Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G208850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W5C5
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF103
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g09730.1 : OsFBX273 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G141400 expressed protein -
2 Sobic.002G036500 ZOS7-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
3 Sobic.007G007600 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
4 Sobic.010G256866 - -
5 Sobic.002G175700 STE_MEK_ste7_MAP2K.3 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K04368: MAP2K1, mitogen-activated protein kinase kinase 1
6 Sobic.002G215932 - -
7 Sobic.007G064000 expressed protein -
8 Sobic.001G182400 - -
9 Sobic.006G151100 oxygen-evolving enhancer protein 3, chloroplast precursor, putative, expressed -
10 Sobic.005G031901 - -
11 Sobic.003G126750 - -
12 Sobic.006G109600 - -
13 Sobic.010G147300 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
14 Sobic.002G100100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
15 Sobic.001G261464 - -
16 Sobic.004G358200 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G026150 - -
18 Sobic.002G348800 - -
19 Sobic.004G358301 - -
20 Sobic.004G243700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G208850 Sobic002G208850 Sobic006G141400 Sobic006G141400 Sobic002G208850--Sobic006G141400 Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic002G208850--Sobic002G036500 Sobic007G007600 Sobic007G007600 Sobic002G208850--Sobic007G007600 Sobic010G256866 Sobic010G256866 Sobic002G208850--Sobic010G256866 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic002G208850--Sobic002G175700 Sobic002G215932 Sobic002G215932 Sobic002G208850--Sobic002G215932 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic002G208850--Sobic007G064000 Sobic001G182400 Sobic001G182400 Sobic002G208850--Sobic001G182400 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic002G208850--Sobic006G151100 Sobic006G141400--Sobic007G007600 Sobic006G141400--Sobic002G036500 Sobic006G141400--Sobic007G064000 Sobic006G141400--Sobic002G175700 Sobic006G141400--Sobic002G208850 Sobic006G141400--Sobic006G151100 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic006G141400--Sobic005G031901 Sobic006G109600 Sobic006G109600 Sobic006G141400--Sobic006G109600 Sobic003G126750 Sobic003G126750 Sobic006G141400--Sobic003G126750 Sobic002G036500--Sobic007G007600 Sobic002G036500--Sobic006G141400 Sobic002G036500--Sobic007G064000 Sobic002G036500--Sobic006G151100 Sobic002G036500--Sobic002G208850 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic002G036500--Sobic001G329001 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic002G036500--Sobic002G086700 Sobic002G257150 Sobic002G257150 Sobic002G036500--Sobic002G257150 Sobic002G036500--Sobic002G175700 Sobic007G007600--Sobic002G036500 Sobic007G007600--Sobic006G141400 Sobic007G007600--Sobic007G064000 Sobic007G007600--Sobic002G175700 Sobic007G007600--Sobic006G151100 Sobic007G007600--Sobic005G031901 Sobic004G358200 Sobic004G358200 Sobic007G007600--Sobic004G358200 Sobic007G007600--Sobic006G109600 Sobic007G007600--Sobic003G126750 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic010G256866--Sobic009G036366 Sobic010G256866--Sobic006G151100 Sobic010G256866--Sobic006G141400 Sobic006G246400 Sobic006G246400 Sobic010G256866--Sobic006G246400 Sobic010G256866--Sobic002G208850 Sobic010G256866--Sobic002G036500 Sobic009G223000 Sobic009G223000 Sobic010G256866--Sobic009G223000 Sobic010G256866--Sobic001G329001 Sobic010G256866--Sobic002G086700 Sobic002G175700--Sobic006G109600 Sobic002G175700--Sobic005G031901 Sobic010G147300 Sobic010G147300 Sobic002G175700--Sobic010G147300 Sobic002G175700--Sobic007G064000 Sobic002G175700--Sobic003G126750 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic002G175700--Sobic001G261464 Sobic002G100100 Sobic002G100100 Sobic002G175700--Sobic002G100100 Sobic002G026150 Sobic002G026150 Sobic002G175700--Sobic002G026150 Sobic004G358301 Sobic004G358301 Sobic002G175700--Sobic004G358301 Sobic009G206150 Sobic009G206150 Sobic002G215932--Sobic009G206150 Sobic001G270301 Sobic001G270301 Sobic002G215932--Sobic001G270301 Sobic001G448900 Sobic001G448900 Sobic002G215932--Sobic001G448900 Sobic002G348800 Sobic002G348800 Sobic002G215932--Sobic002G348800 Sobic004G081701 Sobic004G081701 Sobic002G215932--Sobic004G081701 Sobic001G410400 Sobic001G410400 Sobic002G215932--Sobic001G410400 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic002G215932--Sobic007G135301 Sobic002G215932--Sobic002G208850 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic002G215932--Sobic001G071250 Sobic007G064000--Sobic005G031901 Sobic007G064000--Sobic002G175700 Sobic007G064000--Sobic006G109600 Sobic007G064000--Sobic003G126750 Sobic007G064000--Sobic010G147300 Sobic007G064000--Sobic001G261464 Sobic007G064000--Sobic002G100100 Sobic007G064000--Sobic007G007600 Sobic007G064000--Sobic004G358200 Sobic001G182400--Sobic001G329001 Sobic007G143600 Sobic007G143600 Sobic001G182400--Sobic007G143600 Sobic001G182400--Sobic002G086700 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic001G182400--Sobic004G358150 Sobic009G136950 Sobic009G136950 Sobic001G182400--Sobic009G136950 Sobic008G177100 Sobic008G177100 Sobic001G182400--Sobic008G177100 Sobic002G076300 Sobic002G076300 Sobic001G182400--Sobic002G076300 Sobic001G182400--Sobic002G036500 Sobic003G410000 Sobic003G410000 Sobic001G182400--Sobic003G410000 Sobic006G151100--Sobic006G141400 Sobic006G151100--Sobic004G358150 Sobic006G151100--Sobic007G007600 Sobic006G151100--Sobic007G064000 Sobic006G151100--Sobic002G086700 Sobic002G244901 Sobic002G244901 Sobic006G151100--Sobic002G244901 Sobic006G151100--Sobic002G036500 Sobic006G151100--Sobic005G031901 Sobic006G151100--Sobic002G175700
Octagon: transcription factors


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