Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G269300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PP47
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G017300 CTP synthase, putative, expressed K01937: pyrG, CTP synthase
2 Sobic.001G456650 - K13066: E2.1.1.68, caffeic acid 3-O-methyltransferase
3 Sobic.009G114900 - -
4 Sobic.002G252700 vignain precursor, putative, expressed -
5 Sobic.009G106300 - -
6 Sobic.001G033200 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G068901 - -
8 Sobic.009G005750 - -
9 Sobic.007G061500 double-strand break repair protein MRE11, putative, expressed K10865: double-strand break repair protein MRE11
10 Sobic.001G361750 - -
11 Sobic.004G314100 GS9(Ortholog in rice:Zhao et al.(2018))(PubMedID : 31659890)@expressed protein -
12 Sobic.006G093400 potassium channel SKOR, putative, expressed -
13 Sobic.006G065200 SAM domain family protein, expressed -
14 Sobic.010G021401 - -
15 Sobic.005G155001 - -
16 Sobic.001G071700 protein kinase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G350800 - -
18 Sobic.002G320700 expressed protein -
19 Sobic.006G121200 high affinity nitrate transporter, putative, expressed -
20 Sobic.008G185000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G269300 Sobic006G269300 Sobic003G017300 Sobic003G017300 Sobic006G269300--Sobic003G017300 Sobic001G456650 Sobic001G456650 Sobic006G269300--Sobic001G456650 Sobic009G114900 Sobic009G114900 Sobic006G269300--Sobic009G114900 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic006G269300--Sobic002G252700 Sobic009G106300 Sobic009G106300 Sobic006G269300--Sobic009G106300 Sobic001G033200 Sobic001G033200 Sobic006G269300--Sobic001G033200 Sobic001G068901 Sobic001G068901 Sobic006G269300--Sobic001G068901 Sobic009G005750 Sobic009G005750 Sobic006G269300--Sobic009G005750 Sobic007G061500 Sobic007G061500 Sobic006G269300--Sobic007G061500 Sobic009G054200 Sobic009G054200 Sobic003G017300--Sobic009G054200 Sobic003G017300--Sobic006G269300 Sobic003G017300--Sobic009G106300 Sobic001G410300 Sobic001G410300 Sobic003G017300--Sobic001G410300 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic003G017300--Sobic009G181900 Sobic006G260101 Sobic006G260101 Sobic003G017300--Sobic006G260101 Sobic006G170800 Sobic006G170800 Sobic003G017300--Sobic006G170800 Sobic003G017300--Sobic009G005750 Sobic003G159400 Sobic003G159400 Sobic003G017300--Sobic003G159400 Sobic007G200200 Sobic007G200200 Sobic001G456650--Sobic007G200200 Sobic007G165200 Sobic007G165200 Sobic001G456650--Sobic007G165200 Sobic001G361750 Sobic001G361750 Sobic001G456650--Sobic001G361750 Sobic001G456650--Sobic001G068901 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic001G456650--Sobic006G093400 Sobic001G061000 Sobic001G061000 Sobic001G456650--Sobic001G061000 Sobic001G456650--Sobic001G033200 Sobic009G072400 Sobic009G072400 Sobic001G456650--Sobic009G072400 Sobic006G232300 Sobic006G232300 Sobic001G456650--Sobic006G232300 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic009G114900--Sobic005G155001 Sobic010G021401 Sobic010G021401 Sobic009G114900--Sobic010G021401 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic009G114900--Sobic007G090406 Sobic009G114900--Sobic002G252700 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic009G114900--Sobic009G004500 Sobic009G114900--Sobic006G093400 Sobic008G192800 Sobic008G192800 Sobic009G114900--Sobic008G192800 Sobic001G527900 Sobic001G527900 Sobic009G114900--Sobic001G527900 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic009G114900--Sobic001G483200 Sobic002G252700--Sobic009G114900 Sobic002G252700--Sobic010G021401 Sobic002G252700--Sobic006G093400 Sobic002G252700--Sobic005G155001 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic002G252700--Sobic008G185000 Sobic002G252700--Sobic008G192800 Sobic002G252700--Sobic009G004500 Sobic008G096900 Sobic008G096900 Sobic002G252700--Sobic008G096900 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic002G252700--Sobic010G257300 Sobic004G087900 Sobic004G087900 Sobic009G106300--Sobic004G087900 Sobic009G106300--Sobic003G017300 Sobic009G106300--Sobic006G269300 Sobic009G106300--Sobic009G005750 Sobic009G106300--Sobic006G260101 Sobic003G315900 Sobic003G315900 Sobic009G106300--Sobic003G315900 Sobic002G359200 Sobic002G359200 Sobic009G106300--Sobic002G359200 Sobic009G106300--Sobic009G054200 Sobic009G106300--Sobic001G061000 Sobic002G320700 Sobic002G320700 Sobic001G033200--Sobic002G320700 Sobic001G033200--Sobic001G361750 Sobic001G071700 Sobic001G071700 Sobic001G033200--Sobic001G071700 Sobic004G231501 Sobic004G231501 Sobic001G033200--Sobic004G231501 Sobic001G033200--Sobic001G483200 Sobic001G028500 Sobic001G028500 Sobic001G033200--Sobic001G028500 Sobic001G033200--Sobic007G061500 Sobic001G033200--Sobic001G456650 Sobic004G202750 Sobic004G202750 Sobic001G033200--Sobic004G202750 Sobic001G537600 Sobic001G537600 Sobic001G068901--Sobic001G537600 Sobic010G242100 Sobic010G242100 Sobic001G068901--Sobic010G242100 Sobic001G068901--Sobic006G093400 Sobic001G068901--Sobic009G072400 Sobic001G068901--Sobic010G257300 Sobic010G253700 Sobic010G253700 Sobic001G068901--Sobic010G253700 Sobic004G012100 Sobic004G012100 Sobic001G068901--Sobic004G012100 Sobic010G106400 Sobic010G106400 Sobic001G068901--Sobic010G106400 Sobic001G308450 Sobic001G308450 Sobic001G068901--Sobic001G308450 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic009G005750--Sobic002G375600 Sobic009G005750--Sobic004G087900 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic009G005750--Sobic005G230600 Sobic009G005750--Sobic006G269300 Sobic007G031000 Sobic007G031000 Sobic009G005750--Sobic007G031000 Sobic001G227601 Sobic001G227601 Sobic009G005750--Sobic001G227601 Sobic009G005750--Sobic009G106300 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic009G005750--Sobic002G429200 Sobic002G295550 Sobic002G295550 Sobic009G005750--Sobic002G295550 Sobic007G061500--Sobic004G231501 Sobic007G061500--Sobic001G028500 Sobic004G314100 Sobic004G314100 Sobic007G061500--Sobic004G314100 Sobic007G061500--Sobic009G004500 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic007G061500--Sobic007G017300 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic007G061500--Sobic001G368000 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic007G061500--Sobic003G093500 Sobic003G106100 Sobic003G106100 Sobic007G061500--Sobic003G106100 Sobic007G061500--Sobic001G483200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.