Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G387000.2,Sobic.002G387000.1,Sobic.002G387000.3
Synonym Sb02g040330
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W7E9 , A0A1W0W7K7 , C5X384
Pfam PF09366
Panther DB PTHR34133 PTHR34133:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G39530 : Protein of unknown function (DUF1997)
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g43925.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048868
Brachypodium KQK15059 , KQK15060
Barley -
Wheat TraesCS2B02G180400 , TraesCS2D02G161200 , TraesCS2A02G155300
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G387000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic007G189900 Sobic007G189900 Sobic002G387000--Sobic007G189900 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic002G387000--Sobic001G312801 Sobic010G118401 Sobic010G118401 Sobic002G387000--Sobic010G118401 Sobic009G112500 Sobic009G112500 Sobic002G387000--Sobic009G112500 Sobic003G301950 Sobic003G301950 Sobic002G387000--Sobic003G301950 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic002G387000--Sobic001G490600 Sobic009G181900 Sobic009G181900 Sobic002G387000--Sobic009G181900 Sobic001G507700 Sobic001G507700 Sobic002G387000--Sobic001G507700 Sobic009G147600 Sobic009G147600 Sobic002G387000--Sobic009G147600 Sobic007G189900--Sobic002G387000 Sobic007G189900--Sobic001G312801 Sobic010G105900 Sobic010G105900 Sobic007G189900--Sobic010G105900 Sobic007G189900--Sobic009G181900 Sobic004G310400 Sobic004G310400 Sobic007G189900--Sobic004G310400 Sobic004G257900 Sobic004G257900 Sobic007G189900--Sobic004G257900 Sobic010G043700 Sobic010G043700 Sobic007G189900--Sobic010G043700 Sobic007G189900--Sobic003G301950 Sobic003G262500 Sobic003G262500 Sobic007G189900--Sobic003G262500 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic001G312801--Sobic004G288900 Sobic001G312801--Sobic001G490600 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic001G312801--Sobic001G368000 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic001G312801--Sobic009G184500 Sobic004G190800 Sobic004G190800 Sobic001G312801--Sobic004G190800 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic001G312801--Sobic007G017300 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic001G312801--Sobic009G170301 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic001G312801--Sobic008G096300 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic001G312801--Sobic002G138200 Sobic010G118401--Sobic009G112500 Sobic010G118401--Sobic002G387000 Sobic004G202750 Sobic004G202750 Sobic010G118401--Sobic004G202750 Sobic010G278400 Sobic010G278400 Sobic010G118401--Sobic010G278400 Sobic010G242000 Sobic010G242000 Sobic010G118401--Sobic010G242000 Sobic007G114650 Sobic007G114650 Sobic010G118401--Sobic007G114650 Sobic004G228000 Sobic004G228000 Sobic010G118401--Sobic004G228000 Sobic001G087500 Sobic001G087500 Sobic010G118401--Sobic001G087500 Sobic002G399000 Sobic002G399000 Sobic010G118401--Sobic002G399000 Sobic009G112500--Sobic010G118401 Sobic004G327200 Sobic004G327200 Sobic009G112500--Sobic004G327200 Sobic009G112500--Sobic002G399000 Sobic009G112500--Sobic009G181900 Sobic009G112500--Sobic002G387000 Sobic006G249600 Sobic006G249600 Sobic009G112500--Sobic006G249600 Sobic005G014400 Sobic005G014400 Sobic009G112500--Sobic005G014400 Sobic003G251900 Sobic003G251900 Sobic009G112500--Sobic003G251900 Sobic005G025400 Sobic005G025400 Sobic009G112500--Sobic005G025400 Sobic001G082700 Sobic001G082700 Sobic003G301950--Sobic001G082700 Sobic003G301950--Sobic002G387000 Sobic003G030200 Sobic003G030200 Sobic003G301950--Sobic003G030200 Sobic002G197400 Sobic002G197400 Sobic003G301950--Sobic002G197400 Sobic003G301950--Sobic009G147600 Sobic003G301950--Sobic007G189900 Sobic004G091300 Sobic004G091300 Sobic003G301950--Sobic004G091300 Sobic003G301950--Sobic001G312801 Sobic003G276400 Sobic003G276400 Sobic003G301950--Sobic003G276400 Sobic001G490600--Sobic009G184500 Sobic001G490600--Sobic001G368000 Sobic001G490600--Sobic007G017300 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic001G490600--Sobic009G004500 Sobic001G490600--Sobic001G312801 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic001G490600--Sobic008G185000 Sobic001G490600--Sobic009G170301 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic001G490600--Sobic001G483200 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic001G490600--Sobic005G155001 Sobic009G181900--Sobic002G399000 Sobic009G181900--Sobic007G114650 Sobic009G181900--Sobic009G112500 Sobic003G440500 Sobic003G440500 Sobic009G181900--Sobic003G440500 Sobic009G181900--Sobic003G262500 Sobic009G181900--Sobic005G025400 Sobic001G410300 Sobic001G410300 Sobic009G181900--Sobic001G410300 Sobic009G181900--Sobic010G278400 Sobic001G350300 Sobic001G350300 Sobic009G181900--Sobic001G350300 Sobic004G306700 Sobic004G306700 Sobic001G507700--Sobic004G306700 Sobic006G082100 Sobic006G082100 Sobic001G507700--Sobic006G082100 Sobic001G507700--Sobic002G387000 Sobic001G212800 Sobic001G212800 Sobic001G507700--Sobic001G212800 Sobic009G064832 Sobic009G064832 Sobic001G507700--Sobic009G064832 Sobic009G211600 Sobic009G211600 Sobic001G507700--Sobic009G211600 Sobic001G507700--Sobic007G189900 Sobic001G507700--Sobic010G105900 Sobic001G096200 Sobic001G096200 Sobic001G507700--Sobic001G096200 Sobic009G147600--Sobic004G202750 Sobic001G028500 Sobic001G028500 Sobic009G147600--Sobic001G028500 Sobic009G147600--Sobic001G312801 Sobic004G149000 Sobic004G149000 Sobic009G147600--Sobic004G149000 Sobic002G320700 Sobic002G320700 Sobic009G147600--Sobic002G320700 Sobic001G104100 Sobic001G104100 Sobic009G147600--Sobic001G104100 Sobic009G147600--Sobic003G030200 Sobic009G147600--Sobic005G025400 Sobic009G147600--Sobic004G190800
Octagon: transcription factors


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