Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G036500.1
Synonym Sb02g003170
Functional annotation ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt C5X9L2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G14010 : C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g05900.1 : ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045040 , Zm00025a052055 , Zm00025a016634 , Zm00025a004718
Brachypodium PNT77155 , KQK12854 , KQJ85751 , KQK21073
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G007600 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
2 Sobic.006G141400 expressed protein -
3 Sobic.007G064000 expressed protein -
4 Sobic.006G151100 oxygen-evolving enhancer protein 3, chloroplast precursor, putative, expressed -
5 Sobic.002G208850 - -
6 Sobic.001G329001 - K03129: transcription initiation factor TFIID subunit 4
7 Sobic.002G086700 - -
8 Sobic.002G257150 - -
9 Sobic.002G175700 STE_MEK_ste7_MAP2K.3 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K04368: MAP2K1, mitogen-activated protein kinase kinase 1
10 Sobic.010G256866 - -
11 Sobic.001G182400 - -
12 Sobic.004G358150 - -
13 Sobic.004G358200 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G031901 - -
15 Sobic.006G109600 - -
16 Sobic.003G126750 - -
17 Sobic.010G147300 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
18 Sobic.003G347560 - -
19 Sobic.003G410000 expressed protein -
20 Sobic.001G261464 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic007G007600 Sobic007G007600 Sobic002G036500--Sobic007G007600 Sobic006G141400 Sobic006G141400 Sobic002G036500--Sobic006G141400 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic002G036500--Sobic007G064000 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic002G036500--Sobic006G151100 Sobic002G208850 Sobic002G208850 Sobic002G036500--Sobic002G208850 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic002G036500--Sobic001G329001 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic002G036500--Sobic002G086700 Sobic002G257150 Sobic002G257150 Sobic002G036500--Sobic002G257150 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic002G036500--Sobic002G175700 Sobic007G007600--Sobic002G036500 Sobic007G007600--Sobic006G141400 Sobic007G007600--Sobic007G064000 Sobic007G007600--Sobic002G175700 Sobic007G007600--Sobic006G151100 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic007G007600--Sobic005G031901 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic007G007600--Sobic004G358200 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic007G007600--Sobic006G109600 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic007G007600--Sobic003G126750 Sobic006G141400--Sobic007G007600 Sobic006G141400--Sobic002G036500 Sobic006G141400--Sobic007G064000 Sobic006G141400--Sobic002G175700 Sobic006G141400--Sobic002G208850 Sobic006G141400--Sobic006G151100 Sobic006G141400--Sobic005G031901 Sobic006G141400--Sobic006G109600 Sobic006G141400--Sobic003G126750 Sobic007G064000--Sobic005G031901 Sobic007G064000--Sobic002G175700 Sobic007G064000--Sobic006G109600 Sobic007G064000--Sobic003G126750 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic007G064000--Sobic010G147300 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic007G064000--Sobic001G261464 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic007G064000--Sobic002G100100 Sobic007G064000--Sobic007G007600 Sobic007G064000--Sobic004G358200 Sobic006G151100--Sobic006G141400 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic006G151100--Sobic004G358150 Sobic006G151100--Sobic007G007600 Sobic006G151100--Sobic007G064000 Sobic006G151100--Sobic002G086700 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic006G151100--Sobic002G244901 Sobic006G151100--Sobic002G036500 Sobic006G151100--Sobic005G031901 Sobic006G151100--Sobic002G175700 Sobic002G208850--Sobic006G141400 Sobic002G208850--Sobic002G036500 Sobic002G208850--Sobic007G007600 Sobic010G256866 Sobic010G256866 Sobic002G208850--Sobic010G256866 Sobic002G208850--Sobic002G175700 Sobic002G215932 Sobic002G215932 Sobic002G208850--Sobic002G215932 Sobic002G208850--Sobic007G064000 Sobic001G182400 Sobic001G182400 Sobic002G208850--Sobic001G182400 Sobic002G208850--Sobic006G151100 Sobic003G410000 Sobic003G410000 Sobic001G329001--Sobic003G410000 Sobic004G058400 Sobic004G058400 Sobic001G329001--Sobic004G058400 Sobic001G329001--Sobic002G086700 Sobic001G329001--Sobic002G257150 Sobic002G076300 Sobic002G076300 Sobic001G329001--Sobic002G076300 Sobic008G177100 Sobic008G177100 Sobic001G329001--Sobic008G177100 Sobic010G195000 Sobic010G195000 Sobic001G329001--Sobic010G195000 Sobic003G347560 Sobic003G347560 Sobic001G329001--Sobic003G347560 Sobic006G134300 Sobic006G134300 Sobic001G329001--Sobic006G134300 Sobic002G086700--Sobic004G358150 Sobic002G086700--Sobic001G329001 Sobic002G086700--Sobic003G410000 Sobic002G086700--Sobic002G076300 Sobic002G086700--Sobic002G244901 Sobic002G086700--Sobic003G347560 Sobic001G498033 Sobic001G498033 Sobic002G086700--Sobic001G498033 Sobic002G086700--Sobic006G151100 Sobic003G375800 Sobic003G375800 Sobic002G086700--Sobic003G375800 Sobic002G257150--Sobic001G329001 Sobic005G132100 Sobic005G132100 Sobic002G257150--Sobic005G132100 Sobic002G257150--Sobic003G410000 Sobic004G248200 Sobic004G248200 Sobic002G257150--Sobic004G248200 Sobic002G257150--Sobic004G058400 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic002G257150--Sobic004G242800 Sobic002G257150--Sobic002G076300 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic002G257150--Sobic004G206600 Sobic002G257150--Sobic002G086700 Sobic002G175700--Sobic006G109600 Sobic002G175700--Sobic005G031901 Sobic002G175700--Sobic010G147300 Sobic002G175700--Sobic007G064000 Sobic002G175700--Sobic003G126750 Sobic002G175700--Sobic001G261464 Sobic002G175700--Sobic002G100100 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic002G175700--Sobic002G026150 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic002G175700--Sobic004G358301
Octagon: transcription factors


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