Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G151100.1
Synonym PQL3
Functional annotation oxygen-evolving enhancer protein 3, chloroplast precursor, putative, expressed
UniProt A0A1B6PM37
Pfam PF05757
Panther DB PTHR33399 PTHR33399:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0015979; photosynthesis GO:0009654photosystem II oxygen evolving complex GO:0009523photosystem II GO:0005509calcium ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G01918 : PsbQ-like 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g44200.1 : oxygen-evolving enhancer protein 3, chloroplast precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010629
Brachypodium KQJ83654 , KQJ83655 , KQJ83653
Barley HORVU2Hr1G090100.1 , HORVU2Hr1G090100.2 , HORVU2Hr1G090100.3 , HORVU2Hr1G090100.4 , HORVU2Hr1G090100.5 , HORVU2Hr1G090100.6 , HORVU2Hr1G090100.7 , HORVU2Hr1G090100.8 , HORVU2Hr1G090100.9 , HORVU2Hr1G090100.23 , HORVU2Hr1G090100.22 , HORVU2Hr1G090100.21 , HORVU2Hr1G090100.20 , HORVU2Hr1G090100.27 , HORVU2Hr1G090100.26 , HORVU2Hr1G090100.25 , HORVU2Hr1G090100.24 , HORVU2Hr1G090100.29 , HORVU2Hr1G090100.28 , HORVU2Hr1G090100.18 , HORVU2Hr1G090100.19 , HORVU2Hr1G090100.12 , HORVU2Hr1G090100.13 , HORVU2Hr1G090100.10 , HORVU2Hr1G090100.11 , HORVU2Hr1G090100.16 , HORVU2Hr1G090100.17 , HORVU2Hr1G090100.14 , HORVU2Hr1G090100.15
Wheat TraesCS2D02G374900 , TraesCS2B02G395700 , TraesCS2A02G378700
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G151100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.003G126750 - -
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20 Sobic.004G095400 calcium-binding EF hand family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic006G141400 Sobic006G141400 Sobic006G151100--Sobic006G141400 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic006G151100--Sobic004G358150 Sobic007G007600 Sobic007G007600 Sobic006G151100--Sobic007G007600 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic006G151100--Sobic007G064000 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic006G151100--Sobic002G086700 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic006G151100--Sobic002G244901 Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic006G151100--Sobic002G036500 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic006G151100--Sobic005G031901 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic006G151100--Sobic002G175700 Sobic006G141400--Sobic007G007600 Sobic006G141400--Sobic002G036500 Sobic006G141400--Sobic007G064000 Sobic006G141400--Sobic002G175700 Sobic002G208850 Sobic002G208850 Sobic006G141400--Sobic002G208850 Sobic006G141400--Sobic006G151100 Sobic006G141400--Sobic005G031901 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic006G141400--Sobic006G109600 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic006G141400--Sobic003G126750 Sobic004G358150--Sobic002G086700 Sobic004G358150--Sobic002G244901 Sobic004G358150--Sobic006G151100 Sobic003G375800 Sobic003G375800 Sobic004G358150--Sobic003G375800 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic004G358150--Sobic002G377501 Sobic005G196533 Sobic005G196533 Sobic004G358150--Sobic005G196533 Sobic001G498033 Sobic001G498033 Sobic004G358150--Sobic001G498033 Sobic002G076300 Sobic002G076300 Sobic004G358150--Sobic002G076300 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic004G358150--Sobic001G329001 Sobic007G007600--Sobic002G036500 Sobic007G007600--Sobic006G141400 Sobic007G007600--Sobic007G064000 Sobic007G007600--Sobic002G175700 Sobic007G007600--Sobic006G151100 Sobic007G007600--Sobic005G031901 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic007G007600--Sobic004G358200 Sobic007G007600--Sobic006G109600 Sobic007G007600--Sobic003G126750 Sobic007G064000--Sobic005G031901 Sobic007G064000--Sobic002G175700 Sobic007G064000--Sobic006G109600 Sobic007G064000--Sobic003G126750 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic007G064000--Sobic010G147300 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic007G064000--Sobic001G261464 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic007G064000--Sobic002G100100 Sobic007G064000--Sobic007G007600 Sobic007G064000--Sobic004G358200 Sobic002G086700--Sobic004G358150 Sobic002G086700--Sobic001G329001 Sobic003G410000 Sobic003G410000 Sobic002G086700--Sobic003G410000 Sobic002G086700--Sobic002G076300 Sobic002G086700--Sobic002G244901 Sobic003G347560 Sobic003G347560 Sobic002G086700--Sobic003G347560 Sobic002G086700--Sobic001G498033 Sobic002G086700--Sobic006G151100 Sobic002G086700--Sobic003G375800 Sobic002G244901--Sobic003G375800 Sobic002G244901--Sobic004G358150 Sobic002G244901--Sobic002G086700 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic002G244901--Sobic003G443601 Sobic002G244901--Sobic006G151100 Sobic003G078700 Sobic003G078700 Sobic002G244901--Sobic003G078700 Sobic002G244901--Sobic002G377501 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic002G244901--Sobic010G210050 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic002G244901--Sobic009G223000 Sobic002G036500--Sobic007G007600 Sobic002G036500--Sobic006G141400 Sobic002G036500--Sobic007G064000 Sobic002G036500--Sobic006G151100 Sobic002G036500--Sobic002G208850 Sobic002G036500--Sobic001G329001 Sobic002G036500--Sobic002G086700 Sobic002G257150 Sobic002G257150 Sobic002G036500--Sobic002G257150 Sobic002G036500--Sobic002G175700 Sobic005G031901--Sobic010G147300 Sobic005G031901--Sobic006G109600 Sobic005G031901--Sobic003G126750 Sobic005G031901--Sobic001G261464 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic005G031901--Sobic004G358301 Sobic005G031901--Sobic002G100100 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic005G031901--Sobic002G026150 Sobic005G031901--Sobic002G175700 Sobic005G031901--Sobic007G064000 Sobic002G175700--Sobic006G109600 Sobic002G175700--Sobic005G031901 Sobic002G175700--Sobic010G147300 Sobic002G175700--Sobic007G064000 Sobic002G175700--Sobic003G126750 Sobic002G175700--Sobic001G261464 Sobic002G175700--Sobic002G100100 Sobic002G175700--Sobic002G026150 Sobic002G175700--Sobic004G358301
Octagon: transcription factors


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