Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G106300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P7R3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.009G106300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G087900 - -
2 Sobic.003G017300 CTP synthase, putative, expressed K01937: pyrG, CTP synthase
3 Sobic.006G269300 - -
4 Sobic.009G005750 - -
5 Sobic.006G260101 - -
6 Sobic.003G315900 - -
7 Sobic.002G359200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
8 Sobic.009G054200 pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.001G061000 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G227601 - -
11 Sobic.010G278400 coiled-coil domain-containing protein 12, putative, expressed K12871: coiled-coil domain-containing protein 12
12 Sobic.001G456650 - K13066: E2.1.1.68, caffeic acid 3-O-methyltransferase
13 Sobic.001G308450 - -
14 Sobic.007G165200 - -
15 Sobic.004G205400 - -
16 Sobic.009G187900 ethylene-responsive protein related, putative, expressed -
17 Sobic.010G060701 - K07964: heparanase
18 Sobic.003G406240 - -
19 Sobic.007G114650 - -
20 Sobic.006G170800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@lactate/malate dehydrogenase, putative, expressed K00025: malate dehydrogenase


Gene co-expression network
sample Sobic009G106300 Sobic009G106300 Sobic004G087900 Sobic004G087900 Sobic009G106300--Sobic004G087900 Sobic003G017300 Sobic003G017300 Sobic009G106300--Sobic003G017300 Sobic006G269300 Sobic006G269300 Sobic009G106300--Sobic006G269300 Sobic009G005750 Sobic009G005750 Sobic009G106300--Sobic009G005750 Sobic006G260101 Sobic006G260101 Sobic009G106300--Sobic006G260101 Sobic003G315900 Sobic003G315900 Sobic009G106300--Sobic003G315900 Sobic002G359200 Sobic002G359200 Sobic009G106300--Sobic002G359200 Sobic009G054200 Sobic009G054200 Sobic009G106300--Sobic009G054200 Sobic001G061000 Sobic001G061000 Sobic009G106300--Sobic001G061000 Sobic004G087900--Sobic003G315900 Sobic004G087900--Sobic009G106300 Sobic004G087900--Sobic009G005750 Sobic010G251800 Sobic010G251800 Sobic004G087900--Sobic010G251800 Sobic001G227601 Sobic001G227601 Sobic004G087900--Sobic001G227601 Sobic006G019000 Sobic006G019000 Sobic004G087900--Sobic006G019000 Sobic002G295550 Sobic002G295550 Sobic004G087900--Sobic002G295550 Sobic003G232200 Sobic003G232200 Sobic004G087900--Sobic003G232200 Sobic004G087900--Sobic003G017300 Sobic003G017300--Sobic009G054200 Sobic003G017300--Sobic006G269300 Sobic003G017300--Sobic009G106300 Sobic001G410300 Sobic001G410300 Sobic003G017300--Sobic001G410300 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic003G017300--Sobic009G181900 Sobic003G017300--Sobic006G260101 Sobic006G170800 Sobic006G170800 Sobic003G017300--Sobic006G170800 Sobic003G017300--Sobic009G005750 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic003G017300--Sobic003G159400 Sobic006G269300--Sobic003G017300 Sobic001G456650 Sobic001G456650 Sobic006G269300--Sobic001G456650 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic006G269300--Sobic009G114900 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic006G269300--Sobic002G252700 Sobic006G269300--Sobic009G106300 Sobic001G033200 Sobic001G033200 Sobic006G269300--Sobic001G033200 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic006G269300--Sobic001G068901 Sobic006G269300--Sobic009G005750 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic006G269300--Sobic007G061500 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic009G005750--Sobic002G375600 Sobic009G005750--Sobic004G087900 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic009G005750--Sobic005G230600 Sobic009G005750--Sobic006G269300 Sobic007G031000 Sobic007G031000 Sobic009G005750--Sobic007G031000 Sobic009G005750--Sobic001G227601 Sobic009G005750--Sobic009G106300 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic009G005750--Sobic002G429200 Sobic009G005750--Sobic002G295550 Sobic010G278400 Sobic010G278400 Sobic006G260101--Sobic010G278400 Sobic004G205400 Sobic004G205400 Sobic006G260101--Sobic004G205400 Sobic005G145700 Sobic005G145700 Sobic006G260101--Sobic005G145700 Sobic004G162600 Sobic004G162600 Sobic006G260101--Sobic004G162600 Sobic006G260101--Sobic009G106300 Sobic009G187900 Sobic009G187900 Sobic006G260101--Sobic009G187900 Sobic006G260101--Sobic003G017300 Sobic001G087500 Sobic001G087500 Sobic006G260101--Sobic001G087500 Sobic006G260101--Sobic002G359200 Sobic003G315900--Sobic004G087900 Sobic003G315900--Sobic010G251800 Sobic003G315900--Sobic001G227601 Sobic003G315900--Sobic009G106300 Sobic003G315900--Sobic006G019000 Sobic003G315900--Sobic003G232200 Sobic003G315900--Sobic009G005750 Sobic003G315900--Sobic002G295550 Sobic006G153550 Sobic006G153550 Sobic003G315900--Sobic006G153550 Sobic003G406240 Sobic003G406240 Sobic002G359200--Sobic003G406240 Sobic001G523300 Sobic001G523300 Sobic002G359200--Sobic001G523300 Sobic002G359200--Sobic004G205400 Sobic004G011201 Sobic004G011201 Sobic002G359200--Sobic004G011201 Sobic002G396900 Sobic002G396900 Sobic002G359200--Sobic002G396900 Sobic005G002500 Sobic005G002500 Sobic002G359200--Sobic005G002500 Sobic001G308450 Sobic001G308450 Sobic002G359200--Sobic001G308450 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic002G359200--Sobic001G537600 Sobic006G037000 Sobic006G037000 Sobic002G359200--Sobic006G037000 Sobic009G054200--Sobic003G017300 Sobic009G054200--Sobic006G269300 Sobic009G054200--Sobic009G106300 Sobic009G054200--Sobic003G159400 Sobic001G391800 Sobic001G391800 Sobic009G054200--Sobic001G391800 Sobic010G220100 Sobic010G220100 Sobic009G054200--Sobic010G220100 Sobic009G054200--Sobic006G260101 Sobic002G118400 Sobic002G118400 Sobic009G054200--Sobic002G118400 Sobic009G054200--Sobic009G181900 Sobic001G061000--Sobic002G118400 Sobic004G045200 Sobic004G045200 Sobic001G061000--Sobic004G045200 Sobic007G200200 Sobic007G200200 Sobic001G061000--Sobic007G200200 Sobic001G061000--Sobic001G456650 Sobic001G061000--Sobic001G033200 Sobic002G314950 Sobic002G314950 Sobic001G061000--Sobic002G314950 Sobic001G361750 Sobic001G361750 Sobic001G061000--Sobic001G361750 Sobic002G320700 Sobic002G320700 Sobic001G061000--Sobic002G320700 Sobic001G061000--Sobic001G068901
Octagon: transcription factors


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