Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G205400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YQV0
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cDNA sequences
Sobic.004G205400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G260101 - -
2 Sobic.005G116601 - -
3 Sobic.001G087500 - -
4 Sobic.004G162600 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
5 Sobic.010G060701 - K07964: heparanase
6 Sobic.002G359200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
7 Sobic.010G278400 coiled-coil domain-containing protein 12, putative, expressed K12871: coiled-coil domain-containing protein 12
8 Sobic.003G406240 - -
9 Sobic.001G523300 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G187900 ethylene-responsive protein related, putative, expressed -
11 Sobic.010G118600 sodium/potassium/calcium exchanger 1, putative, expressed -
12 Sobic.002G396900 csAtPR5, putative, expressed -
13 Sobic.008G185000 - -
14 Sobic.009G106300 - -
15 Sobic.001G490600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G017300 CTP synthase, putative, expressed K01937: pyrG, CTP synthase
17 Sobic.005G145700 - -
18 Sobic.010G021401 - -
19 Sobic.010G118401 - -
20 Sobic.009G031300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G205400 Sobic004G205400 Sobic006G260101 Sobic006G260101 Sobic004G205400--Sobic006G260101 Sobic005G116601 Sobic005G116601 Sobic004G205400--Sobic005G116601 Sobic001G087500 Sobic001G087500 Sobic004G205400--Sobic001G087500 Sobic004G162600 Sobic004G162600 Sobic004G205400--Sobic004G162600 Sobic010G060701 Sobic010G060701 Sobic004G205400--Sobic010G060701 Sobic002G359200 Sobic002G359200 Sobic004G205400--Sobic002G359200 Sobic010G278400 Sobic010G278400 Sobic004G205400--Sobic010G278400 Sobic003G406240 Sobic003G406240 Sobic004G205400--Sobic003G406240 Sobic001G523300 Sobic001G523300 Sobic004G205400--Sobic001G523300 Sobic006G260101--Sobic010G278400 Sobic006G260101--Sobic004G205400 Sobic005G145700 Sobic005G145700 Sobic006G260101--Sobic005G145700 Sobic006G260101--Sobic004G162600 Sobic009G106300 Sobic009G106300 Sobic006G260101--Sobic009G106300 Sobic009G187900 Sobic009G187900 Sobic006G260101--Sobic009G187900 Sobic003G017300 Sobic003G017300 Sobic006G260101--Sobic003G017300 Sobic006G260101--Sobic001G087500 Sobic006G260101--Sobic002G359200 Sobic010G118600 Sobic010G118600 Sobic005G116601--Sobic010G118600 Sobic005G116601--Sobic004G205400 Sobic005G116601--Sobic001G087500 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic005G116601--Sobic003G250340 Sobic005G116601--Sobic004G162600 Sobic003G130650 Sobic003G130650 Sobic005G116601--Sobic003G130650 Sobic010G196200 Sobic010G196200 Sobic005G116601--Sobic010G196200 Sobic002G035100 Sobic002G035100 Sobic005G116601--Sobic002G035100 Sobic005G038700 Sobic005G038700 Sobic005G116601--Sobic005G038700 Sobic001G087500--Sobic010G278400 Sobic001G087500--Sobic004G205400 Sobic001G087500--Sobic009G187900 Sobic001G087500--Sobic010G118600 Sobic001G087500--Sobic005G116601 Sobic007G114650 Sobic007G114650 Sobic001G087500--Sobic007G114650 Sobic001G087500--Sobic010G060701 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic001G087500--Sobic009G181900 Sobic010G118401 Sobic010G118401 Sobic001G087500--Sobic010G118401 Sobic004G162600--Sobic009G187900 Sobic004G162600--Sobic004G205400 Sobic004G162600--Sobic006G260101 Sobic004G162600--Sobic003G250340 Sobic009G043200 Sobic009G043200 Sobic004G162600--Sobic009G043200 Sobic004G162600--Sobic010G196200 Sobic004G162600--Sobic005G116601 Sobic002G334900 Sobic002G334900 Sobic004G162600--Sobic002G334900 Sobic004G096000 Sobic004G096000 Sobic004G162600--Sobic004G096000 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic010G060701--Sobic008G185000 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic010G060701--Sobic001G490600 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic010G060701--Sobic009G170301 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic010G060701--Sobic006G093400 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic010G060701--Sobic002G252700 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic010G060701--Sobic010G257300 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic010G060701--Sobic001G400101 Sobic010G060701--Sobic004G205400 Sobic004G015500 Sobic004G015500 Sobic010G060701--Sobic004G015500 Sobic002G359200--Sobic003G406240 Sobic002G359200--Sobic001G523300 Sobic002G359200--Sobic004G205400 Sobic004G011201 Sobic004G011201 Sobic002G359200--Sobic004G011201 Sobic002G396900 Sobic002G396900 Sobic002G359200--Sobic002G396900 Sobic005G002500 Sobic005G002500 Sobic002G359200--Sobic005G002500 Sobic001G308450 Sobic001G308450 Sobic002G359200--Sobic001G308450 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic002G359200--Sobic001G537600 Sobic006G037000 Sobic006G037000 Sobic002G359200--Sobic006G037000 Sobic010G278400--Sobic006G260101 Sobic010G278400--Sobic007G114650 Sobic010G278400--Sobic001G087500 Sobic004G202750 Sobic004G202750 Sobic010G278400--Sobic004G202750 Sobic010G278400--Sobic005G145700 Sobic006G170800 Sobic006G170800 Sobic010G278400--Sobic006G170800 Sobic010G278400--Sobic009G181900 Sobic010G278400--Sobic010G118401 Sobic010G278400--Sobic009G187900 Sobic003G406240--Sobic001G523300 Sobic003G406240--Sobic002G396900 Sobic009G031300 Sobic009G031300 Sobic003G406240--Sobic009G031300 Sobic003G406240--Sobic006G037000 Sobic008G096150 Sobic008G096150 Sobic003G406240--Sobic008G096150 Sobic003G406240--Sobic002G359200 Sobic009G072400 Sobic009G072400 Sobic003G406240--Sobic009G072400 Sobic010G200800 Sobic010G200800 Sobic003G406240--Sobic010G200800 Sobic003G406240--Sobic004G205400 Sobic001G523300--Sobic003G406240 Sobic001G523300--Sobic002G396900 Sobic001G523300--Sobic008G096150 Sobic001G523300--Sobic009G031300 Sobic001G523300--Sobic006G037000 Sobic001G523300--Sobic010G200800 Sobic001G523300--Sobic009G072400 Sobic002G326200 Sobic002G326200 Sobic001G523300--Sobic002G326200 Sobic007G174100 Sobic007G174100 Sobic001G523300--Sobic007G174100
Octagon: transcription factors


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