188800--Sobic004G274000 Sobic002G188800--Sobic007G120600 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic002G188800--Sobic002G401301 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic003G023100--Sobic003G120050 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic003G023100--Sobic003G021401 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic003G023100--Sobic004G200501 Sobic003G023100--Sobic010G146350 Sobic003G023100--Sobic005G207600 Sobic002G277366 Sobic002G277366 Sobic003G023100--Sobic002G277366 Sobic003G023100--Sobic010G228200 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic003G023100--Sobic006G137900 Sobic003G023100--Sobic007G120600 Sobic006G077900--Sobic010G267651 Sobic006G077900--Sobic002G188800 Sobic006G077900--Sobic002G401301 Sobic006G077900--Sobic002G277366 Sobic006G077900--Sobic004G181100 Sobic006G077900--Sobic004G274000 Sobic006G077900--Sobic003G066250 Sobic006G077900--Sobic007G120600 Sobic006G077900--Sobic006G042800 Sobic010G146350--Sobic005G207600 Sobic010G146350--Sobic010G228200 Sobic010G146350--Sobic007G120600 Sobic010G146350--Sobic001G060001 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic010G146350--Sobic001G190600 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic010G146350--Sobic005G207550 Sobic010G146350--Sobic004G052700 Sobic010G146350--Sobic008G096401 Sobic010G146350--Sobic006G137900
Octagon: transcription factors


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