Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G087500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QHZ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G278400 coiled-coil domain-containing protein 12, putative, expressed K12871: coiled-coil domain-containing protein 12
2 Sobic.004G205400 - -
3 Sobic.009G187900 ethylene-responsive protein related, putative, expressed -
4 Sobic.010G118600 sodium/potassium/calcium exchanger 1, putative, expressed -
5 Sobic.005G116601 - -
6 Sobic.007G114650 - -
7 Sobic.010G060701 - K07964: heparanase
8 Sobic.009G181900 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
9 Sobic.010G118401 - -
10 Sobic.006G260101 - -
11 Sobic.010G242000 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
12 Sobic.005G038700 transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
13 Sobic.002G399000 expressed protein -
14 Sobic.003G250340 - K07976: Rab family, other
15 Sobic.002G387000 expressed protein -
16 Sobic.008G185000 - -
17 Sobic.004G162600 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
18 Sobic.001G490600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G202750 - -
20 Sobic.004G244500 dynamin, putative, expressed K01528: dynamin 1/3


Gene co-expression network
sample Sobic001G087500 Sobic001G087500 Sobic010G278400 Sobic010G278400 Sobic001G087500--Sobic010G278400 Sobic004G205400 Sobic004G205400 Sobic001G087500--Sobic004G205400 Sobic009G187900 Sobic009G187900 Sobic001G087500--Sobic009G187900 Sobic010G118600 Sobic010G118600 Sobic001G087500--Sobic010G118600 Sobic005G116601 Sobic005G116601 Sobic001G087500--Sobic005G116601 Sobic007G114650 Sobic007G114650 Sobic001G087500--Sobic007G114650 Sobic010G060701 Sobic010G060701 Sobic001G087500--Sobic010G060701 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic001G087500--Sobic009G181900 Sobic010G118401 Sobic010G118401 Sobic001G087500--Sobic010G118401 Sobic006G260101 Sobic006G260101 Sobic010G278400--Sobic006G260101 Sobic010G278400--Sobic007G114650 Sobic010G278400--Sobic001G087500 Sobic004G202750 Sobic004G202750 Sobic010G278400--Sobic004G202750 Sobic005G145700 Sobic005G145700 Sobic010G278400--Sobic005G145700 Sobic006G170800 Sobic006G170800 Sobic010G278400--Sobic006G170800 Sobic010G278400--Sobic009G181900 Sobic010G278400--Sobic010G118401 Sobic010G278400--Sobic009G187900 Sobic004G205400--Sobic006G260101 Sobic004G205400--Sobic005G116601 Sobic004G205400--Sobic001G087500 Sobic004G162600 Sobic004G162600 Sobic004G205400--Sobic004G162600 Sobic004G205400--Sobic010G060701 Sobic002G359200 Sobic002G359200 Sobic004G205400--Sobic002G359200 Sobic004G205400--Sobic010G278400 Sobic003G406240 Sobic003G406240 Sobic004G205400--Sobic003G406240 Sobic001G523300 Sobic001G523300 Sobic004G205400--Sobic001G523300 Sobic009G187900--Sobic004G162600 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic009G187900--Sobic003G250340 Sobic009G187900--Sobic001G087500 Sobic005G038700 Sobic005G038700 Sobic009G187900--Sobic005G038700 Sobic009G187900--Sobic010G278400 Sobic004G244500 Sobic004G244500 Sobic009G187900--Sobic004G244500 Sobic009G187900--Sobic006G260101 Sobic002G334900 Sobic002G334900 Sobic009G187900--Sobic002G334900 Sobic009G187900--Sobic004G205400 Sobic010G118600--Sobic005G116601 Sobic010G118600--Sobic003G250340 Sobic010G196200 Sobic010G196200 Sobic010G118600--Sobic010G196200 Sobic002G350800 Sobic002G350800 Sobic010G118600--Sobic002G350800 Sobic010G118600--Sobic005G038700 Sobic002G035100 Sobic002G035100 Sobic010G118600--Sobic002G035100 Sobic010G118600--Sobic001G087500 Sobic010G068001 Sobic010G068001 Sobic010G118600--Sobic010G068001 Sobic003G130650 Sobic003G130650 Sobic010G118600--Sobic003G130650 Sobic005G116601--Sobic010G118600 Sobic005G116601--Sobic004G205400 Sobic005G116601--Sobic001G087500 Sobic005G116601--Sobic003G250340 Sobic005G116601--Sobic004G162600 Sobic005G116601--Sobic003G130650 Sobic005G116601--Sobic010G196200 Sobic005G116601--Sobic002G035100 Sobic005G116601--Sobic005G038700 Sobic007G114650--Sobic010G278400 Sobic010G242000 Sobic010G242000 Sobic007G114650--Sobic010G242000 Sobic008G134500 Sobic008G134500 Sobic007G114650--Sobic008G134500 Sobic007G114650--Sobic009G181900 Sobic005G025400 Sobic005G025400 Sobic007G114650--Sobic005G025400 Sobic007G114650--Sobic003G250340 Sobic003G440500 Sobic003G440500 Sobic007G114650--Sobic003G440500 Sobic007G114650--Sobic003G130650 Sobic007G114650--Sobic001G087500 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic010G060701--Sobic008G185000 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic010G060701--Sobic001G490600 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic010G060701--Sobic009G170301 Sobic006G093400 Sobic006G093400 Sobic010G060701--Sobic006G093400 Sobic002G252700 Sobic002G252700 Sobic010G060701--Sobic002G252700 Sobic010G257300 Sobic010G257300 Sobic010G060701--Sobic010G257300 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic010G060701--Sobic001G400101 Sobic010G060701--Sobic004G205400 Sobic004G015500 Sobic004G015500 Sobic010G060701--Sobic004G015500 Sobic002G399000 Sobic002G399000 Sobic009G181900--Sobic002G399000 Sobic009G181900--Sobic007G114650 Sobic009G112500 Sobic009G112500 Sobic009G181900--Sobic009G112500 Sobic009G181900--Sobic003G440500 Sobic003G262500 Sobic003G262500 Sobic009G181900--Sobic003G262500 Sobic009G181900--Sobic005G025400 Sobic001G410300 Sobic001G410300 Sobic009G181900--Sobic001G410300 Sobic009G181900--Sobic010G278400 Sobic001G350300 Sobic001G350300 Sobic009G181900--Sobic001G350300 Sobic010G118401--Sobic009G112500 Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic010G118401--Sobic002G387000 Sobic010G118401--Sobic004G202750 Sobic010G118401--Sobic010G278400 Sobic010G118401--Sobic010G242000 Sobic010G118401--Sobic007G114650 Sobic004G228000 Sobic004G228000 Sobic010G118401--Sobic004G228000 Sobic010G118401--Sobic001G087500 Sobic010G118401--Sobic002G399000
Octagon: transcription factors


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